Forskningssamarbeid for et presisjonsonkologiprogram (POP) (POP)

Dette er et observasjons-klinisk prosjekt. Målet med dette forskningssamarbeidet er å etablere prosesser for å fremme presisjon onkologi innenfor den kliniske rutinen. POP genererer informasjon om individuell svulst for pasienter med avansert kreft ved hjelp av innovative molekylære teknologier og pasientprofilsammenligning ("matching") mot spesifikke offentlige og ikke-offentlige databaser med sikte på å støtte klinisk beslutningstaking (terapiprediksjon).

POP-rapporten vil oppsummere de klinisk relevante funnene fra følgende tester og prosedyrer:

A. Rutinemessig genetisk testing:

FMI (rutinemessig genetisk testing) Omfattende tumorgenotyping som inkluderer endringer i kreftrelevante gener og følgende parametere: Tumormutasjonsbelastning (TMB), Tap av heterozygositet (LoH), Mikrosatellitt-instabilitet (MSI).

B. POP-spesifikk tilleggstesting:

1. Forskningsgrad: Imaging Mass Cytometri (IMC) For å bedre fange tumorheterogenitet utover genetikk, og for å informere terapibeslutninger om hvorvidt en bestemt behandling kan vise effekt eller ikke, vil vi utføre IMC på eksisterende formalinfikserte parafininnstøpte (FFPE) vevsseksjoner . IMC-teknologi muliggjør kvantifisering av over 40 utvalgte proteiner og proteinmodifikasjoner, samtidig som fenotype og cellesignalering avspørres. Den tillater identifikasjon av markører som forutsier respons (eller resistens) hos individuelle kreftpasienter, og muliggjør analyse av tumorvev ved enkeltcelleoppløsning, fanger opp egenskapene til tumorcellene, tumormikromiljøene og forholdet mellom tumor-, stromal- og immunavdelinger. . Analysen av svulsten på proteinnivå og den romlige fordelingen av de forskjellige avdelingene vil betydelig øke og utvide den rutinemessige genetiske analysen for å identifisere potensielt medisinerbare endringer.
2. Pasientmatching mot kreftdatabaser Pasientmatchingen vil bli utført av Roche ved å bruke Flatiron Health-Foundation Medicine Clinico-genomic Database (FH-FMI CGDB).

Følgende scenarier vil bli utforsket som en del av prosjektet:

(i) en sammenligning av kliniske data (f.eks. enhet, TNM-klassifisering, tidligere terapier osv.) for å trekke ut lignende kliniske fenotyper og relatert behandlingshistorie og -resultater (klinisk nivå) (ii) en sammenligning på genotypenivå (genomisk nivå) (iii) en kombinasjon av mulighetene ovenfor.

POP-rapporten vil bli delt med Molecular Tumor Board (MTB) og diskutert i fravær av behandlende lege. MTB vil vurdere all tilgjengelig informasjon etter eget skjønn og i samsvar med de tilgjengelige standardretningslinjene. Imidlertid vil kun behandlingsanbefalinger basert på rutinediagnostikk bli videresendt til behandlende lege. Hypotetiske MTBs behandlingsbeslutninger basert på POP-sammendragsrapporten vil ikke bli videresendt til behandlende lege.

MERK: Alle ytterligere prosjektspesifikke anbefalinger forblir ikke-preskriptive og vil ikke bli videresendt til behandlende lege.