Predizione Basata su Multi-Omica della Disfunzione dell'Allotrapianto dopo il Trapianto di Polmone

L'ALAD si manifesta prevalentemente nel periodo iniziale post-trapianto. Questo progetto mira a stabilire una struttura sistematica per il monitoraggio e la previsione della disfunzione polmonare post-trapianto, con un focus specifico sulla disfunzione acuta dell'innesto polmonare (ALAD) e la sua progressione verso la disfunzione cronica dell'innesto polmonare (CLAD). Pianifichiamo di condurre uno studio di coorte clinico prospettico e multicentrico, raccogliendo longitudinalmente campioni di sangue periferico e liquido di lavaggio broncoalveolare (BALF) da riceventi di trapianto in vari momenti temporali. Integrando tecnologie multi-omiche - incluse frammentomica del cfDNA, sequenziamento a singola cellula del sangue periferico e spettrometria di massa proteomica - con dati di funzionalità polmonare (FEV1) e clinico-patologici, cerchiamo di delineare il panorama dinamico della disfunzione polmonare post-trapianto. Rispetto a studi precedenti che si basavano su indicatori singoli o misurazioni una tantum, questo progetto si distingue per diverse caratteristiche chiave: In primo luogo, l'utilizzo di caratteristiche frammentomiche del cfDNA per inferire l'origine tissutale, consentendo il rilevamento altamente specifico del danno dell'innesto senza richiedere informazioni sul genotipo del donatore. In secondo luogo, l'integrazione della trascrittomica a singola cellula per analizzare in modo completo la dinamica dei sottogruppi di cellule immunitarie periferiche, fornendo una base per l'allerta immunologica precoce della disfunzione. In terzo luogo, l'applicazione della proteomica per rivelare i livelli di espressione, le modificazioni post-traduzionali e le interazioni proteina-proteina nei campioni plasmatici. In quarto luogo, la costruzione di un modello integrato multidimensionale che incorpora dati ematici, BALF e di funzionalità polmonare, con l'obiettivo di stabilire un sistema di allerta precoce generalizzabile. Attraverso questa ricerca, miriamo non solo a migliorare l'identificazione precoce e l'intervento dell'ALAD, ma anche a gettare le basi per elucidare i meccanismi molecolari sottostanti lo sviluppo della CLAD ed esplorare potenziali bersagli terapeutici.