Udvidelse af NGS -data med optisk genomkortlægning (OGM) (OGM)
Udvidelse af NGS -data med optisk genomkortlægning (OGM): Mere omfattende variantdetektion hos børn med uforklarlige sjældne genetiske lidelser
Studieoversigt
Status
Status
Betingelser
Betingelser
Intervention / Behandling
Intervention / Behandling
Undersøgelsestype
Undersøgelsestype
Tilmelding (Anslået)
Tilmelding
Fase
Fase
- Ikke anvendelig
Kontakter og lokationer
Studiekontakt
Studiekontakt
- Navn: Maria Clara Bonaglia PhD
- Telefonnummer: +39 031 877913
- E-mail: mariaclara.bonaglia@lanostrafamiglia.it
Studiesteder
-
-
Lecco
-
Bosisio Parini, Lecco, Italien, 23842
- Rekruttering
- Cytogenetic Unit of Medical Genetic Laboratory
-
Kontakt:
- Maria C Bonaglia, Master Degree
- Telefonnummer: +39 031877913
-
-
Deltagelseskriterier
Berettigelseskriterier
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
- Barn
- Voksen
- Ældre voksen
Tager imod sunde frivillige
Beskrivelse
Inkluderingskriterier:
- individer uden en molekylær diagnose (negativ til ES/CMA -analyser);
- Personer med genetiske diagnoser, der kun forklarer en komponent i deres primære fænotype;
- Personer, der bærer en eller flere varianter af usikker klinisk betydning
- Personer med en fænotype minder meget om klinisk og molekylært veldefinerede syndromer (dvs. Marfan-syndrom) men negativ til rutinemæssig molekylær analyse.
Ekskluderingskriterier:
- Personer, der ikke har gennemgået den første diagnostiske genetiske tests (ES/CMA)
Studieplan
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
- Primært formål: Diagnostisk
- Tildeling: N/A
- Interventionel model: Enkelt gruppeopgave
- Maskning: Ingen (Åben etiket)
Antal våben
Våben og indgreb
Deltagergruppe / ArmDeltagergruppe / Arm |
Intervention / BehandlingIntervention / Behandling |
|---|---|
|
Eksperimentel: Udvidelse af NGS -data med optisk genomkortlægning (OGM)
OGM vil blive brugt sammen med WGS til at forbedre diagnostikken hos 60 børn med alvorlige NDD'er, der mangler en molekylær diagnose efter indledende CMA- og Exome -analyser.
|
Efter at have identificeret kausal SV'er via OGM, vil WGS bestemme omarrangement breakpoints og undersøge nærliggende gener inden for 100 KB, der kan have ændret ekspression på grund af positionseffekter.
Efter genomiske karakteriseringsresultater udføres transkriptomanalyse på patient-afledte lymfoblastoid B-cellelinjer eller fibroblaster for at undersøge de molekylære implikationer af kandidat SV'er, der findes i OGM-analysen og identificere potentielle transkriptomabnormaliteter, såsom splejsningsvarianter, hos patienter med atypiske kliniske træk.
|
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Genotype-fænotype-korrelation
Tidsramme: En gang ved rekruttering
|
Antal patogene strukturelle varianter fundet ved OGM, der forklarer fænotypen
|
En gang ved rekruttering
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Sponsor
Sponsor
Datoer for undersøgelser
Studer store datoer
Studiestart (Faktiske)
Studiestart
Primær færdiggørelse (Anslået)
Primær færdiggørelse
Studieafslutning (Anslået)
Studieafslutning
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
Først indsendt
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først opslået (Faktiske)
Først opslået
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Faktiske)
Sidste opdatering sendt
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidst verificeret
Sidst verificeret
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Yderligere relevante MeSH-vilkår
Andre undersøgelses-id-numre
Andre undersøgelses-id-numre
- 1089
Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter
Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt
Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt
produkt fremstillet i og eksporteret fra U.S.A.
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .