Research on Precise Immune Prevention and Treatment of Glioma Based on Multi-omics Sequencing Data
Studienübersicht
Status
Status
Bedingungen
Bedingungen
Intervention / Behandlung
Intervention / Behandlung
Detaillierte Beschreibung
- Through high-throughput sequencing technologies such as, genome sequencing, transcriptome sequencing and single-cell sequencing, Proteomics,Metabonomics and Metagenomics, the similarities and differences of the glioma immune microenvironment within and between individuals were revealed from the multi-dimensional and big data level, and the immune molecular typing of glioma was established.
- Establish and verify that the neoantigen polypeptides predicted by AI algorithm after analyzing multi-omics data (genome, transcriptome, etc.) have good killing effect on individual tumor cells.
- To establish an intelligent evaluation model of glioma immunotyping by integrating imaging, pathology, high-throughput sequencing data and other omics information, and to provide a visual tool for monitoring changes in the intratumoral microenvironment of glioma patients, with the expectation of helping timely intervention of immunotherapy in patients with recurrence.
Studientyp
Studientyp
Einschreibung (Voraussichtlich)
Einschreibung
Kontakte und Standorte
Studienorte
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Shanghai, China, 200040
- Rekrutierung
- Huashan Hospital, Fudan University
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Kontakt:
- Yu Yao
- Telefonnummer: 86-021-5288-9999
- E-Mail: yu_yao03@126.com
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Teilnahmekriterien
Zulassungskriterien
Zulassungskriterien
Studienberechtigtes Alter
Akzeptiert gesunde Freiwillige
Studienberechtigte Geschlechter
Probenahmeverfahren
Studienpopulation
Beschreibung
Inclusion Criteria:
The patients with glioma in the Department of Neurosurgery of Huashan Hospital Affiliated to Fudan University who meet the following three conditions can be enrolled
- They were 18-80 years old, male and female;
- The pathological diagnosis was glioma;
- On the basis of not affecting the clinical routine diagnosis, tissue (6 mm * 6 mm) or paraffin section (5 pieces) can be used for research;
Sign informed consent or ethics committee approval
Exclusion Criteria:
Studienplan
Wie ist die Studie aufgebaut?
Designdetails
Anzahl der Gruppen / Kohorten
Kohorten und Interventionen
Gruppe / KohorteGruppe / Kohorte |
Intervention / BehandlungIntervention / Behandlung |
|---|---|
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glioma patients
glioma patients with routine surgery
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Operation
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Was misst die Studie?
Primäre Ergebnismessungen
Primäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
|---|---|---|
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Overall Survival(OS),month
Zeitfenster: 24 month
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Survival time from surgery to death in 120 patients with glioma.
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24 month
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Progress Free Survival (PFS),month
Zeitfenster: 24 month
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Survival time from surgery to first progression or death from any cause in patients with glioma.
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24 month
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Tumor Mutation Burden(TMB),mutations/mb, drived from Genomic sequencing
Zeitfenster: 24 month
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the level of gene mutation,including TERT、GMEM、IDH.etc.
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24 month
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Reads Per Kilobase Million(RPKM),KB^(-1), drived from Transcriptome sequencing
Zeitfenster: 24 month
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the expression level of RNA,including mRNA、 miRNA、circRNA.etc
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24 month
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expression level of protein , drived from Protein sequencing
Zeitfenster: 24 month
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the expression level of protein, post-translational modification and protein-protein interaction,including PD1、PDL1、CD4、CD8.etc.
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24 month
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expression level of low molecular weight protein,drived from Metabonomics
Zeitfenster: 24 month
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the expression level and interaction of different Metabolites,including D-2-Hydroxyglutarate. etc.
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24 month
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expression level of DNA,drived from Metagenomics
Zeitfenster: 24 month
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Differences about DNA expression of all microorganisms in the environment
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24 month
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frequency of TCR/BCR clone,drived from Immunomics
Zeitfenster: 24month
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different expression level and interaction of Immune molecules,including TCR、BCR、antibody.etc.
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24month
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expression level of protein,drived from paraffin-embedded specimens, retrospectively collected.
Zeitfenster: 24month
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different expression level of proteins in Gliomas with different grades and molecular subgroups (1000 cases)
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24month
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Mitarbeiter und Ermittler
Sponsor
Sponsor
Publikationen und hilfreiche Links
Allgemeine Veröffentlichungen
- Stupp R, Hegi ME, Mason WP, van den Bent MJ, Taphoorn MJ, Janzer RC, Ludwin SK, Allgeier A, Fisher B, Belanger K, Hau P, Brandes AA, Gijtenbeek J, Marosi C, Vecht CJ, Mokhtari K, Wesseling P, Villa S, Eisenhauer E, Gorlia T, Weller M, Lacombe D, Cairncross JG, Mirimanoff RO; European Organisation for Research and Treatment of Cancer Brain Tumour and Radiation Oncology Groups; National Cancer Institute of Canada Clinical Trials Group. Effects of radiotherapy with concomitant and adjuvant temozolomide versus radiotherapy alone on survival in glioblastoma in a randomised phase III study: 5-year analysis of the EORTC-NCIC trial. Lancet Oncol. 2009 May;10(5):459-66. doi: 10.1016/S1470-2045(09)70025-7. Epub 2009 Mar 9.
- Ostrom QT, Gittleman H, Truitt G, Boscia A, Kruchko C, Barnholtz-Sloan JS. CBTRUS Statistical Report: Primary Brain and Other Central Nervous System Tumors Diagnosed in the United States in 2011-2015. Neuro Oncol. 2018 Oct 1;20(suppl_4):iv1-iv86. doi: 10.1093/neuonc/noy131. No abstract available. Erratum In: Neuro Oncol. 2018 Nov 17;:null.
- Tan AC, Ashley DM, Lopez GY, Malinzak M, Friedman HS, Khasraw M. Management of glioblastoma: State of the art and future directions. CA Cancer J Clin. 2020 Jul;70(4):299-312. doi: 10.3322/caac.21613. Epub 2020 Jun 1.
- Chheda ZS, Kohanbash G, Okada K, Jahan N, Sidney J, Pecoraro M, Yang X, Carrera DA, Downey KM, Shrivastav S, Liu S, Lin Y, Lagisetti C, Chuntova P, Watchmaker PB, Mueller S, Pollack IF, Rajalingam R, Carcaboso AM, Mann M, Sette A, Garcia KC, Hou Y, Okada H. Novel and shared neoantigen derived from histone 3 variant H3.3K27M mutation for glioma T cell therapy. J Exp Med. 2018 Jan 2;215(1):141-157. doi: 10.1084/jem.20171046. Epub 2017 Dec 4.
- Nejo T, Matsushita H, Karasaki T, Nomura M, Saito K, Tanaka S, Takayanagi S, Hana T, Takahashi S, Kitagawa Y, Koike T, Kobayashi Y, Nagae G, Yamamoto S, Ueda H, Tatsuno K, Narita Y, Nagane M, Ueki K, Nishikawa R, Aburatani H, Mukasa A, Saito N, Kakimi K. Reduced Neoantigen Expression Revealed by Longitudinal Multiomics as a Possible Immune Evasion Mechanism in Glioma. Cancer Immunol Res. 2019 Jul;7(7):1148-1161. doi: 10.1158/2326-6066.CIR-18-0599. Epub 2019 May 14.
- Keskin DB, Anandappa AJ, Sun J, Tirosh I, Mathewson ND, Li S, Oliveira G, Giobbie-Hurder A, Felt K, Gjini E, Shukla SA, Hu Z, Li L, Le PM, Allesoe RL, Richman AR, Kowalczyk MS, Abdelrahman S, Geduldig JE, Charbonneau S, Pelton K, Iorgulescu JB, Elagina L, Zhang W, Olive O, McCluskey C, Olsen LR, Stevens J, Lane WJ, Salazar AM, Daley H, Wen PY, Chiocca EA, Harden M, Lennon NJ, Gabriel S, Getz G, Lander ES, Regev A, Ritz J, Neuberg D, Rodig SJ, Ligon KL, Suva ML, Wucherpfennig KW, Hacohen N, Fritsch EF, Livak KJ, Ott PA, Wu CJ, Reardon DA. Neoantigen vaccine generates intratumoral T cell responses in phase Ib glioblastoma trial. Nature. 2019 Jan;565(7738):234-239. doi: 10.1038/s41586-018-0792-9. Epub 2018 Dec 19.
- Hilf N, Kuttruff-Coqui S, Frenzel K, Bukur V, Stevanovic S, Gouttefangeas C, Platten M, Tabatabai G, Dutoit V, van der Burg SH, Thor Straten P, Martinez-Ricarte F, Ponsati B, Okada H, Lassen U, Admon A, Ottensmeier CH, Ulges A, Kreiter S, von Deimling A, Skardelly M, Migliorini D, Kroep JR, Idorn M, Rodon J, Piro J, Poulsen HS, Shraibman B, McCann K, Mendrzyk R, Lower M, Stieglbauer M, Britten CM, Capper D, Welters MJP, Sahuquillo J, Kiesel K, Derhovanessian E, Rusch E, Bunse L, Song C, Heesch S, Wagner C, Kemmer-Bruck A, Ludwig J, Castle JC, Schoor O, Tadmor AD, Green E, Fritsche J, Meyer M, Pawlowski N, Dorner S, Hoffgaard F, Rossler B, Maurer D, Weinschenk T, Reinhardt C, Huber C, Rammensee HG, Singh-Jasuja H, Sahin U, Dietrich PY, Wick W. Actively personalized vaccination trial for newly diagnosed glioblastoma. Nature. 2019 Jan;565(7738):240-245. doi: 10.1038/s41586-018-0810-y. Epub 2018 Dec 19. Erratum In: Nature. 2019 Feb;566(7745):E13.
- Li Y, Liu X, Xu K, Qian Z, Wang K, Fan X, Li S, Wang Y, Jiang T. MRI features can predict EGFR expression in lower grade gliomas: A voxel-based radiomic analysis. Eur Radiol. 2018 Jan;28(1):356-362. doi: 10.1007/s00330-017-4964-z. Epub 2017 Jul 28.
- Grossmann P, Gutman DA, Dunn WD Jr, Holder CA, Aerts HJ. Imaging-genomics reveals driving pathways of MRI derived volumetric tumor phenotype features in Glioblastoma. BMC Cancer. 2016 Aug 8;16:611. doi: 10.1186/s12885-016-2659-5.
Studienaufzeichnungsdaten
Haupttermine studieren
Studienbeginn (Tatsächlich)
Studienbeginn
Primärer Abschluss (Voraussichtlich)
Primärer Abschluss
Studienabschluss (Voraussichtlich)
Studienabschluss
Studienanmeldedaten
Zuerst eingereicht
Zuerst eingereicht
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
Zuerst gepostet (Tatsächlich)
Zuerst gepostet
Studienaufzeichnungsaktualisierungen
Letztes Update gepostet (Tatsächlich)
Letztes Update gepostet
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
Zuletzt verifiziert
Zuletzt verifiziert
Mehr Informationen
Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie
Zusätzliche relevante MeSH-Bedingungen
Andere Studien-ID-Nummern
Andere Studien-ID-Nummern
- KY2021-059
Plan für individuelle Teilnehmerdaten (IPD)
Planen Sie, individuelle Teilnehmerdaten (IPD) zu teilen?
Arzneimittel- und Geräteinformationen, Studienunterlagen
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Arzneimittelprodukt
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt
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