Analisi molecolare di campioni di pazienti con glioma pontino intrinseco diffuso e glioma del tronco encefalico
Panoramica dello studio
Stato
Stato
Condizioni
Condizioni
Descrizione dettagliata
Tipo di studio
Tipo di studio
Iscrizione (Stimato)
Iscrizione
Contatti e Sedi
Contatto studio
Contatto studio
- Nome: Javad Nazarian, PhD
- Numero di telefono: 202-476-6022
- Email: JNazarian@cnmc.org
Backup dei contatti dello studio
- Nome: Caroline Kopsidas, BS
- Numero di telefono: 240-393-3359
- Email: ckopsidas@childrensnational.org
Luoghi di studio
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-
District of Columbia
-
Washington, District of Columbia, Stati Uniti, 20010
- Reclutamento
- Children's National Medical Center
-
Sub-investigatore:
- Roger Packer, MD
-
Investigatore principale:
- Javad Nazarian, PhD
-
Sub-investigatore:
- Suresh Magge, MD
-
Sub-investigatore:
- Amanda L Muhs, MD
-
-
Criteri di partecipazione
Criteri di ammissibilità
Criteri di ammissibilità
Età idonea allo studio
Accetta volontari sani
Metodo di campionamento
Popolazione di studio
Descrizione
Criterio di inclusione:
- Pazienti di qualsiasi età con diagnosi clinica e radiologica di glioma pontino intrinseco diffuso
- Pazienti con altri gliomi di alto grado originati nel tronco encefalico
- Pazienti con gliomi focali (WHO grado I/II) del tronco encefalico
Criteri di esclusione:
- Pazienti con qualsiasi tipo di glioma infiltrativo di basso grado (grado I e II dell'OMS) o di alto grado (grado III e IV dell'OMS) originato al di fuori del tronco encefalico
- Pazienti con tumori primari del tronco encefalico con altre diagnosi istologiche (ad es. PNET)
Piano di studio
Come è strutturato lo studio?
Dettagli di progettazione
- Modelli osservazionali: Coorte
- Prospettive temporali: Prospettiva
Numero di gruppi/coorti
Coorti e interventi
Gruppo / CoorteGruppo / Coorte |
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Campioni pazienti
Campioni tumorali freschi congelati e fissi, corrispondenti campioni di tessuto cerebrale normale, liquido cerebrospinale, urine e campioni di siero di pazienti affetti da glioma pontino intrinseco diffuso o glioma del tronco encefalico
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Cosa sta misurando lo studio?
Misure di risultato primarie
Misure di risultato primarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
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Modelli di espressione dell'RNA a livello del genoma in campioni tumorali, tessuto normale del tronco cerebrale e liquido cerebrospinale utilizzando la profilazione dell'espressione genica Affymetrix
Lasso di tempo: 5 anni
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I campioni tumorali e normali raccolti saranno potenzialmente utilizzati per la profilazione del pattern di espressione dell'intero genoma dell'RNA.
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5 anni
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Convalida dei risultati dell'analisi genome-wide
Lasso di tempo: 5 anni
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L'analisi molecolare effettuata sui campioni raccolti sarà validata attraverso il sequenziamento dell'intero genoma.
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5 anni
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Profilo proteomico del tumore, del normale tessuto del tronco encefalico e del liquido cerebrospinale
Lasso di tempo: 5 anni
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Per ottenere una caratterizzazione completa dei campioni raccolti, sarà effettuata la profilazione proteomica sui campioni tumorali e normali raccolti.
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5 anni
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Modelli di espressione proteica valutati mediante immunoistochimica e western blot rispetto al normale tessuto del tronco cerebrale
Lasso di tempo: 5 anni
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I campioni tumorali e normali raccolti avranno l'immunochimica e il western blot confrontati per valutare la variazione dell'espressione proteica.
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5 anni
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Analisi dell'intero genoma di campioni tumorali e tessuto normale del tronco encefalico
Lasso di tempo: 5 anni
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Per ottenere una caratterizzazione completa dei campioni raccolti, sarà effettuato il sequenziamento dell'intero genoma su campioni tumorali e normali raccolti.
