Retrospektivní studie biomarkerů u nemalobuněčného karcinomu plic

Účelem této studie je:

1. Charakterizovat typy a frekvenci molekulárních změn dráhy receptoru epidermálního růstového faktoru (EGFR), FGFR4 a EML-ALK u asijských pacientů s nemalobuněčným karcinomem plic
2. Identifikovat kandidátní biomarkery důležité v EGFR a estrogenových drahách

Většina, ne-li všechny, lidských malignit včetně rakoviny plic je způsobena somatickými změnami genomu, které vedou k aktivaci onkogenů nebo inaktivaci tumor supresorových genů a jejich výsledným onkogenním účinkům. Kromě mutací jsou dalšími mechanismy aktivace onkogenu, respektive inaktivace tumor supresorového genu, zvýšený počet chromozomálních kopií (amplifikací nebo polysomií) a metylace DNA.

O vztahu mezi těmito onkogeny rodiny EGFR a nedávno popsanými onkogeny FGFR4 a fúzním genem EML4-ALK je známo jen málo. Nedávné údaje naznačují, že existují molekulárně definované podskupiny nemalobuněčného karcinomu plic (NSCLC) a lze je použít k predikci citlivosti na cílená léčiva (erlotinib nebo gefitinib) nebo cytotoxickou chemoterapii (pemetrexát, gemcitabin, platina). Zjištění, že estrogenové receptory jsou přítomny v plicních nádorech a že estrogen může stimulovat růst a proliferaci rakoviny plic in vitro a in vivo, jsou provokativní. Další studie k vyhodnocení role estrogenů a dalších pohlavních hormonů u rakoviny plic jsou opodstatněné.

Další pochopení molekulárních indikátorů prognózy rakoviny plic a predikce léčby by zlepšilo vývoj léků a výběr léčby pacientů.

Archivovaná a čerstvě zmrazená nádorová tkáň NSCLC zalitá v parafínu bude získána prostřednictvím Ústavu patologie a Národního univerzitního tkáňového úložiště. Klinicko-patologické charakteristiky budou získány ze záznamů případů, Patologie a Tkáňového úložiště. DNA bude izolována pomocí standardních technik. Sekvenování genů v signální dráze EGFR: EGFR, KRAS, ErbB2, ErbB3, MET, PI3K a BRAF a také FGFR4. Budou získána neobarvená sklíčka z tkáně zalité v parafínu a podrobena fluorescenční in vitro hybridizaci (FISH) pro body zlomu v genech EML4 a ALK, jak bylo popsáno dříve. U případů, které byly bleskově zmraženy, bude RNA extrahována a fúze EML4-ALK budou potvrzeny pomocí RT-PCR a předem specifikovaných primerů. Pro analýzu exprese proteinů domnělého významu pro funkci EGFR (jako je EGFR, ErbB2, ErbB3, AKT, MET, STAT, ERK, MAPK, cyklin D1, C/EBPa), následné účinky EGFR: buněčná proliferace (Ki-67 ), angiogeneze (CD34, VEGF-A), apoptóza (bcl-2), metastázy a hormonální ovlivnění (estrogenové a progesteronové receptory, aromatáza), technologie TMA. Bude analyzován stav tumor supresorových genů PTEN a C/EBPa.