Analyse van moleculaire biomarkers in perioculaire adnexale tumoren

Het doel van dit onderzoek is om prospectief en retrospectief talgcarcinomen van de Fondazione Policlinico Gemelli te verzamelen, deze immunopathologisch en morfologisch te onderzoeken en een correlatie vast te stellen tussen deze kenmerken en moleculair genetische factoren. Het uitvoeren van dit onderzoek zal bijdragen aan de opheldering en bevordering van een multidisciplinair therapeutisch-diagnostisch traject. Bij het onderzoek zal gebruik worden gemaakt van chirurgische specimens, ongeacht het stadium van de ziekte, die in formaline zijn gefixeerd en in paraffine zijn ingebed. Deze monsters werden eerder verzameld voor de klinische praktijk bij de Oculaire Oncologie van Fondazione Policlinico A. Gemelli IRCCS. De geïnformeerde toestemming van de patiënten met betrekking tot het gebruik van deze monsters voor onderzoeksdoeleinden werd vooraf verkregen. Elk monster zal worden onderworpen aan een uitgebreid microscopisch onderzoek, gevolgd door nauwkeurige subclassificatie in overeenstemming met de WHO-classificatie en immunofenotypische karakterisering. Er zal een uitgebreide verzameling van conventioneel gestandaardiseerde histopathologische prognostische kenmerken voor talgcarcinomen worden samengesteld. Hierna worden weefselmonsters verzonden voor enkele en/of meervoudige IHC. Tumorweefsels zullen worden onderworpen aan geautomatiseerde digitale kwantificering in combinatie met multiparametrische cellijnevaluatie. Integratie van IHC met digitale automatisering van analyse. Exome-sequencing zal worden uitgevoerd op DNA dat wordt geëxtraheerd uit in paraffine ingebedde secties om varianten te detecteren die specifiek zijn voor tumoren.

Van elke tumor zullen drie tot negen coupes (10 micrometer dik) als DNA-bron worden gebruikt. Na de identificatie en scheiding van tumorweefsel van normaal weefsel door de patholoog, zullen de twee DNA's onafhankelijk van elkaar worden gesequenced. Er zal een vergelijking worden gemaakt tussen varianten afgeleid van tumor- en normaal weefsel, met contrasterende resultaten. Verwachte uitkomsten omvatten 1) somatische of tumorspecifieke varianten, die niet bestaan ​​in gezond weefsel, en 2) varianten die verloren gaan tijdens de evolutie van de tumor als gevolg van segmentale chromosomale deletie of andere mechanismen die heterozygositeitsverlies veroorzaken. Tijdens de prospectieve fase van het project zullen nieuw ontwikkelde tumoren worden geconserveerd. Bovendien zal deze hulpbron de methyloomanalyse vergemakkelijken, die een aanvulling is op de exoomanalyse.