Collaborazione di ricerca per un programma di oncologia di precisione (POP) (POP)

Questo è un progetto clinico osservazionale. Lo scopo di questa collaborazione di ricerca è stabilire processi per far avanzare l’oncologia di precisione all’interno della routine clinica. POP genera informazioni sul singolo tumore per pazienti con tumori avanzati utilizzando tecnologie molecolari innovative e confronto del profilo del paziente ("matching") con specifici database pubblici e non pubblici con l'obiettivo di supportare il processo decisionale clinico (previsione della terapia).

Il rapporto POP riassumerà i risultati clinicamente rilevanti dei seguenti test e procedure:

A. Test genetici di routine:

FMI (test genetico di routine) Genotipizzazione tumorale completa che include alterazioni nei geni rilevanti per il cancro e i seguenti parametri: carico mutazionale del tumore (TMB), perdita di eterozigosità (LoH), instabilità dei microsatelliti (MSI).

B. Test aggiuntivi specifici per POP:

1. Grado di ricerca: Imaging Mass Cytometry (IMC) Per catturare meglio l'eterogeneità del tumore al di là della genetica e per informare le decisioni terapeutiche sull'efficacia o meno di un particolare trattamento, eseguiremo l'IMC su sezioni di tessuto esistenti fissate in formalina e incluse in paraffina (FFPE) . La tecnologia IMC consente la quantificazione di oltre 40 proteine ​​selezionate e modifiche proteiche, interrogando contemporaneamente il fenotipo e la segnalazione cellulare. Consente l'identificazione di marcatori predittivi della risposta (o resistenza) dei singoli pazienti affetti da cancro e consente l'analisi dei tessuti tumorali con risoluzione di singola cellula, acquisendo le caratteristiche delle cellule tumorali, i microambienti tumorali e la relazione tra tumore, compartimenti stromali e immunitari . L'analisi del tumore a livello proteico e la distribuzione spaziale dei diversi compartimenti aumenterà e amplierà significativamente l'analisi genetica di routine per identificare alterazioni potenzialmente farmacologiche.
2. Abbinamento dei pazienti con i database sul cancro L'abbinamento dei pazienti verrà effettuato da Roche utilizzando il database clinico-genomico della Flatiron Health-Foundation Medicine (FH-FMI CGDB).

Nell’ambito del progetto verranno esplorati i seguenti scenari:

(i) un confronto di dati clinici (ad es. entità, classificazione TNM, terapie precedenti, ecc.) per estrarre fenotipi clinici simili e la relativa storia e risultati del trattamento (livello clinico) (ii) un confronto a livello di genotipo (livello genomico) (iii) una combinazione delle possibilità di cui sopra.

Il rapporto POP sarà condiviso con il Molecular Tumor Board (MTB) e discusso in assenza del medico curante. La MTB prenderà in considerazione tutte le informazioni disponibili a propria discrezione e in aderenza alle linee guida standard disponibili. Tuttavia, al medico curante verranno inoltrate solo le raccomandazioni terapeutiche basate sulla diagnostica di routine. Le ipotetiche decisioni terapeutiche di MTB basate sul rapporto riepilogativo POP non verranno comunicate al medico curante.

NOTA: tutte le ulteriori raccomandazioni specifiche del progetto rimangono non prescrittive e non verranno inoltrate al medico curante.