Analyse af molekylære biomarkører i periokulære adnexale tumorer

Formålet med denne forskning er prospektivt og retrospektivt at indsamle talgkarcinomer fra Fondazione Policlinico Gemelli, undersøge dem immunopatologisk og morfologisk og etablere en sammenhæng mellem disse karakteristika og molekylærgenetiske faktorer. Udførelse af denne forskning vil bidrage til at belyse og fremme en multidisciplinær terapeutisk-diagnostisk vej. Undersøgelsen vil anvende kirurgiske prøver, uanset sygdomsstadiet, som er blevet formalinfikseret og paraffinindlejret. Disse prøver blev tidligere indsamlet til klinisk praksis på Ocular Oncology of Fondazione Policlinico A. Gemelli IRCCS. Patienternes informerede samtykke vedrørende brugen af ​​disse prøver til forskningsformål blev opnået på forhånd. Hver prøve vil blive udsat for en omfattende mikroskopisk undersøgelse, efterfulgt af ved præcis underklassificering i overensstemmelse med WHO-klassifikationen og immunfænotypisk karakterisering. En udtømmende samling af konventionelt standardiserede histopatologiske prognostiske attributter for talgkarcinomer vil blive kompileret. Herefter sendes vævsprøver til enkelt og/eller flere IHC. Tumorvæv vil blive udsat for automatiseret digital kvantificering i forbindelse med multiparametrisk cellelinjeevaluering. Integrering af IHC med digital automatisering af analyse. Exome-sekventering vil blive udført på DNA ekstraheret fra paraffin-indlejrede snit for at påvise varianter, der er specifikke for tumorer.

For hver tumor vil tre til ni sektioner (10 mikrometer i tykkelse) blive brugt som DNA-kilde. Efter identifikation og adskillelse af tumorvæv fra normalt væv af patologen, vil de to DNA'er blive sekventeret uafhængigt. Der vil blive foretaget en sammenligning mellem varianter afledt af tumor og normalt væv, med kontrasterende resultater. Forventede resultater omfatter 1) somatiske eller tumorspecifikke varianter, som ikke findes i sundt væv, og 2) varianter, der går tabt under udviklingen af ​​tumoren som følge af segmentel kromosomal deletion eller andre mekanismer, der inducerer heterozygositetstab. I projektets prospektive fase vil nyudviklede tumorer blive bevaret. Ydermere vil denne ressource lette methylomanalysen, som er et supplement til exomanalysen.