Onderzoekssamenwerking voor een precisie-oncologieprogramma (POP) (POP)

Dit is een observationeel klinisch project. Het doel van deze onderzoekssamenwerking is het opzetten van processen om precisie-oncologie binnen de klinische routine te bevorderen. POP genereert informatie over individuele tumoren voor patiënten met gevorderde kankers met behulp van innovatieve moleculaire technologieën en vergelijking van patiëntprofielen ("matching") met specifieke openbare en niet-openbare databases met als doel de klinische besluitvorming te ondersteunen (therapievoorspelling).

Het POP-rapport zal de klinisch relevante bevindingen van de volgende tests en procedures samenvatten:

A. Routinematig genetisch testen:

FMI (routinematig genetisch testen) Uitgebreide genotypering van tumoren, inclusief veranderingen in kankerrelevante genen en de volgende parameters: Tumormutatielast (TMB), verlies van heterozygositeit (LoH), microsatellietinstabiliteit (MSI).

B. POP-specifieke aanvullende tests:

1. Onderzoeksgraad: Imaging Mass Cytometry (IMC) Om de heterogeniteit van tumoren die verder gaat dan genetica beter vast te leggen en om therapiebeslissingen te kunnen nemen over de vraag of een bepaalde behandeling al dan niet werkzaam kan zijn, zullen we IMC uitvoeren op bestaande in formaline gefixeerde, in paraffine ingebedde (FFPE) weefselcoupes . IMC-technologie maakt kwantificering van meer dan 40 geselecteerde eiwitten en eiwitmodificaties mogelijk, terwijl tegelijkertijd het fenotype en de celsignalering worden ondervraagd. Het maakt de identificatie mogelijk van markers die de respons (of resistentie) van individuele kankerpatiënten voorspellen, en maakt de analyse van tumorweefsels met eencellige resolutie mogelijk, waarbij kenmerken van de tumorcellen, de micro-omgeving van de tumor en de relatie tussen tumor-, stroma- en immuuncompartimenten worden vastgelegd. . De analyse van de tumor op eiwitniveau en de ruimtelijke verdeling van de verschillende compartimenten zal de routinematige genetische analyse aanzienlijk vergroten en verbreden om potentieel medicijnbare veranderingen te identificeren.
2. Patiëntmatching met kankerdatabases De patiëntmatching zal door Roche worden uitgevoerd met behulp van de Flatiron Health-Foundation Medicine Clinico-genomic Database (FH-FMI CGDB).

Als onderdeel van het project worden de volgende scenario’s onderzocht:

(i) een vergelijking van klinische gegevens (bijv. entiteit, TNM-classificatie, eerdere therapieën, enz.) om vergelijkbare klinische fenotypes en de gerelateerde behandelgeschiedenis en -resultaten te extraheren (klinisch niveau) (ii) een vergelijking op genotypeniveau (genomisch niveau) (iii) een combinatie van de bovenstaande mogelijkheden.

Het POP-rapport wordt gedeeld met de Molecular Tumor Board (MTB) en besproken in afwezigheid van de behandelend arts. De MTB zal alle beschikbare informatie naar eigen goeddunken en in overeenstemming met de beschikbare standaardrichtlijnen in overweging nemen. Er worden echter alleen behandeladviezen op basis van routinematige diagnostiek aan de behandelend arts doorgegeven. Hypothetische behandelbeslissingen van MTB op basis van het POP-samenvattingsrapport worden niet doorgestuurd naar de behandelend arts.

OPMERKING: Alle aanvullende projectspecifieke aanbevelingen blijven niet-voorschrijvend en worden niet doorgestuurd naar de behandelend arts.