Ретроспективное исследование биомаркеров немелкоклеточного рака легкого

Цель этого исследования:

1. Охарактеризовать типы и частоту молекулярных изменений пути рецептора эпидермального фактора роста (EGFR), FGFR4 и EML-ALK у азиатских пациентов с немелкоклеточным раком легкого.
2. Чтобы определить важные биомаркеры-кандидаты в путях EGFR и эстрогена

Большинство, если не все, злокачественные новообразования человека, включая рак легкого, вызваны соматическими изменениями генома, приводящими к активации онкогенов или инактивации генов-супрессоров опухолей и их результирующим онкогенным эффектам. В дополнение к мутациям, увеличение числа копий хромосом (путем амплификации или полисомии) и метилирование ДНК являются другими механизмами активации онкогена и инактивации гена-супрессора опухоли соответственно.

Мало что известно о родстве между этими онкогенами семейства EGFR и недавно описанными онкогенами FGFR4 и слитым геном EML4-ALK. Последние данные свидетельствуют о том, что существуют молекулярно определенные подгруппы немелкоклеточного рака легкого (НМРЛ), которые можно использовать для прогнозирования чувствительности к таргетным агентам (эрлотиниб или гефитиниб) или цитотоксической химиотерапии (пеметрексат, гемцитабин, препараты платины). Выводы о том, что рецепторы эстрогена присутствуют в опухолях легких и что эстроген может стимулировать рост и пролиферацию рака легких in vitro и in vivo, являются провокационными. Необходимы дальнейшие исследования для оценки роли эстрогенов и других половых гормонов в развитии рака легких.

Дальнейшее понимание молекулярных показателей прогноза рака легкого и предсказания лечения улучшит разработку лекарств и выбор лечения для пациентов.

Архивная залитая в парафин и свежезамороженная опухолевая ткань НМРЛ будет получена соответственно через отделение патологии и репозиторий тканей Национального университета. Клинико-патологические характеристики будут получены из историй болезни, патологии и репозитория тканей. ДНК будет выделена с использованием стандартных методов. Секвенирование генов сигнального пути EGFR: EGFR, KRAS, ErbB2, ErbB3, MET, PI3K и BRAF, а также FGFR4. Неокрашенные слайды из ткани, залитой парафином, будут получены и подвергнуты флуоресцентной гибридизации in vitro (FISH) для точек разрыва в генах EML4 и ALK, как описано ранее. В случаях мгновенной заморозки будет извлечена РНК, а слияния EML4-ALK будут подтверждены с использованием RT-PCR и заранее определенных праймеров. Для анализа экспрессии белков, предположительно имеющих отношение к функции EGFR (таких как EGFR, ErbB2, ErbB3, AKT, MET, STAT, ERK, MAPK, циклин D1, C/EBPa), последующих эффектов EGFR: пролиферация клеток (Ki-67 ), ангиогенез (CD34, VEGF-A), апоптоз (bcl-2), метастазирование и гормональное влияние (рецепторы эстрогена и прогестерона, ароматаза), будет использоваться технология ТМА. Будет проанализировано состояние генов-супрессоров опухолей PTEN и C/EBPa.