Analyysi molekyylibiomarkkereista periokulaarisissa adnexaalisissa kasvaimissa
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Yksityiskohtainen kuvaus
Tämän tutkimuksen tarkoituksena on kerätä prospektiivisesti ja retrospektiivisesti talisyöpää Fondazione Policlinico Gemellista, tutkia niitä immunopatologisesti ja morfologisesti sekä selvittää näiden ominaisuuksien ja molekyyligeneettisten tekijöiden välinen korrelaatio. Tämän tutkimuksen suorittaminen edistää monitieteisen terapeuttis-diagnostisen polun selvittämistä ja edistämistä. Tutkimuksessa käytetään sairauden vaiheesta riippumatta kirurgisia näytteitä, jotka on kiinnitetty formaliinilla ja upotettu parafiiniin. Nämä näytteet kerättiin aiemmin kliinistä käytäntöä varten Fondazione Policlinico A. Gemelli IRCCS:n silmäonkologiassa. Potilaiden tietoinen suostumus näiden näytteiden käyttöön tutkimustarkoituksiin hankittiin etukäteen. Jokaiselle näytteelle tehdään kattava mikroskooppinen tutkimus, jota seurataan. tarkalla alaluokituksella WHO:n luokituksen ja immunofenotyyppisen karakterisoinnin mukaisesti. Kootaan kattava kokoelma talikarsinoomien tavanomaisesti standardoituja histopatologisia prognostisia ominaisuuksia. Tämän jälkeen kudosnäytteet lähetetään yksittäistä ja/tai useampaa IHC:tä varten. Kasvainkudoksille suoritetaan automaattinen digitaalinen kvantifiointi moniparametrisen solulinjan arvioinnin yhteydessä. IHC:n integrointi digitaaliseen analyysiautomaatioon. Eksomisekvensointi suoritetaan DNA:lle, joka on uutettu parafiiniin upotetuista osista, jotta voidaan havaita kasvaimille spesifisiä variantteja.
Jokaisen kasvaimen kohdalla käytetään DNA-lähteenä kolmesta yhdeksään leikkettä (paksuus 10 mikrometriä). Sen jälkeen kun patologi on tunnistanut ja erottanut kasvainkudoksen normaalikudoksesta, kaksi DNA:ta sekvensoidaan itsenäisesti. Kasvaimesta ja normaalikudoksesta johdettujen varianttien välillä tehdään vertailu, jolloin tulokset ovat ristiriidassa. Odotettuja tuloksia ovat 1) somaattiset tai kasvainspesifiset variantit, joita ei esiinny terveessä kudoksessa, ja 2) variantit, jotka menetetään kasvaimen evoluution aikana segmentaalisen kromosomaalisen deleetion tai muiden heterotsygoottisuuden menetystä aiheuttavien mekanismien seurauksena. Hankkeen tulevassa vaiheessa säilytetään vasta kehittyneet kasvaimet. Lisäksi tämä resurssi helpottaa metylomianalyysiä, joka on eksomianalyysin lisäksi.
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Arvioitu)
Vaihe
- Ei sovellettavissa
Yhteystiedot ja paikat
Opiskelupaikat
-
-
Rome
-
Roma, Rome, Italia, 00168
- Rekrytointi
- Gustavo Savino
-
Ottaa yhteyttä:
- Gustavo Savino, MD
- Puhelinnumero: 0630154528
- Sähköposti: oncologiaoculare@policlinicogemelli.it
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
- Aikuinen
- Vanhempi Aikuinen
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- Ikä 18 vuotta tai vanhempi;
- Silmän lisäosan talipitoisen Ca:n diagnoosi
- Kyky saada formaliinilla kiinnitettyä ja parafiiniin upotettua primaarista ja/tai metastaattista kasvainkudosta (FFPE) ja tervettä kudosta
- Primaarisen ja/tai metastaattisen kasvainkudoksen saatavuus parafiiniin upotetussa tai OCT:ssä (potentiaalinen osa) ja terveessä kudoksessa
- Kirjallinen tietoinen suostumus tietojen käyttöön tutkimustarkoituksiin.
Poissulkemiskriteerit:
- Ikä < 18 vuotta;
- Riittävien kliinisten tietojen puute valituista potilaista.
- Kasvaimen ja/tai metastaattisen kudoksen puute kerosiinissa tai OCT:ssä.
- Kieltäytyminen tietoisen suostumuksen antamisesta tietojen käsittelyyn tutkimustarkoituksiin.
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
- Ensisijainen käyttötarkoitus: Diagnostiikka
- Jako: Ei käytössä
- Inventiomalli: Yksittäinen ryhmätehtävä
- Naamiointi: Ei mitään (avoin tarra)
Aseet ja interventiot
Osallistujaryhmä / Arm |
Interventio / Hoito |
|---|---|
|
Kokeellinen: Potilaat, joilla on diagnosoitu silmän lisäosan talipitoinen Ca.
aikuispotilailla, joilla on diagnosoitu silmän lisäosan talipitoinen Ca.
|
Jokaisen kasvaimen DNA:n lähteenä käytetään kolmesta yhdeksään leikettä.
Patologi tunnistaa ja erottaa kasvainkudoksen normaalista kudoksesta, ja kaksi DNA:ta sekvensoidaan erikseen.
Kasvaimesta ja normaalikudoksesta saatuja muunnelmia verrataan eri tuloksin.
Tällä tavalla odotetaan 1) somaattisia/kasvainspesifisiä variantteja (jotka puuttuvat normaalista kudoksesta), 2) variantteja, jotka ovat kadonneet kasvaimen evoluution aikana segmentaalisen kromosomaalisen deleetion tai muiden mekanismien vuoksi, jotka aiheuttavat heterotsygoottisuuden menetystä.
Näitä kahta muunnelmaluokkaa käyttämällä sekvensointiprojektin lopussa suoritetaan klusterointianalyysi kasvainten fenotyypin ja molekyylien "allekirjoituksen" määrittämiseksi paremmin.
Projektin tulevassa osassa uudet kasvaimet pakastetaan tuoreina.
Tämä resurssi mahdollistaa metyloomaanalyysin suorittamisen.
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Eri molekyylien pitoisuus mikroskooppisessa ja immunofenotyyppianalyysissä
Aikaikkuna: 1 vuosi
|
Sen jälkeen kudosnäytteet lähetetään yksittäiseen ja/tai useaan immunohistokemiaan.
|
1 vuosi
|
Toissijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Somaattisten varianttien määrä, heterotsygoottisuuden menettäneet variantit, globaali mutaatiosignatuuri ja todennäköisten kuljettajamutaatioiden tunnistaminen
Aikaikkuna: 1 vuosi
|
Somaattisten varianttien määrä, heterotsygoottisuuden menettäneet variantit, globaali mutaatiosignatuuri ja todennäköisten kuljettajamutaatioiden tunnistaminen eksomi-sekvensoinnilla;
|
1 vuosi
|
|
Histopatologisten ominaisuuksien korrelaatioiden määrä kasvaimen DNA-varianttien ja sairauden vaiheen kanssa.
Aikaikkuna: 2 vuotta
|
Korrelaatioiden määrä histopatologisten piirteiden ja kasvaimen DNA-varianttien ja sairauden vaiheen välillä.
|
2 vuotta
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä
Yleiset julkaisut
- Prieto-Granada C, Rodriguez-Waitkus P. Sebaceous Carcinoma of the Eyelid. Cancer Control. 2016 Apr;23(2):126-32. doi: 10.1177/107327481602300206.
- Owen JL, Kibbi N, Worley B, Kelm RC, Wang JV, Barker CA, Behshad R, Bichakjian CK, Bolotin D, Bordeaux JS, Bradshaw SH, Cartee TV, Chandra S, Cho NL, Choi JN, Council ML, Demirci H, Eisen DB, Esmaeli B, Golda N, Huang CC, Ibrahim SF, Jiang SB, Kim J, Kuzel TM, Lai SY, Lawrence N, Lee EH, Leitenberger JJ, Maher IA, Mann MW, Minkis K, Mittal BB, Nehal KS, Neuhaus IM, Ozog DM, Petersen B, Rotemberg V, Samant S, Samie FH, Servaes S, Shields CL, Shin TM, Sobanko JF, Somani AK, Stebbins WG, Thomas JR, Thomas VD, Tse DT, Waldman AH, Wong MK, Xu YG, Yu SS, Zeitouni NC, Ramsay T, Reynolds KA, Poon E, Alam M. Sebaceous carcinoma: evidence-based clinical practice guidelines. Lancet Oncol. 2019 Dec;20(12):e699-e714. doi: 10.1016/S1470-2045(19)30673-4.
