Retrospektywne badanie biomarkerów w niedrobnokomórkowym raku płuca

Celem tego badania jest:

1. Charakterystyka typów i częstości zmian molekularnych szlaku receptora naskórkowego czynnika wzrostu (EGFR), FGFR4 i EML-ALK u azjatyckich pacjentów z niedrobnokomórkowym rakiem płuca
2. Identyfikacja potencjalnych biomarkerów ważnych w szlakach EGFR i estrogenów

Większość, jeśli nie wszystkie, nowotworów złośliwych u ludzi, w tym raka płuc, jest spowodowana somatycznymi zmianami genomu, prowadzącymi do aktywacji onkogenów lub inaktywacji genów supresorowych nowotworów i wynikających z nich skutków onkogennych. Oprócz mutacji, zwiększona liczba kopii chromosomów (poprzez amplifikację lub polisomię) i metylacja DNA to inne mechanizmy odpowiednio aktywacji onkogenu i inaktywacji genu supresorowego guza.

Niewiele wiadomo na temat związku między tymi onkogenami z rodziny EGFR a niedawno opisanymi onkogenami FGFR4 i genem fuzyjnym EML4-ALK. Ostatnie dane sugerują, że istnieją molekularnie zdefiniowane podgrupy niedrobnokomórkowego raka płuca (NSCLC), które można wykorzystać do przewidywania wrażliwości na leki celowane (erlotynib lub gefitynib) lub chemioterapię cytotoksyczną (pemetreksat, gemcytabina, leki platynowe). Odkrycia, że ​​receptory estrogenowe są obecne w guzach płuc i że estrogen może stymulować wzrost i proliferację raka płuc in vitro i in vivo, są prowokacyjne. Uzasadnione są dalsze badania oceniające rolę estrogenów i innych hormonów płciowych w raku płuc.

Dalsze zrozumienie molekularnych wskaźników prognozowania raka płuc i przewidywania leczenia poprawiłoby opracowywanie leków i wybór leczenia dla pacjentów.

Zarchiwizowane zatopione w parafinie i świeżo zamrożone tkanki nowotworowe NSCLC zostaną pozyskane odpowiednio za pośrednictwem Departamentu Patologii i National University Tissue Repository. Charakterystyka kliniczno-patologiczna zostanie uzyskana z rejestrów przypadków, patologii i repozytorium tkanek. DNA zostanie wyizolowane przy użyciu standardowych technik. Sekwencjonowanie genów szlaku sygnałowego EGFR: EGFR, KRAS, ErbB2, ErbB3, MET, PI3K i BRAF oraz FGFR4. Niezabarwione szkiełka z tkanki zatopionej w parafinie zostaną uzyskane i poddane fluorescencyjnej hybrydyzacji in vitro (FISH) pod kątem punktów przerwania w genach EML4 i ALK, jak opisano wcześniej. W przypadku przypadków, które zostały szybko zamrożone, RNA zostanie wyekstrahowane, a fuzje EML4-ALK zostaną potwierdzone przy użyciu RT-PCR i wcześniej określonych starterów. Aby przeanalizować ekspresję białek o przypuszczalnym znaczeniu dla funkcji EGFR (takich jak EGFR, ErbB2, ErbB3, AKT, MET, STAT, ERK, MAPK, cyklina D1, C/EBPa), dalsze skutki EGFR: proliferacja komórek (Ki-67 ), angiogenezy (CD34, VEGF-A), apoptozy (bcl-2), przerzutów oraz wpływu hormonalnego (receptory estrogenowe i progesteronowe, aromataza), wykorzystana zostanie technologia TMA. Zbadany zostanie status genów supresorowych nowotworów PTEN i C/EBPa.