Multi-Omics-basert prediksjon av allotransplantatdysfunksjon etter lunge transplantation

ALAD forekommer hovedsakelig i den tidlige perioden etter transplantasjon. Dette prosjektet har som mål å etablere et systematisk rammeverk for overvåking og prediksjon av dysfunksjon etter lunge-transplantasjon, med spesielt fokus på akutt lunge-allograft-dysfunksjon (ALAD) og dens progresjon til kronisk lunge-allograft-dysfunksjon (CLAD). Vi planlegger å gjennomføre en prospektiv, multikenter klinisk kohortstudie, der vi longitudinelt samler perifert blod og bronkoalveolært lavasjevæske (BALF) prøver fra transplantasjonsmottakere på ulike tidspunkter. Ved å integrere multi-omics-teknologier - inkludert cfDNA-fragmentomikk, perifert blod enkeltcelle-sekvensering og proteomisk massespektrometri - med lungefunksjon (FEV1) og klinisk-patologiske data, søker vi å kartlegge det dynamiske landskapet av dysfunksjon etter lunge-transplantasjon. Sammenlignet med tidligere studier som stolte på enkle indikatorer eller engangsmålinger, skiller dette prosjektet seg ut ved flere nøkkelegenskaper: For det første, bruken av cfDNA-fragmentomiske egenskaper for å utlede vevsoriginen, noe som muliggjør svært spesifikk deteksjon av transplantat-skade uten å kreve donor-genotypeinformasjon. For det andre, integreringen av enkeltcelle-transkriptomikk for å omfattende analysere dynamikken til perifere immuncelle-subset, og dermed gi et grunnlag for tidlig immunologisk advarsel om dysfunksjon. For det tredje, anvendelsen av proteomikk for å avsløre ekspresjonsnivåer, post-translasjonelle modifikasjoner og protein-protein-interaksjoner i plasmaprøver. For det fjerde, konstruksjonen av en flerdimensjonal integrert modell som inkorporerer blod-, BALF- og lungefunksjonsdata, med målet om å etablere et generaliserbart tidligvarslingssystem. Gjennom denne forskningen har vi som mål ikke bare å forbedre den tidlige identifikasjonen og intervensjonen av ALAD, men også å legge grunnlaget for å belyse de molekylære mekanismene som ligger til grunn for CLAD-utvikling og utforske potensielle terapeutiske mål.