Molekylær analyse af prøver fra patienter med diffust intrinsisk pontinsk gliom og hjernestammegliom
Studieoversigt
Status
Status
Betingelser
Betingelser
Detaljeret beskrivelse
Undersøgelsestype
Undersøgelsestype
Tilmelding (Anslået)
Tilmelding
Kontakter og lokationer
Studiekontakt
Studiekontakt
- Navn: Javad Nazarian, PhD
- Telefonnummer: 202-476-6022
- E-mail: JNazarian@cnmc.org
Undersøgelse Kontakt Backup
- Navn: Caroline Kopsidas, BS
- Telefonnummer: 240-393-3359
- E-mail: ckopsidas@childrensnational.org
Studiesteder
-
-
District of Columbia
-
Washington, District of Columbia, Forenede Stater, 20010
- Rekruttering
- Children's National Medical Center
-
Underforsker:
- Roger Packer, MD
-
Ledende efterforsker:
- Javad Nazarian, PhD
-
Underforsker:
- Suresh Magge, MD
-
Underforsker:
- Amanda L Muhs, MD
-
-
Deltagelseskriterier
Berettigelseskriterier
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
Tager imod sunde frivillige
Prøveudtagningsmetode
Studiebefolkning
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
- Patienter i alle aldre med klinisk og radiologisk diagnose af diffust intrinsisk pontingliom
- Patienter med andre højgradige gliomer med oprindelse i hjernestammen
- Patienter med fokale gliomer (WHO grad I/II) i hjernestammen
Ekskluderingskriterier:
- Patienter med enhver form for infiltrativ lavgradig (WHO grad I og II) eller højgradig gliom (WHO grad III og IV) med oprindelse uden for hjernestammen
- Patienter med primære hjernestammetumorer med andre histologiske diagnoser (f.eks. PNET)
Studieplan
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
- Observationsmodeller: Kohorte
- Tidsperspektiver: Fremadrettet
Antal grupper/kohorter
Kohorter og interventioner
Gruppe / kohorteGruppe / kohorte |
|---|
|
Patientprøver
Friskfrosne og fikserede tumorprøver, tilsvarende normale hjernevævsprøver, cerebrospinalvæske, urin og serumprøver fra patienter, der er ramt af diffust iboende pontint gliom eller hjernestammegliom
|
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Genom-dækkende ekspressionsmønstre af RNA i tumorprøver, normalt hjernestammevæv og cerebrospinalvæske ved hjælp af Affymetrix-genekspressionsprofilering
Tidsramme: 5 år
|
Indsamlede tumor- og normale prøver vil potentielt blive brugt til RNA-genom-dækkende ekspressionsmønsterprofilering.
|
5 år
|
|
Validering af resultaterne af den genom-dækkende analyse
Tidsramme: 5 år
|
Den molekylære analyse udført på indsamlede prøver vil blive valideret gennem hele genomsekventering.
|
5 år
|
|
Proteomisk profilering af tumor, normalt hjernestammevæv og cerebrospinalvæske
Tidsramme: 5 år
|
For at opnå fuld karakterisering af indsamlede prøver, vil proteomisk profilering blive udført på tumor og normale prøver indsamlet.
|
5 år
|
|
Proteinekspressionsmønstre vurderet ved immunhistokemi og western blot sammenlignet med normalt hjernestammevæv
Tidsramme: 5 år
|
Indsamlede tumor- og normale prøver vil have immunkemien og western blot sammenlignet med at vurdere proteinekspressionsvariation.
|
5 år
|
|
Genom-dækkende analyse af tumorprøver og normalt hjernestammevæv
Tidsramme: 5 år
|
For at opnå fuld karakterisering af indsamlede prøver, vil hele genomsekventering blive udført på tumor og normale prøver indsamlet.
|
5 år
|
|
In vitro og in vivo molekylær analyse af indsamlede prøver
Tidsramme: 5 år
|
Indsamlede prøver vil potentielt blive brugt til in vitro-analyse og generering af dyremodeller af denne tumor.