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5 anni
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Analisi molecolare in vitro e in vivo dei campioni raccolti
Lasso di tempo: 5 anni
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I campioni raccolti saranno potenzialmente utilizzati per l'analisi in vitro e la generazione di modelli animali di questo tumore.
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5 anni
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Misure di risultato secondarie
Misure di risultato secondarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
|---|---|---|
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Valutare gli aspetti associati all'acquisizione dei campioni, inclusi potenziali vantaggi e svantaggi
Lasso di tempo: 5 anni
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Nel tentativo di continuare a trarre conoscenza dai campioni raccolti, si accederà continuamente ai potenziali vantaggi e svantaggi derivanti dall'acquisizione dei campioni.
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5 anni
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Collaboratori e investigatori
Sponsor
Sponsor
Investigatori
Investigatori
- Investigatore principale: Javad Nazarian, PhD, Children's National Research Institute
Pubblicazioni e link utili
Pubblicazioni generali
- Becher OJ, Hambardzumyan D, Walker TR, Helmy K, Nazarian J, Albrecht S, Hiner RL, Gall S, Huse JT, Jabado N, MacDonald TJ, Holland EC. Preclinical evaluation of radiation and perifosine in a genetically and histologically accurate model of brainstem glioma. Cancer Res. 2010 Mar 15;70(6):2548-57. doi: 10.1158/0008-5472.CAN-09-2503. Epub 2010 Mar 2.
- Panditharatna E, Yaeger K, Kilburn LB, Packer RJ, Nazarian J. Clinicopathology of diffuse intrinsic pontine glioma and its redefined genomic and epigenomic landscape. Cancer Genet. 2015 Jul-Aug;208(7-8):367-73. doi: 10.1016/j.cancergen.2015.04.008. Epub 2015 May 1.
- Yadavilli S, Scafidi J, Becher OJ, Saratsis AM, Hiner RL, Kambhampati M, Mariarita S, MacDonald TJ, Codispoti KE, Magge SN, Jaiswal JK, Packer RJ, Nazarian J. The emerging role of NG2 in pediatric diffuse intrinsic pontine glioma. Oncotarget. 2015 May 20;6(14):12141-55. doi: 10.18632/oncotarget.3716.
- Kambhampati M, Perez JP, Yadavilli S, Saratsis AM, Hill AD, Ho CY, Panditharatna E, Markel M, Packer RJ, Nazarian J. A standardized autopsy procurement allows for the comprehensive study of DIPG biology. Oncotarget. 2015 May 20;6(14):12740-7. doi: 10.18632/oncotarget.3374.
- Kambhampati M, Panditharatna E, Yadavilli S, Saoud K, Lee S, Eze A, Almira-Suarez MI, Hancock L, Bonner ER, Gittens J, Stampar M, Gaonkar K, Resnick AC, Kline C, Ho CY, Waanders AJ, Georgescu MM, Rance NE, Kim Y, Johnson C, Rood BR, Kilburn LB, Hwang EI, Mueller S, Packer RJ, Bornhorst M, Nazarian J. Harmonization of postmortem donations for pediatric brain tumors and molecular characterization of diffuse midline gliomas. Sci Rep. 2020 Jul 2;10(1):10954. doi: 10.1038/s41598-020-67764-2.
- Ballester LY, Wang Z, Shandilya S, Miettinen M, Burger PC, Eberhart CG, Rodriguez FJ, Raabe E, Nazarian J, Warren K, Quezado MM. Morphologic characteristics and immunohistochemical profile of diffuse intrinsic pontine gliomas. Am J Surg Pathol. 2013 Sep;37(9):1357-64. doi: 10.1097/PAS.0b013e318294e817.
- Saratsis AM, Yadavilli S, Magge S, Rood BR, Perez J, Hill DA, Hwang E, Kilburn L, Packer RJ, Nazarian J. Insights into pediatric diffuse intrinsic pontine glioma through proteomic analysis of cerebrospinal fluid. Neuro Oncol. 2012 May;14(5):547-60. doi: 10.1093/neuonc/nos067. Epub 2012 Apr 5.
- Ahsan S, Raabe EH, Haffner MC, Vaghasia A, Warren KE, Quezado M, Ballester LY, Nazarian J, Eberhart CG, Rodriguez FJ. Increased 5-hydroxymethylcytosine and decreased 5-methylcytosine are indicators of global epigenetic dysregulation in diffuse intrinsic pontine glioma. Acta Neuropathol Commun. 2014 Jun 3;2:59. doi: 10.1186/2051-5960-2-59.
- Buczkowicz P, Hoeman C, Rakopoulos P, Pajovic S, Letourneau L, Dzamba M, Morrison A, Lewis P, Bouffet E, Bartels U, Zuccaro J, Agnihotri S, Ryall S, Barszczyk M, Chornenkyy Y, Bourgey M, Bourque G, Montpetit A, Cordero F, Castelo-Branco P, Mangerel J, Tabori U, Ho KC, Huang A, Taylor KR, Mackay A, Bendel AE, Nazarian J, Fangusaro JR, Karajannis MA, Zagzag D, Foreman NK, Donson A, Hegert JV, Smith A, Chan J, Lafay-Cousin L, Dunn S, Hukin J, Dunham C, Scheinemann K, Michaud J, Zelcer S, Ramsay D, Cain J, Brennan C, Souweidane MM, Jones C, Allis CD, Brudno M, Becher O, Hawkins C. Genomic analysis of diffuse intrinsic pontine gliomas identifies three molecular subgroups and recurrent activating ACVR1 mutations. Nat Genet. 2014 May;46(5):451-6. doi: 10.1038/ng.2936. Epub 2014 Apr 6.
- Nikbakht H, Panditharatna E, Mikael LG, Li R, Gayden T, Osmond M, Ho CY, Kambhampati M, Hwang EI, Faury D, Siu A, Papillon-Cavanagh S, Bechet D, Ligon KL, Ellezam B, Ingram WJ, Stinson C, Moore AS, Warren KE, Karamchandani J, Packer RJ, Jabado N, Majewski J, Nazarian J. Spatial and temporal homogeneity of driver mutations in diffuse intrinsic pontine glioma. Nat Commun. 2016 Apr 6;7:11185. doi: 10.1038/ncomms11185.
- Saratsis AM, Kambhampati M, Snyder K, Yadavilli S, Devaney JM, Harmon B, Hall J, Raabe EH, An P, Weingart M, Rood BR, Magge SN, MacDonald TJ, Packer RJ, Nazarian J. Comparative multidimensional molecular analyses of pediatric diffuse intrinsic pontine glioma reveals distinct molecular subtypes. Acta Neuropathol. 2014;127(6):881-95. doi: 10.1007/s00401-013-1218-2. Epub 2013 Dec 3. Erratum In: Acta Neuropathol. 2020 Aug;140(2):247. doi: 10.1007/s00401-020-02162-6.
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Inizio studio
Completamento primario (Stimato)
Completamento primario
Completamento dello studio (Stimato)
Completamento dello studio
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Primo inviato
Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità
Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità
Primo Inserito (Stimato)
Primo Inserito
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Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)
Ultimo aggiornamento pubblicato
Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
Ultimo verificato
Ultimo verificato
Maggiori informazioni
Termini relativi a questo studio
Parole chiave
Termini MeSH pertinenti aggiuntivi
- Malattie del cervello
- Malattie del sistema nervoso centrale
- Malattie del sistema nervoso
- Neoplasie per tipo istologico
- Neoplasie
- Neoplasie per sede
- Neoplasie, ghiandolari ed epiteliali
- Neoplasie, Neuroepiteliali
- Tumori neuroectodermici
- Neoplasie, cellule germinali ed embrionali
- Neoplasie, tessuto nervoso
- Neoplasie cerebrali
- Neoplasie del sistema nervoso centrale
- Neoplasie del sistema nervoso
- Neoplasie del tronco cerebrale
- Neoplasie infratentoriali
- Glioma
- Glioma pontino intrinseco diffuso
Altri numeri di identificazione dello studio
Altri numeri di identificazione dello studio
- DIPG-1
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