Wieloomikowe prognozowanie dysfunkcji alloprzeszczepu po transplantacji płuc

ALAD występuje głównie we wczesnym okresie po przeszczepie. Ten projekt ma na celu stworzenie systematycznych ram monitorowania i przewidywania dysfunkcji po przeszczepie płuca, ze szczególnym uwzględnieniem ostrej dysfunkcji alloprzeszczepu płuca (ALAD) i jej progresji do przewlekłej dysfunkcji alloprzeszczepu płuca (CLAD). Planujemy przeprowadzenie prospektywnego, wieloośrodkowego badania kohortowego, z długoterminowym zbieraniem próbek krwi obwodowej i płynu z płukania oskrzelowo-pęcherzykowego (BALF) od biorców przeszczepu w różnych punktach czasowych. Integrując technologie wieloomikowe – w tym fragmentomikę cfDNA, sekwencjonowanie pojedynczych komórek krwi obwodowej i spektrometrię mas w proteomice – z danymi czynnościowymi płuc (FEV1) oraz kliniczno-patologicznymi, dążymy do określenia dynamicznego krajobrazu dysfunkcji po przeszczepie płuca. W porównaniu z poprzednimi badaniami opartymi na pojedynczych wskaźnikach lub jednorazowych pomiarach, ten projekt wyróżnia się kilkoma kluczowymi cechami: Po pierwsze, wykorzystanie cech fragmentomicznych cfDNA do wnioskowania o pochodzeniu tkankowym, umożliwiając wysoce specyficzne wykrywanie uszkodzenia przeszczepu bez konieczności posiadania informacji o genotypie dawcy. Po drugie, integracja transkryptomiki pojedynczych komórek do kompleksowej analizy dynamiki podzbiorów komórek immunologicznych krwi obwodowej, dostarczając podstawy do wczesnego ostrzegania immunologicznego przed dysfunkcją. Po trzecie, zastosowanie proteomiki do ujawnienia poziomów ekspresji, potranslacyjnych modyfikacji i interakcji białko-białko w próbkach osocza. Po czwarte, budowa wielowymiarowego modelu zintegrowanego, obejmującego dane z krwi, BALF i czynności płuc, z celem stworzenia uniwersalnego systemu wczesnego ostrzegania. Poprzez to badanie dążymy nie tylko do poprawy wczesnej identyfikacji i interwencji w ALAD, ale także do położenia podstaw do wyjaśnienia molekularnych mechanizmów leżących u podstaw rozwoju CLAD i eksploracji potencjalnych celów terapeutycznych.