Multi-Omics-baseret forudsigelse af allotransplantatdysfunktion efter lunge transplantation

ALAD opstår primært i den tidlige post-transplantationsperiode. Dette projekt har til formål at etablere en systematisk ramme for overvågning og forudsigelse af post-lunge transplantation dysfunktion, med et specifikt fokus på akut lunge allograft dysfunktion (ALAD) og dens progression til kronisk lunge allograft dysfunktion (CLAD). Vi planlægger at gennemføre en prospektiv, multicentrisk klinisk kohortestudie, hvor vi longitudinelt indsamler perifert blod og bronchoalveolært lavagevæske (BALF) prøver fra transplantationsmodtagere på forskellige tidspunkter. Ved at integrere multi-omics teknologier - herunder cfDNA fragmentomik, perifert blod enkeltcelle sekventering og proteomisk massespektrometri - med lungefunktion (FEV1) og klinisk-patologiske data, søger vi at kortlægge det dynamiske landskab af post-lunge transplantation dysfunktion. Sammenlignet med tidligere studier, der baserede sig på enkelte indikatorer eller engangsmålinger, adskiller dette projekt sig ved flere nøgletræk: For det første brugen af cfDNA fragmentomiske karakteristika til at udlede vævsoprindelse, hvilket muliggør højt specifik detektion af graft-skade uden behov for donor genotypeinformation. For det andet integrationen af enkeltcelle transkriptomik til omfattende analyse af dynamikken i perifre immuncelleundersæt, hvilket giver et grundlag for tidlig immunologisk advarsel om dysfunktion. For det tredje anvendelsen af proteomik til at afsløre ekspressionsniveauer, post-translationelle modifikationer og protein-protein interaktioner i plasmaprøver. For det fjerde konstruktionen af en multidimensionel integreret model, der inkorporerer blod, BALF og lungefunktionsdata, med målet om at etablere et generaliserbart advarselssystem. Gennem denne forskning sigter vi ikke kun mod at forbedre den tidlige identifikation og intervention af ALAD, men også at lægge grundlaget for at belyse de molekylære mekanismer, der ligger til grund for CLAD-udvikling, og udforske potentielle terapeutiske mål.