Une étude rétrospective des biomarqueurs dans le cancer du poumon non à petites cellules

Le but de cette étude est :

1. Caractériser les types et la fréquence des altérations moléculaires de la voie du récepteur du facteur de croissance épidermique (EGFR), du FGFR4 et de l'EML-ALK chez les patients asiatiques atteints d'un cancer du poumon non à petites cellules
2. Identifier des biomarqueurs candidats importants dans les voies de l'EGFR et des œstrogènes

La plupart, sinon la totalité, des tumeurs malignes humaines, y compris le cancer du poumon, sont causées par des altérations somatiques du génome, entraînant l'activation d'oncogènes ou l'inactivation de gènes suppresseurs de tumeurs et leurs effets oncogènes résultants. En plus des mutations, l'augmentation du nombre de copies chromosomiques (par amplification ou polysomie) et la méthylation de l'ADN sont respectivement d'autres mécanismes d'activation des oncogènes et d'inactivation des gènes suppresseurs de tumeurs.

On sait peu de choses sur la relation entre ces oncogènes de la famille EGFR et les oncogènes récemment décrits FGFR4 et le gène de fusion EML4-ALK. Des données récentes suggèrent que des sous-groupes moléculairement définis de cancer du poumon non à petites cellules (NSCLC) existent et peuvent être utilisés pour prédire la sensibilité aux agents ciblés (erlotinib ou gefitinib) ou à la chimiothérapie cytotoxique (pemetrexate, gemcitabine, agents à base de platine). Les découvertes selon lesquelles les récepteurs des œstrogènes sont présents dans les tumeurs pulmonaires et que les œstrogènes peuvent stimuler la croissance et la prolifération des cancers du poumon in vitro et in vivo sont provocantes. D'autres études pour évaluer le rôle des œstrogènes et d'autres hormones sexuelles dans le cancer du poumon sont justifiées.

Une meilleure compréhension des indicateurs moléculaires du pronostic du cancer du poumon et de la prédiction du traitement améliorerait le développement de médicaments et la sélection du traitement des patients.

Les tissus tumoraux NSCLC archivés inclus dans la paraffine et frais congelés seront obtenus respectivement via le Département de pathologie et le National University Tissue Repository. Les caractéristiques clinico-pathologiques seront obtenues à partir des dossiers de cas, de la pathologie et du dépôt de tissus. L'ADN sera isolé en utilisant des techniques standards. Séquençage des gènes de la voie de signalisation EGFR : EGFR, KRAS, ErbB2, ErbB3, MET, PI3K et BRAF ainsi que FGFR4. Des lames non colorées du tissu inclus en paraffine seront obtenues et soumises à une hybridation in vitro fluorescente (FISH) pour les points de rupture dans les gènes EML4 et ALK, comme décrit précédemment. Pour les cas qui ont été congelés instantanément, l'ARN sera extrait et les fusions EML4-ALK seront confirmées à l'aide de la RT-PCR et d'amorces pré-spécifiées. Pour analyser l'expression de protéines potentiellement pertinentes pour la fonction EGFR (telles que EGFR, ErbB2, ErbB3, AKT, MET, STAT, ERK, MAPK, cycline D1, C/EBPa), les effets en aval de l'EGFR : prolifération cellulaire (Ki-67 ), l'angiogenèse (CD34, VEGF-A), l'apoptose (bcl-2), les métastases et l'influence hormonale (récepteurs des œstrogènes et de la progestérone, aromatase), la technologie TMA sera utilisée. Le statut des gènes suppresseurs de tumeurs PTEN et C/EBPa sera analysé.