Analyse af prognostiske og forudsigelige genomiske signaturer ved hjælp af arkiverede paraffinindlejrede tumorprøver i brystkræft
Hovedformål med studiet:
- At skabe en genekspressionsbaseret prognostisk enhed, der komplementerer eller overgår den prognostiske nytte af konventionelle biomarkører for brystkræftudfald.
- At identificere en eller flere kliniske undergrupper af patienter, for hvilke den prognostiske enhed udkonkurrerer eller væsentligt øger den prognostiske ydeevne af konventionelle markører, som i øjeblikket bestemmer terapeutiske strategier.
Undersøgelsens delmål:
- Vurder den prognostiske værdi af de multiple genekspressionssignaturer, alene og i kombination, ved hjælp af en stor kohorte af brystkræftpatienter, for hvilke patologi, behandling og udfald er tilgængelig. Der foreslås et "trænings"- og "test"-design.
- Evaluer anvendeligheden af en prognostisk enhed, der måler genekspressionsniveauer fra formalinfikserede paraffinindlejrede prøver (FFPE'er) af primære resekerede tumorer. Efterforskerne vil bruge Affymetrix Quantigene 2.0-analysen og/eller Illumina BeadXpress VeraCode DASL-genekspressionsanalysen (FDA-godkendt IVDMIA.)
- For specifikke kliniske undergrupper af patienter/tumorer vil efterforskerne matematisk identificere additive eller synergistiske prognostiske forhold mellem gener og gensignaturer, der i kombination vil give maksimal risikoforudsigelse (fjernmetastaserfri overlevelse) for patienter.
- Sammenlign den prognostiske nytte af efterforskerens enhed med den for de konventionelle prognostiske variabler, der i øjeblikket bruges til at bestemme terapeutisk strategi.
- Inkorporer de prognostiske signaturer i en praktisk prognosealgoritme, der søger at inkludere konventionelle mål for udfaldet såsom tumorstørrelse, histologisk karakter, nodalstatus, patientalder eller Nottingham-indeks osv.
Efterforskerne antager, at tilstrækkelig kvalitet og kvantitet af tumor-RNA kan udvindes fra arkivparaffinindlejrede tumorprøver til genekspressionsprofilering, og at arkivtumor-afledte genomiske signaturer kan bruges som prognostatorer eller forudsigere i brystkræft.
Studieoversigt
Status
Status
Betingelser
Betingelser
Detaljeret beskrivelse
800 brystkræftpatienter, der opfylder egnethedskriterierne, vil blive udvalgt fra NUH brystkræftregistret (400 til træning, 400 til validering). Berettigede patienter skal have mindst 5 års opfølgning på NUH og have en tilgængelig arkivparaffinindlejret tumorblok opbevaret på Patologisk Afdeling, NUH. 8-10 10-mikron snit fra hver tumorblok vil blive skåret og RNA ekstraheret fra snittene. RNA vil derefter blive profileret ved hjælp af high-throughput genekspressionsplatforme (Illumina Veracode assay, Affymetrix Quantigen assay). Rå genekspressionsdata vil blive anvendt i følgende signaturer, der tidligere er genereret af Genome Institute of Singapore:
- 32-gen p53 Pathway Signature
- 5-genes genetiske karaktersignatur
- 33-gen TuM1-signatur
- 10-gen ER-signatur (Miller & Tan, et. al., upubliceret)
- 6-gen 3-forholdsprædiktor (Miller & Karuturi, et. al., upubliceret)
- 5-gen HER2 Amplicon Predictor (Miller & Karuturi, et. al., upubliceret)
- 7-gen Basal-Luminal Discriminator (Miller, upubliceret)
Disse signaturers prognostiske og/eller prædiktive evner vil blive sammenlignet med konventionelle kliniske prognostikatorer og prædiktorer med det mål at udvikle arkivale tumor-afledte genomiske tests til behandling af brystkræft i fremtiden.
De arkiverede paraffinindlejrede tumorblokke er resterende prøver efter klinisk brug. De er ikke prøver, der er givet samtykke til forskningsformål. Vi anmoder om frafald af samtykke, da dette er en minimal risikoundersøgelse. Vi vil sikre, at tilstrækkeligt væv efterlades til fremtidige rutinediagnostiske formål. Udsnit taget fra hver tumor vil blive kodet uden patientidentifikatorer for at beskytte deltagernes privatliv og fortrolighed.
Resultaterne genereret fra tumorprøverne i denne undersøgelse vil ikke påvirke den kliniske behandling af patienterne.
Undersøgelsestype
Undersøgelsestype
Kontakter og lokationer
Studiesteder
-
-
-
Singapore, Singapore
- National University Hospital
-
-
Deltagelseskriterier
Berettigelseskriterier
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
- Barn
- Voksen
- Ældre voksen
Tager imod sunde frivillige
Køn, der er berettiget til at studere
Prøveudtagningsmetode
Studiebefolkning
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
- Berettigede patienter skal have mindst 5 års opfølgning på NUH og have en tilgængelig arkivparaffinindlejret tumorblok opbevaret på Patologisk Afdeling, NUH
Ekskluderingskriterier:
- Ikke brystkræftpatienter
Studieplan
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
Antal grupper/kohorter
Kohorter og interventioner
Gruppe / kohorteGruppe / kohorte |
|---|
|
Brystkræftpatienter
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Sponsor
Sponsor
Efterforskere
Efterforskere
- Ledende efterforsker: Soo Chin Lee, MBBS, MRCP, National University Hospital, Singapore
Publikationer og nyttige links
Generelle publikationer
- Slodkowska EA, Ross JS. MammaPrint 70-gene signature: another milestone in personalized medical care for breast cancer patients. Expert Rev Mol Diagn. 2009 Jul;9(5):417-22. doi: 10.1586/erm.09.32.
- Wang Y, Klijn JG, Zhang Y, Sieuwerts AM, Look MP, Yang F, Talantov D, Timmermans M, Meijer-van Gelder ME, Yu J, Jatkoe T, Berns EM, Atkins D, Foekens JA. Gene-expression profiles to predict distant metastasis of lymph-node-negative primary breast cancer. Lancet. 2005 Feb 19-25;365(9460):671-9. doi: 10.1016/S0140-6736(05)17947-1.
Datoer for undersøgelser
Studer store datoer
Studiestart
Studiestart
Primær færdiggørelse (Forventet)
Primær færdiggørelse
Studieafslutning
Studieafslutning
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
Først indsendt
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først opslået (Skøn)
Først opslået
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Skøn)
Sidste opdatering sendt
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidst verificeret
Sidst verificeret
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Yderligere relevante MeSH-vilkår
Andre undersøgelses-id-numre
Andre undersøgelses-id-numre
- BR05/22/10
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .