Analysis of the Dynamics of the Lung Microbiota During Acute Exacerbation of COPD Requiring Admission to Intensive Care Unit (ADMiRE)
Analysis of the Dynamics of the Lung Microbiota During Acute Exacerbation of COPD Requiring Admission to Intensive Care
Studienübersicht
Status
Status
Bedingungen
Bedingungen
Intervention / Behandlung
Intervention / Behandlung
Detaillierte Beschreibung
Chronic obstructive pulmonary disease (COPD) is a frequent cause of ICU admission. COPD exacerbations are a leading cause of lung function worsening and of morbimortality. Hospitalizations due to COPD exacerbations are highly expensive for health insurance system. Bacterial pulmonary microbiota has been shown to be correlated to the severity of COPD and to exacerbations. Nevertheless fungi and viruses which are full actors of pulmonary microbiota have not yet been investigated.
Our primary outcome will be the assessment of alpha and beta diversity dynamics of the whole pulmonary microbiota (bacteria, fungi and viruses) between COPD exacerbation and steady state.
This study will prospectively include 24 patients at ICU admission for COPD exacerbation with sputum sampling. Steady-state as defined during a 2 months-later visit will be studied with another sputum collection.
Studientyp
Studientyp
Einschreibung (Voraussichtlich)
Einschreibung
Kontakte und Standorte
Studienkontakt
Studienkontakt
- Name: Didier GRUSON, MD/PhD
- Telefonnummer: +335 56 79 55 17
- E-Mail: didier.gruson@chu-bordeaux.fr
Studieren Sie die Kontaktsicherung
- Name: Renaud PREVEL, MD MSc
- Telefonnummer: +335 56 79 55 17
- E-Mail: renaud.prevel@u-bordeaux.fr
Studienorte
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Bordeaux, Frankreich, 33000
- University Hospital, Bordeaux
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Teilnahmekriterien
Zulassungskriterien
Zulassungskriterien
Studienberechtigtes Alter
Akzeptiert gesunde Freiwillige
Studienberechtigte Geschlechter
Probenahmeverfahren
Studienpopulation
Beschreibung
Inclusion Criteria:
- Patient above 18 admitted in ICU
- Admitted for COPD exacerbation defined by sustained (> 2 days) worsening of respiratory symptoms considering Anthonisen's criteria with life-threatening condition.
- Needing mechanical ventilation (noninvasive ventilation or oro-tracheal intubation)
- COPD condition will be presumed according to patient's respiratory history or previous lung function testing
- Able to consent or with the patient's family consent
- Affiliated to a social insurance scheme
No inclusion Criteria:
- COPD patient admitted for another cause than respiratory failure
- person under tutorship or curatorship
- living further than 100 kilometers away from the ICU
- expected survival inferior to 1 week
Exclusion Criteria
- Lung function testing not consistent with COPD at steady-state visit
Studienplan
Wie ist die Studie aufgebaut?
Designdetails
Anzahl der Gruppen / Kohorten
Kohorten und Interventionen
Gruppe / KohorteGruppe / Kohorte |
Intervention / BehandlungIntervention / Behandlung |
|---|---|
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exacerbating COPD patients needing ICU admission
sputum collection
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Analysis of Sputum collection
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Was misst die Studie?
Primäre Ergebnismessungen
Primäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
|---|---|---|
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Number of differents types of cyto-bacteriological of sputum in Bacteriology
Zeitfenster: Day 0
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After extraction of the DNA and sequencing, the obtained sequences allow a taxonomic assignment of the microorganisms.
The number of different taxonomic groups and the number of sequences within each taxonomic group to evaluate the α diversity through the coefficient developed by Shannon and the β diversity
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Day 0
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Number of differents types of Cyto-bacteriological of sputum in Mycology
Zeitfenster: Day 0
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After extraction of the DNA and sequencing, the obtained sequences allow a taxonomic assignment of the microorganisms.
The number of different taxonomic groups and the number of sequences within each taxonomic group to evaluate the α diversity through the coefficient developed by Shannon and the β diversity.
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Day 0
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Number of differents types of Cyto-bacteriological of sputum in Virology
Zeitfenster: Day 0
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After extraction of the RNA and sequencing, the obtained sequences allow a taxonomic assignment of the microorganisms.
The number of different taxonomic groups and the number of sequences within each taxonomic group to evaluate the α diversity and the β diversity.
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Day 0
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Number of differents types of Cyto-bacteriological of sputum in Bacteriology
Zeitfenster: Day 60
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After extraction of the DNA and sequencing, the obtained sequences allow a taxonomic assignment of the microorganisms.
The number of different taxonomic groups and the number of sequences within each taxonomic group to evaluate the α diversity through the coefficient developed by Shannon and the β diversity
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Day 60
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Number of differents types of Cyto-bacteriological of sputum in Mycology
Zeitfenster: Day 60
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After extraction of the DNA and sequencing, the obtained sequences allow a taxonomic assignment of the microorganisms.
The number of different taxonomic groups and the number of sequences within each taxonomic group to evaluate the α diversity through the coefficient developed by Shannon.
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Day 60
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Number of differents types of Cyto-bacteriological of sputum in Virology
Zeitfenster: Day 60
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After extraction of the RNA and sequencing, the obtained sequences allow a taxonomic assignment of the microorganisms.
The number of different taxonomic groups and the number of sequences within each taxonomic group to evaluate the α diversity and the β diversity.
|
Day 60
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Mitarbeiter und Ermittler
Sponsor
Sponsor
Ermittler
Ermittler
- Hauptermittler: Didier GRUSON, MD/PhD, Hospital University, Bordeaux
Studienaufzeichnungsdaten
Haupttermine studieren
Studienbeginn (Voraussichtlich)
Studienbeginn
Primärer Abschluss (Voraussichtlich)
Primärer Abschluss
Studienabschluss (Voraussichtlich)
Studienabschluss
Studienanmeldedaten
Zuerst eingereicht
Zuerst eingereicht
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
Zuerst gepostet (Tatsächlich)
Zuerst gepostet
Studienaufzeichnungsaktualisierungen
Letztes Update gepostet (Tatsächlich)
Letztes Update gepostet
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
Zuletzt verifiziert
Zuletzt verifiziert
Mehr Informationen
Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie
Schlüsselwörter
Zusätzliche relevante MeSH-Bedingungen
Andere Studien-ID-Nummern
Andere Studien-ID-Nummern
- CHUBX 2018/17
Arzneimittel- und Geräteinformationen, Studienunterlagen
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Arzneimittelprodukt
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt
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