En retrospektiv undersøgelse af biomarkører i ikke-småcellet lungekræft

Formålet med denne undersøgelse er:

1. At karakterisere typerne og hyppigheden af ​​molekylære ændringer af epidermal vækstfaktorreceptor (EGFR) pathway, FGFR4 og EML-ALK hos asiatiske patienter med ikke-småcellet lungekræft
2. At identificere kandidatbiomarkører af betydning i EGFR- og østrogenvejene

De fleste, hvis ikke alle, humane maligniteter inklusive lungekræft er forårsaget af somatiske ændringer af genomet, hvilket fører til aktivering af onkogener eller inaktivering af tumorsuppressorgener og deres resulterende onkogene virkninger. Ud over mutationer er øget kromosomalt kopiantal (ved amplifikation eller polysomi) og DNA-methylering andre mekanismer for henholdsvis onkogenaktivering og tumorsuppressorgeninaktivering.

Lidt er kendt om forholdet mellem disse onkogener af EGFR-familien og de nyligt beskrevne onkogener FGFR4 og fusionsgenet EML4-ALK. Nylige data tyder på, at der findes molekylært definerede undergrupper af ikke-småcellet lungekræft (NSCLC) og kan bruges til at forudsige følsomhed over for målrettede midler (erlotinib eller gefitinib) eller cytotoksisk kemoterapi (pemetrexat, gemcitabin, platinmidler). Resultaterne af, at østrogenreceptorer er til stede i lungetumorer, og at østrogen kan stimulere vækst og spredning af lungecancere in vitro og in vivo er provokerende. Yderligere undersøgelser for at evaluere østrogeners og andre kønshormoners rolle i lungekræft er berettiget.

En yderligere forståelse af de molekylære indikatorer for lungekræftprognose og behandlingsforudsigelse ville forbedre lægemiddeludvikling og patientbehandlingsvalg.

Arkiveret paraffin-indlejret og frisk frosset NSCLC-tumorvæv vil blive opnået via henholdsvis Institut for Patologi og National University Tissue Repository. Klinisk-patologiske karakteristika vil blive indhentet fra case-journalerne, patologi og vævsdepot. DNA vil blive isoleret ved hjælp af standardteknikker. Sekventering af gener i EGFR-signalvejen: EGFR, KRAS, ErbB2, ErbB3, MET, PI3K og BRAF samt FGFR4. Ufarvede objektglas fra det paraffin-indlejrede væv vil blive opnået og udsat for fluorescerende in vitro hybridisering (FISH) for brudpunkter i EML4- og ALK-generne som tidligere beskrevet. For tilfælde, der er blevet lynfrosset, vil RNA blive ekstraheret, og EML4-ALK-fusioner vil blive bekræftet ved hjælp af RT-PCR og præspecificerede primere. For at analysere ekspressionen af ​​proteiner af formodet relevans for EGFR-funktion (såsom EGFR, ErbB2, ErbB3, AKT, MET, STAT, ERK, MAPK, cyclin D1, C/EBPa), nedstrøms effekter af EGFR: celleproliferation (Ki-67 ), angiogenese (CD34, VEGF-A), apoptose (bcl-2), metastase og hormonpåvirkning (østrogen- og progesteronreceptorer, aromatase), vil TMA-teknologi blive udnyttet. Status for tumorsuppressorgenerne PTEN og C/EBPa vil blive analyseret.