Einzelzell-Transkriptomik der peritonealen Mikroumgebung von kolorektalem PC (SingleCell)
Die Rolle der peritonealen Mikroumgebung bei der Pathogenese der kolorektalen Peritonealkarzinose: Einzelzell-Transkriptomik
Studienübersicht
Status
Status
Bedingungen
Bedingungen
Intervention / Behandlung
Intervention / Behandlung
Detaillierte Beschreibung
Forschungsmethodik
Vor der Aufnahme von Patienten werden die Patienten auf das Vorhandensein von Hepatitis B, Hepatitis C und HIV untersucht, um die Sicherheit der Forscher zu gewährleisten. Während der zytoreduktiven Operation werden insgesamt fünf Tumorgewebeproben entnommen. Drei dieser Proben werden für die ScRNASeq-Analyse verwendet, und zwei Proben einer Makrometastase werden schockgefroren und kryokonserviert.
Einzelzell-RNA-Sequenzierungsanalyse Wir werden die Stromazelltypen in der Mikroumgebung von peritonealen Darmkrebsmetastasen umfassend katalogisieren, indem wir Einzelzell-RNA-Sequenzierung (scRNAseq) an drei Proben verwenden (von denen eine vorzugsweise aus dem Omentum majus stammen sollte, um milchig zu umfassen Spots) aus chirurgischem Abfallmaterial von Patienten, die sich einer zytoreduktiven Operation unterziehen. Nach der Probenvorbereitung werden die Proben so schnell wie möglich gekühlt und in 10 % PBS eingetaucht zu den VIB-Einrichtungen transportiert, wo Einzelzellsuspensionen gemäß Standardprotokollen hergestellt werden. Nach der Zellselektion durch FACS (CD45+ und Live/Dead-Färbung, um eine 50/50-Mischung von Immun- und Stromazellen sicherzustellen) und Bibliotheksvorbereitung wird ScRNASeq durchgeführt.
Die Einzelzell-Sequenzierungsanalyse wird es uns ermöglichen, Zellcluster zu identifizieren, die durch die Verwendung von Markergenen verschiedenen bekannten Zelllinien zugeordnet werden. Nach Annotation der Daten wird eine „Landschaft“ der Zusammensetzung des Tumorstromas erfasst.
Studientyp
Studientyp
Einschreibung (Geschätzt)
Einschreibung
Kontakte und Standorte
Studienkontakt
Studienkontakt
- Name: Wim P Ceelen, MD, PhD
- Telefonnummer: +32 093326251
- E-Mail: wim.ceelen@ugent.be
Studieren Sie die Kontaktsicherung
- Name: Jesse G Demuytere, MD
- Telefonnummer: +32 093324278
- E-Mail: jesse.demuytere@ugent.be
Studienorte
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Oost-Vlaanderen
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Ghent, Oost-Vlaanderen, Belgien, 9000
- Rekrutierung
- UZ Ghent
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Kontakt:
- Wim P Ceelen, MD,PhD
- Telefonnummer: +32 093326251
- E-Mail: wim.ceelen@ugent.be
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Unterermittler:
- Jesse G Demuytere, MD
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Teilnahmekriterien
Zulassungskriterien
Zulassungskriterien
Studienberechtigtes Alter
- Kind
- Erwachsene
- Älterer Erwachsener
Akzeptiert gesunde Freiwillige
Probenahmeverfahren
Studienpopulation
Beschreibung
Einschlusskriterien:
- Patienten, die sich einer CRS+HIPEC für PC kolorektalen Ursprungs unterziehen
Ausschlusskriterien:
- Zurück HIPEC/PIPAC
Studienplan
Wie ist die Studie aufgebaut?
Designdetails
- Beobachtungsmodelle: Nur Fall
- Zeitperspektiven: Interessent
Was misst die Studie?
Primäre Ergebnismessungen
Primäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
|---|---|---|
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Einzelzell-Transkriptomik
Zeitfenster: 24 Monate
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Ein transkriptioneller Einzelzell-RNA-Seq-Atlas von Genexpressionsdaten wird vorgestellt
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24 Monate
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Mitarbeiter und Ermittler
Sponsor
Sponsor
Mitarbeiter
Mitarbeiter
Ermittler
Ermittler
- Hauptermittler: Wim Ceelen, MD, PhD, UZ Ghent
Studienaufzeichnungsdaten
Haupttermine studieren
Studienbeginn (Tatsächlich)
Studienbeginn
Primärer Abschluss (Geschätzt)
Primärer Abschluss
Studienabschluss (Geschätzt)
Studienabschluss
Studienanmeldedaten
Zuerst eingereicht
Zuerst eingereicht
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
Zuerst gepostet (Tatsächlich)
Zuerst gepostet
Studienaufzeichnungsaktualisierungen
Letztes Update gepostet (Tatsächlich)
Letztes Update gepostet
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
Zuletzt verifiziert
Zuletzt verifiziert
Mehr Informationen
Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie
Zusätzliche relevante MeSH-Bedingungen
Andere Studien-ID-Nummern
Andere Studien-ID-Nummern
- BC-6978
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Arzneimittel- und Geräteinformationen, Studienunterlagen
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Arzneimittelprodukt
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt
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