Een retrospectieve studie van biomarkers bij niet-kleincellige longkanker

Het doel van deze studie is:

1. Karakteriseren van de typen en frequentie van moleculaire veranderingen in de epidermale groeifactorreceptor (EGFR)-route, FGFR4 en EML-ALK bij Aziatische patiënten met niet-kleincellige longkanker
2. Kandidaat-biomarkers identificeren die van belang zijn in de EGFR- en oestrogeenroutes

De meeste, zo niet alle, maligniteiten bij de mens, waaronder longkanker, worden veroorzaakt door somatische veranderingen van het genoom, wat leidt tot activering van oncogenen of inactivering van tumorsuppressorgenen en de daaruit voortvloeiende oncogene effecten. Naast mutaties zijn een verhoogd aantal chromosomale kopieën (door amplificatie of polysomie) en DNA-methylatie andere mechanismen van respectievelijk oncogenactivering en tumorsuppressorgen.

Er is weinig bekend over de relatie tussen deze oncogenen van de EGFR-familie en de recent beschreven oncogenen FGFR4 en het fusiegen EML4-ALK. Recente gegevens suggereren dat er moleculair gedefinieerde subgroepen van niet-kleincellige longkanker (NSCLC) bestaan ​​en deze kunnen worden gebruikt om de gevoeligheid voor gerichte middelen (erlotinib of gefitinib) of cytotoxische chemotherapie (pemetrexaat, gemcitabine, platinamiddelen) te voorspellen. De bevindingen dat oestrogeenreceptoren aanwezig zijn in longtumoren en dat oestrogeen de groei en proliferatie van longkankers in vitro en in vivo kan stimuleren, zijn provocerend. Verdere studies om de rol van oestrogenen en andere geslachtshormonen bij longkanker te evalueren zijn gerechtvaardigd.

Een beter begrip van de moleculaire indicatoren van de prognose van longkanker en de voorspelling van de behandeling zou de ontwikkeling van geneesmiddelen en de selectie van patiëntenbehandelingen verbeteren.

Gearchiveerd in paraffine ingebed en vers ingevroren NSCLC-tumorweefsel zal worden verkregen via respectievelijk de afdeling Pathologie en de National University Tissue Repository. Klinisch-pathologische kenmerken zullen worden verkregen uit de dossiers, Pathologie en Tissue Repository. DNA zal worden geïsoleerd met behulp van standaard technieken. Sequentiebepaling van genen in de EGFR-signaalroute: EGFR, KRAS, ErbB2, ErbB3, MET, PI3K en BRAF evenals FGFR4. Ongekleurde objectglaasjes van het in paraffine ingebedde weefsel zullen worden verkregen en onderworpen aan fluorescerende in vitro hybridisatie (FISH) voor breekpunten in de EML4- en ALK-genen, zoals eerder beschreven. Voor gevallen die snel zijn ingevroren, wordt RNA geëxtraheerd en worden EML4-ALK-fusies bevestigd met behulp van RT-PCR en vooraf gespecificeerde primers. Om de expressie te analyseren van eiwitten die vermoedelijk relevant zijn voor de EGFR-functie (zoals EGFR, ErbB2, ErbB3, AKT, MET, STAT, ERK, MAPK, cycline D1, C/EBPa), stroomafwaartse effecten van EGFR: celproliferatie (Ki-67 ), angiogenese (CD34, VEGF-A), apoptose (bcl-2), metastase en hormonale invloed (oestrogeen- en progesteronreceptoren, aromatase), zal TMA-technologie worden gebruikt. De status van de tumorsuppressorgenen PTEN en C/EBPa zal worden geanalyseerd.