Erweiterung von NGS -Daten mit optischer Genom Mapping (OGM) (OGM)
Erweiterung von NGS
Studienübersicht
Status
Status
Bedingungen
Bedingungen
Intervention / Behandlung
Intervention / Behandlung
Studientyp
Studientyp
Einschreibung (Geschätzt)
Einschreibung
Phase
Phase
- Unzutreffend
Kontakte und Standorte
Studienkontakt
Studienkontakt
- Name: Maria Clara Bonaglia PhD
- Telefonnummer: +39 031 877913
- E-Mail: mariaclara.bonaglia@lanostrafamiglia.it
Studienorte
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Lecco
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Bosisio Parini, Lecco, Italien, 23842
- Rekrutierung
- Cytogenetic Unit of Medical Genetic Laboratory
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Kontakt:
- Maria C Bonaglia, Master Degree
- Telefonnummer: +39 031877913
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Teilnahmekriterien
Zulassungskriterien
Zulassungskriterien
Studienberechtigtes Alter
- Kind
- Erwachsene
- Älterer Erwachsener
Akzeptiert gesunde Freiwillige
Beschreibung
Einschlusskriterien:
- Personen ohne molekulare Diagnose (negativ zu ES/CMA -Analysen);
- Personen mit genetischen Diagnosen, die nur eine Komponente ihres primären Phänotyps erklären;
- Personen, die eine oder mehrere Varianten von unsicherer klinischer Bedeutung tragen
- Personen mit einem Phänotyp, der hoch an klinisch und molekular gut definierte Syndrome (d. H. Marfan-Syndrom) erinnert, aber negativ auf routinemäßige molekulare Analyse.
Ausschlusskriterien:
- Personen, die keine anfänglichen diagnostischen Gentests durchgeführt haben (ES/CMA)
Studienplan
Wie ist die Studie aufgebaut?
Designdetails
- Hauptzweck: Diagnose
- Zuteilung: N / A
- Interventionsmodell: Einzelgruppenzuweisung
- Maskierung: Keine (Offenes Etikett)
Anzahl der Arme
Waffen und Interventionen
Teilnehmergruppe / ArmTeilnehmergruppe / Arm |
Intervention / BehandlungIntervention / Behandlung |
|---|---|
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Experimental: Erweiterung von NGS -Daten mit optischer Genom Mapping (OGM)
OGM wird neben WGS verwendet, um die Diagnostik bei 60 Kindern mit schwerem NDDs zu verbessern, denen nach anfänglichen CMA- und Exomanalysen eine molekulare Diagnose fehlt.
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Nach der Identifizierung von kausalen SVs über OGM bestimmen WGS die Umlagerungsbestandteile der Umlagerung und untersucht nahe gelegene Gene innerhalb von 100 kb, die die Expression aufgrund von Positionseffekten verändert haben.
Nach den genomischen Charakterisierungsergebnissen wird die Transkriptomanalyse an von Patienten abgeleiteten Lymphoblastoid-B-Zelllinien oder Fibroblasten durchgeführt, um die molekularen Implikationen von Kandidaten-SVs zu untersuchen, die in der OGM-Analyse gefunden wurden, und potenzielle Transkriptomanomalien wie Spleißvarianten bei Patienten mit atypischen klinischen Merkmalen zu identifizieren.
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Was misst die Studie?
Primäre Ergebnismessungen
Primäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
|---|---|---|
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Genotyp-Phänotyp-Korrelation
Zeitfenster: einmal bei der Rekrutierung
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Anzahl der durch OGM gefundenen pathogenen strukturellen Varianten, die den Phänotyp erklären
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einmal bei der Rekrutierung
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Mitarbeiter und Ermittler
Sponsor
Sponsor
Studienaufzeichnungsdaten
Haupttermine studieren
Studienbeginn (Tatsächlich)
Studienbeginn
Primärer Abschluss (Geschätzt)
Primärer Abschluss
Studienabschluss (Geschätzt)
Studienabschluss
Studienanmeldedaten
Zuerst eingereicht
Zuerst eingereicht
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
Zuerst gepostet (Tatsächlich)
Zuerst gepostet
Studienaufzeichnungsaktualisierungen
Letztes Update gepostet (Tatsächlich)
Letztes Update gepostet
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
Zuletzt verifiziert
Zuletzt verifiziert
Mehr Informationen
Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie
Zusätzliche relevante MeSH-Bedingungen
Andere Studien-ID-Nummern
Andere Studien-ID-Nummern
- 1089
Arzneimittel- und Geräteinformationen, Studienunterlagen
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Arzneimittelprodukt
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt
Produkt, das in den USA hergestellt und aus den USA exportiert wird
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