Vaginal, placental og neonatal bukkal mycobiota og mikrobiom ved præterm fødsel

For tidlig fødsel er ansvarlig for mere end 70 % af alle neonatale og spædbørnsdødsfald. Derudover er risikoen for cerebral parese blandt børn, der er født for tidligt, 10 gange mere end dem, der er født til termin. Risikoen for for tidlig fødsel er omvendt relateret til cervikal længde ved midgestation. Randomiserede-kontrollerede forsøg, der involverer singleton-graviditeter med en kort cervikal længde (mindre end 25 mm) har vist, at profylaktisk brug af progesteron signifikant reducerer frekvensen af ​​for tidlig fødsel og neonatal død. Forholdet mellem vaginal micobiota og for tidlig fødsel er blevet dokumenteret. Alligevel er virkningen af ​​kort cervikal længde og progesteronbehandling på vaginal, neonatal og placental mikrobiota og mycobiota ikke blevet evalueret. Formålet med denne undersøgelse er at behandle følgende punkter;

1. Longitudinel maternal (vaginal), føtal (oral) og placental (basalplade og parenkym) 16S-baseret og 18S-baseret metagenomisk profilering med udledt metagenomik vil afsløre distinkte mikrobielle samfund i forbindelse med præterm fødsel.
2. Sammenligning af vaginal, neonatal (bukkal) og placental (basalplade og parenkym) 16s rRNA med bakterier og 18s rRNA med svampe hos gravide kvinder med kort cervikal længde med dem med normal cervikal længde;

2. Sammenligning af maternalt (vaginalt), neonatalt (oralt) og placentalt (basalplade og parenkym) 16s rRNA med bakterier og 18s rRNA med svampe hos gravide kvinder med kort cervikal længde, som fødte for tidligt med dem, der fødte til termin; 3. Effekten af ​​progesteron på maternelt (vaginalt), neonatalt (bukkalt) og placenta (basalplade og parenkym) 16s rRNA med bakterier og 18s rRNA med svampe.

Målingerne af livmoderhalslængden vil blive udført i to forskellige graviditetsperioder (11-14 og 18-22 ugers graviditet) i singleton-graviditeter. For det første vil de vaginale podninger blive indsamlet fra kvinder, der accepterer at deltage i undersøgelsen ved 11-14. svangerskabsuge lige før målingen af ​​cervikal længde. Vaginale podninger vil også blive udført igen ved 18-22 ugers graviditet som forklaret ovenfor. Mikroniseret progesteron vil blive startet hos kvinder med en cervikal længde på eller mindre end 25 mm (mindre end 3. percentil) ved 18-22 ugers graviditet. Medicinen (progesteron 200 mg) vil blive administreret intravaginalt hver aften før sengetid og vil fortsætte indtil 36. svangerskabsuge, medmindre patienten føder. Måling af cervikal længde vil blive gentaget transvaginalt ved 28. og 32. gestationsuge, og prøver vil blive taget med en cervikal podning før disse målinger. For at vurdere tilstedeværelsen af ​​placenta mycobiota og mikrobiota, tages 1 cm x 1 cm x 1 cm af vævsprøven fra placenta, der er 3 cm lateral af ledningsindføringen, under sterile forhold efter fødslen. For at evaluere fostervandskammeret vil der umiddelbart efter fødslen blive indsamlet en mundslimhindepodning fra de nyfødte. Alle prøver vil blive leveret til vores forskningslaboratorium med det samme og opbevaret i -80 ℃ kabinet indtil evalueringen. V3-V4-regionerne ved hjælp af 16s ribosomale RNA-sekventeringsmetoden vil blive sekventeret med Illumina MiSeq-enheden, og dataene vil blive analyseret i henhold til protokollerne standardiseret i Human Microbiome Project.

DNA-prøver, der vil blive rangeret fra de data, der skal sekventeres i overensstemmelse med ITS1-regionens metabiota-protokollen, vil blive evalueret inden for Human Microbiome Project.

Pseudomonas, Escherichia, Neisseria, Streptococcus, Lactobacillus, Candida, Actinomyces vil blive brugt som positive kontroller, og V3-V4 og ITS regioner vil blive matchet for bakteriel mikrobiota og svampemikrobiota. Efter at de "Operational taxonomic units" af amplikonerne er konfigureret med VSEARCH programmet, vil analyserne blive udført med GENBANK mikrobiota og micobiota data.