- Alfaar AS, Suckert CN, Rehak M, Girbardt C. The epidemiology of adults' eyelid malignancies in Germany between 2009 and 2015; An analysis of 42,710 patients' data. Eur J Ophthalmol. 2022 Nov 4;33(2):11206721221125018. doi: 10.1177/11206721221125018. Online ahead of print.
- Tryggvason G, Bayon R, Pagedar NA. Epidemiology of sebaceous carcinoma of the head and neck: implications for lymph node management. Head Neck. 2012 Dec;34(12):1765-8. doi: 10.1002/hed.22009. Epub 2012 Jan 20.
- Gauthier AS, Campolmi N, Tumahai P, Kantelip B, Delbosc B. Sebaceous carcinoma of the eyelid and Muir-Torre syndrome. JAMA Ophthalmol. 2014 Aug;132(8):1025-8. doi: 10.1001/jamaophthalmol.2014.1026. No abstract available.
- Ferreira I, Wiedemeyer K, Demetter P, Adams DJ, Arends MJ, Brenn T. Update on the pathology, genetics and somatic landscape of sebaceous tumours. Histopathology. 2020 Apr;76(5):640-649. doi: 10.1111/his.14044. Epub 2020 Mar 17.
- Jagan L, Zoroquiain P, Bravo-Filho V, Logan P, Qutub M, Burnier MN Jr. Sebaceous adenomas of the eyelid and Muir-Torre Syndrome. Br J Ophthalmol. 2015 Jul;99(7):909-13. doi: 10.1136/bjophthalmol-2014-305873. Epub 2015 Jan 16.
- Yeatts RP, Waller RR. Sebaceous carcinoma of the eyelid: pitfalls in diagnosis. Ophthalmic Plast Reconstr Surg. 1985;1(1):35-42. doi: 10.1097/00002341-198501000-00006.
- Orr CK, Yazdanie F, Shinder R. Current review of sebaceous cell carcinoma. Curr Opin Ophthalmol. 2018 Sep;29(5):445-450. doi: 10.1097/ICU.0000000000000505.
- Kumar T, Tewari P, Khanna N, Surabhi, Bharti S, Sinha R, Bhadani PP. Cytomorphology of sebaceous carcinoma of the eyelid: A short series of three cases with literature review. Diagn Cytopathol. 2022 Dec;50(12):E361-E366. doi: 10.1002/dc.25029. Epub 2022 Aug 6.
- Tetzlaff MT, Curry JL, Ning J, Sagiv O, Kandl TL, Peng B, Bell D, Routbort M, Hudgens CW, Ivan D, Kim TB, Chen K, Eterovic AK, Shaw K, Prieto VG, Yemelyanova A, Esmaeli B. Distinct Biological Types of Ocular Adnexal Sebaceous Carcinoma: HPV-Driven and Virus-Negative Tumors Arise through Nonoverlapping Molecular-Genetic Alterations. Clin Cancer Res. 2019 Feb 15;25(4):1280-1290. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-18-1688. Epub 2018 Nov 12.
- McGrath LA, Currie ZI, Mudhar HS, Tan JHY, Salvi SM. Management of recurrent sebaceous gland carcinoma. Eye (Lond). 2020 Sep;34(9):1685-1692. doi: 10.1038/s41433-019-0756-9. Epub 2020 Jan 2.
- Magazin M, Dalvin LA, Salomao DR, Castner NB, Halbach C, Tooley AA. Sebaceous Carcinoma of the Eyelid: Proposed Nomenclature for Multifocal and Multicentric Disease. Ophthalmic Plast Reconstr Surg. 2023 Mar-Apr 01;39(2):117-122. doi: 10.1097/IOP.0000000000002281. Epub 2022 Oct 20.
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Ensisijainen valmistuminen (Arvioitu)
Opintojen valmistuminen (Arvioitu)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- 5896
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .