En retrospektiv studie av biomarkører i ikke-småcellet lungekreft

Hensikten med denne studien er:

1. Å karakterisere typene og frekvensen av molekylære endringer i epidermal vekstfaktorreseptor (EGFR), FGFR4 og EML-ALK hos asiatiske pasienter med ikke-småcellet lungekreft
2. For å identifisere kandidatbiomarkører av betydning i EGFR og østrogenveier

De fleste, om ikke alle, menneskelige maligniteter inkludert lungekreft er forårsaket av somatiske endringer i genomet, noe som fører til aktivering av onkogener eller inaktivering av tumorsuppressorgener og deres resulterende onkogene effekter. I tillegg til mutasjoner er økt kromosomalt kopiantall (ved amplifikasjon eller polysomi) og DNA-metylering andre mekanismer for henholdsvis onkogenaktivering og tumorsuppressorgeninaktivering.

Lite er kjent om forholdet mellom disse onkogenene i EGFR-familien og de nylig beskrevne onkogenene FGFR4 og fusjonsgenet EML4-ALK. Nyere data tyder på at det eksisterer molekylært definerte undergrupper av ikke-småcellet lungekreft (NSCLC) og kan brukes til å forutsi følsomhet overfor målrettede midler (erlotinib eller gefitinib) eller cytotoksisk kjemoterapi (pemetrexat, gemcitabin, platinamidler). Funnene om at østrogenreseptorer er tilstede i lungesvulster og at østrogen kan stimulere vekst og spredning av lungekreft in vitro og in vivo er provoserende. Ytterligere studier for å evaluere rollen til østrogener og andre kjønnshormoner i lungekreft er berettiget.

En ytterligere forståelse av de molekylære indikatorene for lungekreftprognose og behandlingsprediksjon vil forbedre medikamentutvikling og pasientbehandlingsvalg.

Arkivert parafininnstøpt og ferskfrosset NSCLC-svulstvev vil bli skaffet via henholdsvis Institutt for patologi og National University Tissue Repository. Klinisk-patologiske karakteristika vil bli hentet fra saksjournalen, patologi og vevsdepot. DNA vil bli isolert ved bruk av standardteknikker. Sekvensering av gener i EGFR-signalveien: EGFR, KRAS, ErbB2, ErbB3, MET, PI3K og BRAF samt FGFR4. Ufargede objektglass fra det parafininnstøpte vevet vil bli oppnådd og utsatt for fluorescerende in vitro hybridisering (FISH) for bruddpunkter i EML4- og ALK-genene som tidligere beskrevet. For tilfeller som har blitt hurtigfrosset, vil RNA ekstraheres og EML4-ALK-fusjoner vil bli bekreftet ved bruk av RT-PCR og forhåndsspesifiserte primere. For å analysere uttrykket av proteiner av antatt relevans for EGFR-funksjon (som EGFR, ErbB2, ErbB3, AKT, MET, STAT, ERK, MAPK, cyclin D1, C/EBPa), nedstrømseffekter av EGFR: celleproliferasjon (Ki-67 ), angiogenese (CD34, VEGF-A), apoptose (bcl-2), metastaser og hormonell påvirkning (østrogen- og progesteronreseptorer, aromatase), TMA-teknologi vil bli utnyttet. Status for tumorsuppressorgenene PTEN og C/EBPa vil bli analysert.