Single-Cell Transcriptomics of the Peritoneal Microenvironment of Colorectal PC (SingleCell)
Det peritoneale mikromiljøs rolle i patogenesen af kolorektal peritoneal karcinomatose: enkeltcellet transkriptomik
Studieoversigt
Status
Status
Betingelser
Betingelser
Intervention / Behandling
Intervention / Behandling
Detaljeret beskrivelse
Forskningsmetodik
Før inklusion af patienter vil patienter blive screenet for tilstedeværelsen af hepatitis B, hepatitis C og HIV for at sikre forskernes sikkerhed. Under cytoreduktiv kirurgi vil der blive indsamlet i alt fem prøver af tumorvæv. Tre af disse prøver vil blive brugt til ScRNASeq-analyse, og to prøver af en makrometastase vil blive lynfrosset og kryokonserveret.
Enkeltcellet RNA-sekventeringsanalyse Vi vil udførligt katalogisere stromacelletyperne i mikromiljøet af kolorektal cancer peritoneale metastaser ved at anvende enkeltcellet RNA-sekventering (scRNAseq) på tre prøver (hvoraf den ene helst skal stamme fra omentum majus, for at omfatte mælkeagtig pletter) erhvervet fra kirurgisk affaldsmateriale fra patienter, der gennemgår cytoreduktiv kirurgi. Efter prøveprælevation transporteres prøverne så hurtigt som muligt, mens de er afkølet og nedsænket i 10% PBS til VIB-faciliteterne, hvor enkeltcellesuspensioner vil blive fremstillet i henhold til standardprotokoller. Efter celleudvælgelse af FACS (CD45+ og levende/død farvning, for at sikre en 50/50 blanding af immun- og stromale celler) og biblioteksforberedelse vil ScRNASeq blive udført.
Enkeltcellesekventeringsanalyse vil give os mulighed for at identificere celleklynger, der ved brug af markørgener vil blive tildelt forskellige kendte cellelinjer. Efter annotering af data vil et "landskab" af sammensætningen af tumorstroma blive erhvervet.
Undersøgelsestype
Undersøgelsestype
Tilmelding (Anslået)
Tilmelding
Kontakter og lokationer
Studiekontakt
Studiekontakt
- Navn: Wim P Ceelen, MD, PhD
- Telefonnummer: +32 093326251
- E-mail: wim.ceelen@ugent.be
Undersøgelse Kontakt Backup
- Navn: Jesse G Demuytere, MD
- Telefonnummer: +32 093324278
- E-mail: jesse.demuytere@ugent.be
Studiesteder
-
-
Oost-Vlaanderen
-
Ghent, Oost-Vlaanderen, Belgien, 9000
- Rekruttering
- UZ Ghent
-
Kontakt:
- Wim P Ceelen, MD,PhD
- Telefonnummer: +32 093326251
- E-mail: wim.ceelen@ugent.be
-
Underforsker:
- Jesse G Demuytere, MD
-
-
Deltagelseskriterier
Berettigelseskriterier
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
- Barn
- Voksen
- Ældre voksen
Tager imod sunde frivillige
Prøveudtagningsmetode
Studiebefolkning
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
- Patienter, der gennemgår CRS+HIPEC til PC af kolorektal oprindelse
Ekskluderingskriterier:
- Tidligere HIPEC/PIPAC
Studieplan
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
- Observationsmodeller: Kun etui
- Tidsperspektiver: Fremadrettet
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Enkeltcellet transkriptomik
Tidsramme: 24 måneder
|
Et transskriptionelt enkeltcellet RNA-seq-atlas af genekspressionsdata vil blive rapporteret
|
24 måneder
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Sponsor
Sponsor
Samarbejdspartnere
Samarbejdspartnere
Efterforskere
Efterforskere
- Ledende efterforsker: Wim Ceelen, MD, PhD, UZ Ghent
Datoer for undersøgelser
Studer store datoer
Studiestart (Faktiske)
Studiestart
Primær færdiggørelse (Anslået)
Primær færdiggørelse
Studieafslutning (Anslået)
Studieafslutning
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
Først indsendt
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først opslået (Faktiske)
Først opslået
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Faktiske)
Sidste opdatering sendt
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidst verificeret
Sidst verificeret
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Yderligere relevante MeSH-vilkår
Andre undersøgelses-id-numre
Andre undersøgelses-id-numre
- BC-6978
Plan for individuelle deltagerdata (IPD)
Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?
Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter
Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt
Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .