Prédiction basée sur la multi-omique de la dysfonction de l'allogreffe après transplantation pulmonaire

L'ALAD survient principalement dans la période post-transplantation précoce. Ce projet vise à établir un cadre systématique pour la surveillance et la prédiction de la dysfonction pulmonaire post-transplantation, avec un accent spécifique sur la dysfonction aiguë du greffon pulmonaire (ALAD) et sa progression vers la dysfonction chronique du greffon pulmonaire (CLAD). Nous prévoyons de mener une étude de cohorte clinique prospective multicentrique, en collectant longitudinalement des échantillons de sang périphérique et de liquide de lavage broncho-alvéolaire (BALF) chez les receveurs de transplantation à différents moments. En intégrant les technologies multi-omiques - y compris la fragmentomique de l'ADNc fœtal, le séquençage unicellulaire du sang périphérique et la spectrométrie de masse protéomique - avec les données de fonction pulmonaire (FEV1) et les données clinicopathologiques, nous cherchons à délimiter le paysage dynamique de la dysfonction pulmonaire post-transplantation. Comparé aux études antérieures qui reposaient sur des indicateurs uniques ou des mesures ponctuelles, ce projet se distingue par plusieurs caractéristiques clés : Premièrement, l'utilisation des caractéristiques fragmentomiques de l'ADNc fœtal pour déduire l'origine tissulaire, permettant une détection hautement spécifique des lésions du greffon sans nécessiter d'informations sur le génotype du donneur. Deuxièmement, l'intégration de la transcriptomique unicellulaire pour analyser de manière exhaustive la dynamique des sous-ensembles de cellules immunitaires périphériques, fournissant une base pour une alerte immunologique précoce de la dysfonction. Troisièmement, l'application de la protéomique pour révéler les niveaux d'expression, les modifications post-traductionnelles et les interactions protéine-protéine dans les échantillons de plasma. Quatrièmement, la construction d'un modèle intégré multidimensionnel incorporant les données sanguines, du BALF et de la fonction pulmonaire, dans le but d'établir un système d'alerte précoce généralisable. À travers cette recherche, nous visons non seulement à améliorer l'identification précoce et l'intervention de l'ALAD, mais aussi à jeter les bases pour élucider les mécanismes moléculaires sous-jacents au développement de la CLAD et explorer des cibles thérapeutiques potentielles.