Metode til genetisk analyse i genodermatoser (GENODERM)
Udvikling af en genetisk analysemetode af mendeliomer og genomer til diagnosticering af genodermatoser og sjældne genetiske sygdomme med kutan ekspression
Studieoversigt
Status
Status
Betingelser
Betingelser
Intervention / Behandling
Intervention / Behandling
Detaljeret beskrivelse
Interventionel multicenter prospektiv undersøgelse. Patienterne vil blive undersøgt af en hudlæge for at beskrive og identificere de forskellige hudlæsioner. Samarbejde med genetikerteamet: klinisk undersøgelse for relevante tilfælde Patientjournaler vil blive konsulteret. Relevant lægelig information, biologiske undersøgelser og andre supplerende undersøgelser vil blive undersøgt.
En blodprøve (10 ml i EDTA-rør) vil blive indsamlet fra patienten og hans/hendes forældre for at opbevare DNA for mediom og genom.
Et skriftligt samtykke fra forældre og børn (hvis alderssvarende) vil blive indhentet, og et studieinformationsark vil blive underskrevet. De vil også underskrive den sædvanlige anmodning om genetisk samtykke til mendeliom, genom og transkriptom på kultur af fibroblaster.
En 4 mm punch-hudbiopsi (sund eller beskadiget afhængig af fænotype og indikation) vil blive udført i henhold til standardteknikken.
Fibroblastkulturen vil blive udført rutinemæssigt af Genetics Center. Transkriptomet vil blive udført i overensstemmelse med de processer, der er sat op på Genetics Center Mendeliome analyse
- Tillad analyse af 4000 sjældne sygdomsgener
- Vil blive udført i henhold til rutinemæssige analyser af genetiklaboratoriet
- Bruger Highlander-værktøjerne (web)
- Brug af de novo filtre, autosomal recessiv, heterozygot forbindelse, X-bundet, stærk variant (LOF og kanoniske splejsningssteder)
- Brug af sjældnere filtre: exomisk eller gendeletion, splejsning (+/- 12 basepar omkring exoner)
- I uforklarlige alvorlige tilfælde vil et genom suppleret med 10Xgenomics-metoden og et transkriptom af fibroblaster blive realiseret. Denne dobbelte strategi giver mulighed for at få et genom af høj fortolkningskvalitet. Genomanalyse ved 10Xgenomics-metoden (https://www.10xgenomics.com )
- Denne metode giver os mulighed for at dekonvolere haplotyper og tillader analyse af 16.000 andre komplementære gener og at opnå præcist definerede strukturelle varianter.
- Transkriptomet vil bedre vurdere de genomiske effekter på genekspression.
- Genomet og transkriptomet vil også vurdere tilstedeværelsen af dybe intronmutationer og deres effekt på splejsning og vil være en bæredygtig ressource for andre langsigtede projekter (analyse af ikke-kodende regioner, mikroRNA'er osv.)
Undersøgelsestype
Undersøgelsestype
Tilmelding (Forventet)
Tilmelding
Fase
Fase
- Ikke anvendelig
Kontakter og lokationer
Studiekontakt
Studiekontakt
- Navn: Deborah Salik, MD
- Telefonnummer: 0032 2 477 31 20
- E-mail: Deborah.salik@huderf.be
Undersøgelse Kontakt Backup
- Navn: Guillaume Smits, MD PhD
- E-mail: Guillaume.smits@erasme.ulb.ac.be
Studiesteder
-
-
-
Brussels, Belgien, 1020
- Rekruttering
- Hôpital Universitaire Des Enfants Rein Fabiola
-
Kontakt:
- Deborah Salik, MD
- Telefonnummer: 0032 2 477 31 20
- E-mail: Deborah.salik@huderf.be
-
Ledende efterforsker:
- Deborah Salik, MD
-
-
Deltagelseskriterier
Berettigelseskriterier
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
Tager imod sunde frivillige
Køn, der er berettiget til at studere
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
- Børn mellem 0 og 18 år
- Tilstedeværelse af dermatologiske symptomer, der tyder på genodermatose
- Tilstedeværelse af systemiske symptomer hos en udiagnosticeret patient forbundet med dermatologiske manifestationer, der tyder på en mere sjælden genetisk lidelse med kutan ekspression
Ekskluderingskriterier:
- Mosaicisme
- Neurofibromatose, alle typer
- Tuberøs sklerose
- Ichthyosis vulgaris
- Mistanke om somatisk svækkelse (gigant nævus)
Studieplan
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
- Primært formål: Diagnostisk
- Tildeling: N/A
- Interventionel model: Enkelt gruppeopgave
- Maskning: Ingen (Åben etiket)
Antal våben
Våben og indgreb
Deltagergruppe / ArmDeltagergruppe / Arm |
Intervention / BehandlingIntervention / Behandling |
|---|---|
|
Eksperimentel: Genodermatose patienter
Børn mellem 0 og 18 år med tilstedeværelse af dermatologiske symptomer, der tyder på genodermatose eller tilstedeværelse af systemiske symptomer hos en udiagnosticeret patient forbundet med dermatologiske manifestationer, der tyder på en mere sjælden genetisk lidelse med kutan ekspression
|
For tilfælde, der ikke er forklaret af en mendeliomer: genom og transkriptom på fibroblastkultur
|
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Genetisk diagnostik ved mendeliom
Tidsramme: På tidspunktet for klinisk diagnose af genodermatose
|
Andel af patienter, for hvem der er stillet en genetisk diagnose ved hjælp af mendeliommetoden.
American College of Medical Genetics and Genomics.
Diagnostiske varianter klassificeres som "patogene" eller "sandsynligvis patogene" varianter.
|
På tidspunktet for klinisk diagnose af genodermatose
|
Sekundære resultatmål
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Genetisk diagnostik ved genom
Tidsramme: På tidspunktet for klinisk diagnose af genodermatose
|
Andel af patienter, for hvem der er stillet en genetisk diagnose ved hjælp af genommetoden.
American College of Medical Genetics and Genomics.
Diagnostiske varianter klassificeres som "patogene" eller "sandsynligvis patogene" varianter.
|
På tidspunktet for klinisk diagnose af genodermatose
|
|
Genetisk diagnostik ved fibroblast transkriptom
Tidsramme: På tidspunktet for klinisk diagnose af genodermatose
|
Andel af patienter, for hvem der er etableret en genetisk diagnose ved hjælp af fibroblast-transkriptommetoden.
American College of Medical Genetics and Genomics.
Diagnostiske varianter klassificeres som "patogene" eller "sandsynligvis patogene" varianter.
|
På tidspunktet for klinisk diagnose af genodermatose
|
|
Relevans af dermatologiske symptomer
Tidsramme: På tidspunktet for klinisk diagnose af genodermatose
|
Korrelation mellem dermatologiske tegn og symptomer og en genetisk diagnose etableret ved mendeliom-, genom- og transkriptommetoden
|
På tidspunktet for klinisk diagnose af genodermatose
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Sponsor
Sponsor
Samarbejdspartnere
Samarbejdspartnere
Efterforskere
Efterforskere
- Ledende efterforsker: Deborah Salik, MD, Hôpital Universitaire Des Enfants Rein Fabiola
Datoer for undersøgelser
Studer store datoer
Studiestart (Faktiske)
Studiestart
Primær færdiggørelse (Forventet)
Primær færdiggørelse
Studieafslutning (Forventet)
Studieafslutning
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
Først indsendt
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først opslået (Faktiske)
Først opslået
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Faktiske)
Sidste opdatering sendt
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidst verificeret
Sidst verificeret
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Nøgleord
Yderligere relevante MeSH-vilkår
Andre undersøgelses-id-numre
Andre undersøgelses-id-numre
- P2018/Dermato/Genodermatose
Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter
Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt
Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .