Precision Oncology Program (POP) -tutkimusyhteistyö (POP)

Tämä on kliininen havainnointiprojekti. Tämän tutkimusyhteistyön tavoitteena on luoda prosesseja tarkkuusonkologian edistämiseksi kliinisen rutiinin sisällä. POP tuottaa tietoa yksittäisistä kasvaimista potilaille, joilla on pitkälle edennyt syöpä, käyttämällä innovatiivisia molekyyliteknologioita ja potilasprofiilien vertailua ("sovitus") tiettyihin julkisiin ja ei-julkisiin tietokantoihin tarkoituksena tukea kliinistä päätöksentekoa (hoidon ennustaminen).

POP-raportissa esitetään yhteenveto kliinisesti merkityksellisistä löydöksistä seuraavista testeistä ja toimenpiteistä:

A. Rutiininomaiset geneettiset testaukset:

FMI (rutiinigeneettinen testaus) Kattava kasvaimen genotyypitys, joka sisältää muutokset syövän kannalta merkityksellisissä geeneissä ja seuraavat parametrit: Tuumorimutaatiotaakka (TMB), heterotsygoottisuuden menetys (LoH), mikrosatelliitin epävakaus (MSI).

B. POP-spesifiset lisätestit:

1. Tutkimusaste: Imaging Mass Sytometry (IMC) Jotta tuumorin heterogeenisyys voitaisiin paremmin havaita geneettisestä poikkeavalla tavalla ja saada tietoa hoitopäätöksistä siitä, voiko tietty hoito osoittautua tehokkaaksi, suoritamme IMC:n olemassa oleville formaliinilla kiinnitetyille parafiiniin upotetuille (FFPE) kudosleikkeille. . IMC-teknologia mahdollistaa yli 40 valitun proteiinin ja proteiinimuunnelman kvantifioinnin samalla kun tutkitaan fenotyyppiä ja solusignalointia. Se mahdollistaa yksittäisten syöpäpotilaiden vastetta (tai resistenssiä) ennustavien markkerien tunnistamisen ja mahdollistaa kasvainkudosten analyysin yhden solun erottelukyvyllä, sieppaamalla kasvainsolujen ominaisuudet, kasvaimen mikroympäristöt sekä kasvaimen, strooma- ja immuuniosastojen välisen suhteen. . Kasvaimen analyysi proteiinitasolla ja eri osastojen alueellinen jakautuminen lisää ja laajentaa merkittävästi rutiininomaista geneettistä analyysiä mahdollisten lääkkeiden aiheuttamien muutosten tunnistamiseksi.
2. Potilaiden täsmäytys syövän tietokantoihin Roche suorittaa potilassovituksen käyttämällä Flatiron Health-Foundation Medicine Clinico-genomic -tietokantaa (FH-FMI CGDB).

Osana hanketta tarkastellaan seuraavia skenaarioita:

(i) kliinisten tietojen vertailu (esim. kokonaisuus, TNM-luokitus, aikaisemmat hoidot jne.) samankaltaisten kliinisten fenotyyppien ja niihin liittyvän hoitohistorian ja -tulosten poimimiseksi (kliininen taso) (ii) vertailu genotyyppitasolla (genominen taso) (iii) yllä olevien mahdollisuuksien yhdistelmä.

POP-raportti jaetaan Molecular Tumor Boardin (MTB) kanssa ja siitä keskustellaan hoitavan lääkärin poissa ollessa. MTB käsittelee kaikki saatavilla olevat tiedot oman harkintansa mukaan ja noudattaen saatavilla olevia vakioohjeita. Hoitavalle lääkärille välitetään kuitenkin vain rutiinidiagnostiikkaan perustuvat hoitosuositukset. POP-yhteenvetoraporttiin perustuvia hypoteettisia MTB:n hoitopäätöksiä ei välitetä hoitavalle lääkärille.

HUOMAA: Kaikki projektikohtaiset lisäsuositukset eivät ole ohjeellisia eikä niitä välitetä hoitavalle lääkärille.