Forskningssamarbejde for et præcisionsonkologiprogram (POP) (POP)

Dette er et observationelt klinisk projekt. Målet med dette forskningssamarbejde er at etablere processer til at fremme præcision onkologi inden for den kliniske rutine. POP genererer information om individuelle tumorer til patienter med avanceret cancer ved hjælp af innovative molekylære teknologier og patientprofilsammenligning ("matching") mod specifikke offentlige og ikke-offentlige databaser med det formål at understøtte klinisk beslutningstagning (terapiforudsigelse).

POP-rapporten vil opsummere de klinisk relevante resultater fra følgende tests og procedurer:

A. Rutinemæssig genetisk test:

FMI (rutinemæssig genetisk testning) Omfattende tumorgenotypebestemmelse, som omfatter ændringer i kræftrelevante gener og følgende parametre: Tumormutationsbyrde (TMB), Tab af heterozygositet (LoH), Microsatellite Instability (MSI).

B. POP-specifik yderligere test:

1. Forskningsgrad: Imaging Mass Cytometri (IMC) For bedre at fange tumorheterogenitet ud over genetik og for at informere terapibeslutninger om, hvorvidt en bestemt behandling kan vise effekt eller ej, vil vi udføre IMC på eksisterende formalinfikserede paraffinindlejrede (FFPE) vævssnit . IMC-teknologi muliggør kvantificering af over 40 udvalgte proteiner og proteinmodifikationer, samtidig med at fænotype- og cellesignalering undersøges. Det muliggør identifikation af markører, der forudsiger respons (eller resistens) hos individuelle cancerpatienter, og muliggør analyse af tumorvæv ved enkeltcelleopløsning, indfangning af karakteristika for tumorcellerne, tumormikromiljøerne og forholdet mellem tumor-, stromale og immunkompartmenter. . Analysen af ​​tumoren på proteinniveau og den rumlige fordeling af de forskellige kompartmenter vil signifikant øge og udvide den rutinemæssige genetiske analyse for at identificere potentielt lægelige ændringer.
2. Patientmatching mod kræftdatabaser Patientmatchningen vil blive udført af Roche ved hjælp af Flatiron Health-Foundation Medicine Clinico-genomic Database (FH-FMI CGDB).

Følgende scenarier vil blive udforsket som en del af projektet:

(i) en sammenligning af kliniske data (f.eks. enhed, TNM-klassificering, tidligere terapier osv.) for at udtrække lignende kliniske fænotyper og den relaterede behandlingshistorie og -resultater (klinisk niveau) (ii) en sammenligning på genotypeniveau (genomisk niveau) (iii) en kombination af mulighederne ovenfor.

POP-rapporten vil blive delt med Molecular Tumor Board (MTB) og diskuteret i fravær af den behandlende læge. MTB'en vil overveje alle tilgængelige oplysninger efter eget skøn og i overensstemmelse med de tilgængelige standardretningslinjer. Dog vil kun behandlingsanbefalinger baseret på rutinediagnostik blive videresendt til den behandlende læge. Hypotetiske MTB's behandlingsbeslutninger baseret på POP-sammendragsrapporten vil ikke blive videresendt til den behandlende læge.

BEMÆRK: Alle yderligere projektspecifikke anbefalinger forbliver ikke-præskriptive og vil ikke blive videresendt til den behandlende læge.