|
5 år
|
Sekundære resultatmål
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Vurder aspekter forbundet med prøveanskaffelse, herunder potentielle fordele og ulemper
Tidsramme: 5 år
|
I et forsøg på at fortsætte med at trække viden fra indsamlede prøver, vil der løbende blive adgang til potentielle fordele og ulemper ved prøveanskaffelse.
|
5 år
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Sponsor
Sponsor
Efterforskere
Efterforskere
- Ledende efterforsker: Javad Nazarian, PhD, Children's National Research Institute
Publikationer og nyttige links
Generelle publikationer
- Becher OJ, Hambardzumyan D, Walker TR, Helmy K, Nazarian J, Albrecht S, Hiner RL, Gall S, Huse JT, Jabado N, MacDonald TJ, Holland EC. Preclinical evaluation of radiation and perifosine in a genetically and histologically accurate model of brainstem glioma. Cancer Res. 2010 Mar 15;70(6):2548-57. doi: 10.1158/0008-5472.CAN-09-2503. Epub 2010 Mar 2.
- Panditharatna E, Yaeger K, Kilburn LB, Packer RJ, Nazarian J. Clinicopathology of diffuse intrinsic pontine glioma and its redefined genomic and epigenomic landscape. Cancer Genet. 2015 Jul-Aug;208(7-8):367-73. doi: 10.1016/j.cancergen.2015.04.008. Epub 2015 May 1.
- Yadavilli S, Scafidi J, Becher OJ, Saratsis AM, Hiner RL, Kambhampati M, Mariarita S, MacDonald TJ, Codispoti KE, Magge SN, Jaiswal JK, Packer RJ, Nazarian J. The emerging role of NG2 in pediatric diffuse intrinsic pontine glioma. Oncotarget. 2015 May 20;6(14):12141-55. doi: 10.18632/oncotarget.3716.
- Kambhampati M, Perez JP, Yadavilli S, Saratsis AM, Hill AD, Ho CY, Panditharatna E, Markel M, Packer RJ, Nazarian J. A standardized autopsy procurement allows for the comprehensive study of DIPG biology. Oncotarget. 2015 May 20;6(14):12740-7. doi: 10.18632/oncotarget.3374.
- Kambhampati M, Panditharatna E, Yadavilli S, Saoud K, Lee S, Eze A, Almira-Suarez MI, Hancock L, Bonner ER, Gittens J, Stampar M, Gaonkar K, Resnick AC, Kline C, Ho CY, Waanders AJ, Georgescu MM, Rance NE, Kim Y, Johnson C, Rood BR, Kilburn LB, Hwang EI, Mueller S, Packer RJ, Bornhorst M, Nazarian J. Harmonization of postmortem donations for pediatric brain tumors and molecular characterization of diffuse midline gliomas. Sci Rep. 2020 Jul 2;10(1):10954. doi: 10.1038/s41598-020-67764-2.
- Ballester LY, Wang Z, Shandilya S, Miettinen M, Burger PC, Eberhart CG, Rodriguez FJ, Raabe E, Nazarian J, Warren K, Quezado MM. Morphologic characteristics and immunohistochemical profile of diffuse intrinsic pontine gliomas. Am J Surg Pathol. 2013 Sep;37(9):1357-64. doi: 10.1097/PAS.0b013e318294e817.
- Saratsis AM, Yadavilli S, Magge S, Rood BR, Perez J, Hill DA, Hwang E, Kilburn L, Packer RJ, Nazarian J. Insights into pediatric diffuse intrinsic pontine glioma through proteomic analysis of cerebrospinal fluid. Neuro Oncol. 2012 May;14(5):547-60. doi: 10.1093/neuonc/nos067. Epub 2012 Apr 5.
- Ahsan S, Raabe EH, Haffner MC, Vaghasia A, Warren KE, Quezado M, Ballester LY, Nazarian J, Eberhart CG, Rodriguez FJ. Increased 5-hydroxymethylcytosine and decreased 5-methylcytosine are indicators of global epigenetic dysregulation in diffuse intrinsic pontine glioma. Acta Neuropathol Commun. 2014 Jun 3;2:59. doi: 10.1186/2051-5960-2-59.
- Buczkowicz P, Hoeman C, Rakopoulos P, Pajovic S, Letourneau L, Dzamba M, Morrison A, Lewis P, Bouffet E, Bartels U, Zuccaro J, Agnihotri S, Ryall S, Barszczyk M, Chornenkyy Y, Bourgey M, Bourque G, Montpetit A, Cordero F, Castelo-Branco P, Mangerel J, Tabori U, Ho KC, Huang A, Taylor KR, Mackay A, Bendel AE, Nazarian J, Fangusaro JR, Karajannis MA, Zagzag D, Foreman NK, Donson A, Hegert JV, Smith A, Chan J, Lafay-Cousin L, Dunn S, Hukin J, Dunham C, Scheinemann K, Michaud J, Zelcer S, Ramsay D, Cain J, Brennan C, Souweidane MM, Jones C, Allis CD, Brudno M, Becher O, Hawkins C. Genomic analysis of diffuse intrinsic pontine gliomas identifies three molecular subgroups and recurrent activating ACVR1 mutations. Nat Genet. 2014 May;46(5):451-6. doi: 10.1038/ng.2936. Epub 2014 Apr 6.
- Nikbakht H, Panditharatna E, Mikael LG, Li R, Gayden T, Osmond M, Ho CY, Kambhampati M, Hwang EI, Faury D, Siu A, Papillon-Cavanagh S, Bechet D, Ligon KL, Ellezam B, Ingram WJ, Stinson C, Moore AS, Warren KE, Karamchandani J, Packer RJ, Jabado N, Majewski J, Nazarian J. Spatial and temporal homogeneity of driver mutations in diffuse intrinsic pontine glioma. Nat Commun. 2016 Apr 6;7:11185. doi: 10.1038/ncomms11185.
- Saratsis AM, Kambhampati M, Snyder K, Yadavilli S, Devaney JM, Harmon B, Hall J, Raabe EH, An P, Weingart M, Rood BR, Magge SN, MacDonald TJ, Packer RJ, Nazarian J. Comparative multidimensional molecular analyses of pediatric diffuse intrinsic pontine glioma reveals distinct molecular subtypes. Acta Neuropathol. 2014;127(6):881-95. doi: 10.1007/s00401-013-1218-2. Epub 2013 Dec 3. Erratum In: Acta Neuropathol. 2020 Aug;140(2):247. doi: 10.1007/s00401-020-02162-6.
Hjælpsomme links
Datoer for undersøgelser
Studer store datoer
Studiestart (Faktiske)
Studiestart
Primær færdiggørelse (Anslået)
Primær færdiggørelse
Studieafslutning (Anslået)
Studieafslutning
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
Først indsendt
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først opslået (Anslået)
Først opslået
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Faktiske)
Sidste opdatering sendt
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidst verificeret
Sidst verificeret
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Nøgleord
Yderligere relevante MeSH-vilkår
- Hjernesygdomme
- Sygdomme i centralnervesystemet
- Sygdomme i nervesystemet
- Neoplasmer efter histologisk type
- Neoplasmer
- Neoplasmer efter sted
- Neoplasmer, kirtel og epitel
- Neoplasmer, Neuroepithelial
- Neuroektodermale tumorer
- Neoplasmer, kimceller og embryonale
- Neoplasmer, nervevæv
- Neoplasmer i hjernen
- Neoplasmer i centralnervesystemet
- Neoplasmer i nervesystemet
- Neoplasmer i hjernestammen
- Infratentoriale neoplasmer
- Gliom
- Diffus Intrinsic Pontine Gliom
Andre undersøgelses-id-numre
Andre undersøgelses-id-numre
- DIPG-1
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .