Genommiljø mikrobiom og metabolom i autismeundersøgelse (GEMMA)

GEMMA-undersøgelsen vil behandle genomiske, miljømæssige, mikrobiome og metabolomiske faktorer, der kan påvirke udviklingen af ​​autismespektrumforstyrrelser (ASD).

Genom: Projektet vil studere børn, der har en førstegradsslægtning (søskende) med ASD, så efterforskere kan forstå, hvordan deres gener kan bidrage til, om de udvikler ASD eller ej. En række genetiske varianter identificeret til dato forekommer i gener, der koder for glycosylerede ekstracellulære proteiner og i enzymer, der er direkte involveret i glycosylering. Efterforskere vil udføre hele genomsekventering i den undergruppe af børn, der vil udvikle ASD for at lære mere om disse specifikke gener og også for at identificere andre gener, der kan være involveret i ASD-patogenese. Det genetiske variantlandskab vil blive kortlagt, og varianter vil blive kommenteret og fortolket baseret på al tilgængelig kontekstuel information. Denne indsats vil muliggøre identifikation af patient- og kohortespecifikke variationer, som derefter kan forfines yderligere til biomarkørsignaturer og optimeres til prædiktive og diagnostiske markører for ASD.

Miljø: Når spædbørn tilmelder sig undersøgelsen, vil efterforskerne registrere oplysninger om deres miljø, herunder om de er født vaginalt eller ved kejsersnit, og om de har modtaget antibiotika. Over tid vil efterforskere også overveje andre dele af spædbarnets medicinske, kost- og sociale historie, herunder fodringsmodalitet (amning versus modermælkserstatning), sygdomme, infektioner, antibiotikabrug, kost og vækst for at forstå, om nogen af ​​disse oplysninger er relateret til ASD-udvikling . Disse data vil blive opdateret månedligt, indtil hvert tilmeldt spædbarn fylder 3 år, hvilket giver en værdifuld samling af information, der vil give indsigt i, hvordan miljøændringer påvirker, om barnet udvikler ASD eller ej.

Mikrobiom: Den menneskelige tarm, kompromitteret af tynd- og tyktarmen, er hjemsted for mange typer bakterier. Disse bakterier hjælper med at nedbryde og fordøje mad, give kroppen energi og lave vitaminer, som kroppen har brug for for at trives. Dette mangfoldige samfund af bakterier kaldes tarmmikrobiomet, som er kendt for at spille en stor rolle i udviklingen af ​​immunsystemet. Et hovedmål med GEMMA-studiet er at forstå, hvordan mikrobiomet påvirkes af faktorer som fødeindtagelse eller antibiotika, og hvordan dette kan påvirke udviklingen af ​​ASD. Efterforskere håber at lære mere om dette forhold ved at studere medlemmerne af tarmmikrobiomet før og efter autismeudvikling i undergruppen af ​​tilmeldte spædbørn, som vil udvikle ASD. Projektet vil sammenligne mikrobiota af ASD-børn med og uden GI-symptomer for at bestemme, om forskellig mikrobiotasammensætning og differentielt udtrykt bakteriel genom forstyrrer tarmbarrierefunktionen og immunresponset, hvilket fører til ASD hos spædbørn i genetisk risiko. Ved at gøre dette vil projektet afdække mønstre i tarmmikrobiomet, der kan hjælpe forskere med at forudsige, hvem der vil udvikle ASD, før det sker.

Metabolom: De processer, der sker i tarmen, såsom fordøjelse af fødevarer og produktion af vitaminer, skaber produkter, der kaldes metabolitter. De specifikke metabolitter, som mennesker producerer, er forskellige fra person til person og afhænger af mange faktorer, herunder gener, medlemmer af tarmmikrobiomet og fødevarevalg. Samlingen af ​​metabolitter produceret af en prøve kaldes metabolomet. Projektet vil studere metabolomerne hos forskellige spædbørn, mens man noterer sig eventuelle ændringer i deres miljø og overvåger dem for ASD. At studere metabolitterne på denne måde kaldes metabolomics. Ved at gøre dette håber efterforskerne at finde mønstre eller specifikke metabolomiske profiler, der kan forudsige, hvornår nogen kan udvikle ASD, før det sker.