Denne side blev automatisk oversat, og nøjagtigheden af ​​oversættelsen er ikke garanteret. Der henvises til engelsk version for en kildetekst.

Tarmmikrobiom ved inflammatorisk tarmsygdom

9. marts 2023 opdateret af: Chang Kyun Lee, Kyunghee University Medical Center

Opdagelse af tarmmikrobielle signaturer i inflammatorisk tarmsygdom

Inflammatorisk tarmsygdom (IBD) er en kronisk betændelsestilstand i mave-tarmkanalen. Der har været adskillige undersøgelser for at afsløre dysbiose af fækal/slimhindemikrobiomsammensætning hos IBD-patienter, men den faktiske tendens til dysbiose er slående forskellig blandt patientens etnicitet.

På denne baggrund har efterforskerne sammensat en prospektiv kohorte af koreanske IBD-patienter i et stort akademisk henvisnings-IBD-center. Ved hjælp af en integreret multi-omics bioinformatisk analyse sigter efterforskerne på at udforske tarmmikrobielle signaturer sammen med distinkte kliniske/genetiske egenskaber og deres potentielle samspil hos patienter med IBD.

Studieoversigt

Status

Rekruttering

Betingelser

Detaljeret beskrivelse

Denne prospektive kohorteundersøgelse har til formål at opbygge et tarmmikrobiombibliotek for koreanske IBD-patienter og sigter også mod at udforske tarmmikrobielle signaturer sammen med distinkte kliniske/genetiske egenskaber og deres potentielle samspil ved hjælp af investigatorens multi-omics analyseplatform.

Efter at have underskrevet det informerede samtykke vil forskellige biologiske prøver (fækal-, slimhinde- og blodprøver) samt omfattende kliniske data (inklusive psykometriske evalueringer ved hjælp af patientundersøgelse) blive indhentet fra patienter med jævne mellemrum.

Multi-omics-undersøgelserne vil omfatte: metagenomics (16s RNA-sekventering og hel metagenomisk sekventering), metabolomics, human genomics (genom-dækkende SNP-data, hele exom- og genom-sekventering), transkriptomics, proteomics, epigenetik og enkeltcellede multi-omics-analyse . Der vil blive udført in vitro og in vivo undersøgelser med fækale prøver.

Kort sagt, efter at have ekstraheret DNA'et fra blodprøver, vil hele genomsekventering blive udført, og data vil blive sammenlignet med de tidligere rapporterede varianser. Nye varianser eller forekomst af specifikke varianser vil blive målt. Fækal prøve vil blive indsamlet, og mikrobiomsammensætningen af ​​hvert forsøgspersoner vil blive analyseret. Fækal mikrobiel diversitet vil blive målt ud fra sekventeringsdata af 16S ribosomalt RNA, som er højt bevaret område med genetisk information blandt mikroorganismer. Colonslimhindeprøve vil blive indsamlet, når rutinemæssig endoskopisk overvågning er planlagt. Prøver vil blive samlet fra syge og normale slimhinder til analyse. Mikrobiel diversitet vil blive målt ud fra 16S RNA-sekventeringsdata fra prøverne.

Multiomics-dataene vil blive analyseret med omfattende kliniske metadata ved hjælp af en integreret bioinformatikanalyseplatform. Kliniske data omfatter demografi, sygdomskarakteristika og forskellige patientrapporterede resultater (herunder sundhedsrelateret livskvalitet, angst, depression og andre). Patientrapporterede udfaldsdata vil blive indsamlet med jævne mellemrum ved hjælp af validerede spørgeskemaer.

Data fra grundlæggende analyser vil blive genudforsket med hensyn til inter-individuelle forskelle, forskel mellem sygdomskarakteristika (såsom sygdomsfænotype, type medicinsk behandling og serologiske markører), forskel mellem psykosociale karakteristika (såsom tilstedeværelsen af ​​angst eller depression og livskvalitet) osv. Derudover vil data fra basisanalyse blive brugt som reference for den koreanske IBD-patient, og de vil blive sammenlignet med andre data opnået fra den "anden etnicitet" eller "sunde" koreanske befolkning.

Som konklusion vil denne langsigtede, storstilede prospektive undersøgelse give en platform til at studere et felt inden for translationel medicin for at afsløre skjulte signaturer af tarmmikrobiom, der ligger til grund for IBD og for at identificere potentielle biologiske markører i IBD.

Undersøgelsestype

Observationel

Tilmelding (Forventet)

1500

Kontakter og lokationer

Dette afsnit indeholder kontaktoplysninger for dem, der udfører undersøgelsen, og oplysninger om, hvor denne undersøgelse udføres.

Studiesteder

      • Seoul, Korea, Republikken, 130-702
        • Rekruttering
        • Kyung Hee University Hospital

Deltagelseskriterier

Forskere leder efter personer, der passer til en bestemt beskrivelse, kaldet berettigelseskriterier. Nogle eksempler på disse kriterier er en persons generelle helbredstilstand eller tidligere behandlinger.

Berettigelseskriterier

Aldre berettiget til at studere

  • Barn
  • Voksen
  • Ældre voksen

Tager imod sunde frivillige

Ingen

Køn, der er berettiget til at studere

Alle

Prøveudtagningsmetode

Ikke-sandsynlighedsprøve

Studiebefolkning

Vi er planlagt til at studere alle patienter med etableret diagnose af IBD (Crohn sygdom eller colitis ulcerosa) registreret i enkelt tertiær henvisning IBD center (KyungHee University Medical Center).

Beskrivelse

Inklusionskriterier:

  • Patienter med etableret diagnose af inflammatorisk tarmsygdom, herunder colitis ulcerosa og Crohns sygdom

Ekskluderingskriterier:

  • Person med tidligere brug af antibiotika eller probiotika inden for de seneste 2 uger.

Studieplan

Dette afsnit indeholder detaljer om studieplanen, herunder hvordan undersøgelsen er designet, og hvad undersøgelsen måler.

Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?

Design detaljer

Hvad måler undersøgelsen?

Primære resultatmål

Resultatmål
Foranstaltningsbeskrivelse
Tidsramme
Sammensætning og mangfoldighed af tarmmikrobiom
Tidsramme: Op til 10 år
Fækale og/eller tarmslimhindeprøver opnås fra tilmeldte forsøgspersoner til metagenomisk sekventering. Efter ekstraktion af fækal eller slimhinde-DNA måles mikrobiel sammensætning og diversitet ud fra 16sRNA high-throuput-sekventering eller Shotgun-metoden. Data sammenlignes på tværs af forskellige sygdomsfænotyper, såsom sygdomstyper (ulkreativ colitis versus Crohns sygdom), type behandling og tilstedeværelsen af ​​psykiske lidelser (angst/depression).
Op til 10 år

Sekundære resultatmål

Resultatmål
Foranstaltningsbeskrivelse
Tidsramme
Taksonomisk profilering af tarmmikrobiom
Tidsramme: Op til 10 år
Fækale og/eller tarmslimhindeprøver opnås fra tilmeldte forsøgspersoner til metagenomisk sekventering. Efter ekstraktion af fækalt eller slimhinde-DNA analyseres taksonomiske profiler forbundet med inflammatoriske tarmsygdomme og forskellige sygdomsfænotyper ud fra 16sRNA high-throuput-sekventering eller Shotgun-metoden.
Op til 10 år
Fund af enkeltnukleotidpolymorfier (SNP'er)
Tidsramme: Op til 10 år
Blodprøver udtages fra tilmeldte forsøgspersoner til genomomfattende mikroarray. Efter ekstraktion af DNA udforskes SNP'er relateret til inflammatoriske tarmsygdomme og forskellige sygdomsfænotyper (Genom-wide association study [GWAS] statistisk signifikans tærskel, P < 5,00*E-08).
Op til 10 år
Fund af serologiske biomarkører
Tidsramme: Op til 10 år
Blodprøver udtages fra tilmeldte forsøgspersoner til proteomisk analyse. Serologiske biomakere, der involverer inflammatoriske tarmsygdomme og sygdomsfænotyper, udforskes.
Op til 10 år
Korrelation mellem værtsgenotypning og tarmmikrobiom
Tidsramme: Op til 10 år
Blodprøver udtages fra tilmeldte forsøgspersoner til genomomfattende mikroarray. Efter ekstraktion af DNA udforskes SNP'er relateret til inflammatoriske tarmsygdomme og forskellige sygdomsfænotyper (Genom-wide association study [GWAS] statistisk signifikans tærskel, P < 5,00*E-08). Fækale og/eller tarmslimhindeprøver opnås fra tilmeldte forsøgspersoner til metagenomisk sekventering. Efter ekstraktion af fækalt eller slimhinde-DNA analyseres taksonomiske profiler forbundet med inflammatoriske tarmsygdomme og forskellige sygdomsfænotyper ud fra 16sRNA high-throuput-sekventering eller Shotgun-metoden. Den taksonomiske sammensætning af tarmmikrobiom sammenlignes i henhold til sekventeringsdataene for værtsgenomer.
Op til 10 år
Flydende biopsibiosignaturer vurderet af enkeltcellet RNA-Seq
Tidsramme: Op til 10 år
Blod- og tarmslimhindebiopsiprøver opnås fra tilmeldte forsøgspersoner, især dem, der er behandlet med biologiske lægemidler eller små molekyler til enkeltcelleanalyse (RNA-Seq). Data opnået fra enkeltcelleanalyse vil blive sammenlignet på tværs af forskellige tidsrammer (for eksempel før versus efter specifik behandling) og på tværs af forskellige sygdomsfænotyper.
Op til 10 år

Samarbejdspartnere og efterforskere

Det er her, du vil finde personer og organisationer, der er involveret i denne undersøgelse.

Sponsor

Publikationer og nyttige links

Den person, der er ansvarlig for at indtaste oplysninger om undersøgelsen, leverer frivilligt disse publikationer. Disse kan handle om alt relateret til undersøgelsen.

Datoer for undersøgelser

Disse datoer sporer fremskridtene for indsendelser af undersøgelsesrekord og resumeresultater til ClinicalTrials.gov. Studieregistreringer og rapporterede resultater gennemgås af National Library of Medicine (NLM) for at sikre, at de opfylder specifikke kvalitetskontrolstandarder, før de offentliggøres på den offentlige hjemmeside.

Studer store datoer

Studiestart (Faktiske)

1. april 2018

Primær færdiggørelse (Forventet)

31. marts 2028

Studieafslutning (Forventet)

31. marts 2028

Datoer for studieregistrering

Først indsendt

5. juli 2018

Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier

5. juli 2018

Først opslået (Faktiske)

17. juli 2018

Opdateringer af undersøgelsesjournaler

Sidste opdatering sendt (Skøn)

10. marts 2023

Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier

9. marts 2023

Sidst verificeret

1. marts 2023

Mere information

Begreber relateret til denne undersøgelse

Andre undersøgelses-id-numre

  • IBD library_2018

Plan for individuelle deltagerdata (IPD)

Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?

UBESLUTET

IPD-planbeskrivelse

Efter offentliggørelse af resultaterne vil enhver anmodning om datadeling fra andre forskere blive positivt overvejet. Men omfanget af deling er ikke besluttet endnu.

Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter

Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt

Ingen

Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt

Ingen

Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .