Research on Precise Immune Prevention and Treatment of Glioma Based on Multi-omics Sequencing Data
22 de marzo de 2021 actualizado por: Yu Yao, MD
This project intends to use multiple types of biological samples from glioma patients and mouse intracranial tumor models as research objects, and comprehensively apply a series of omics sequencing technologies and molecular biology technologies to jointly define the following research objectives :
Descripción general del estudio
Estado
Estado
Desconocido
Condiciones
Condiciones
Intervención / Tratamiento
Intervención / Tratamiento
Descripción detallada
- Through high-throughput sequencing technologies such as， genome sequencing, transcriptome sequencing and single-cell sequencing, Proteomics，Metabonomics and Metagenomics， the similarities and differences of the glioma immune microenvironment within and between individuals were revealed from the multi-dimensional and big data level, and the immune molecular typing of glioma was established.
- Establish and verify that the neoantigen polypeptides predicted by AI algorithm after analyzing multi-omics data (genome, transcriptome, etc.) have good killing effect on individual tumor cells.
- To establish an intelligent evaluation model of glioma immunotyping by integrating imaging, pathology, high-throughput sequencing data and other omics information, and to provide a visual tool for monitoring changes in the intratumoral microenvironment of glioma patients, with the expectation of helping timely intervention of immunotherapy in patients with recurrence.
Tipo de estudio
Tipo de estudio
De observación
Inscripción (Anticipado)
Inscripción
120
Contactos y Ubicaciones
Esta sección proporciona los datos de contacto de quienes realizan el estudio e información sobre dónde se lleva a cabo este estudio.
Ubicaciones de estudio
-
-
-
Shanghai, Porcelana, 200040
- Reclutamiento
- Huashan Hospital, Fudan University
-
Contacto:
- Yu Yao
- Número de teléfono: 86-021-5288-9999
- Correo electrónico: yu_yao03@126.com
-
-
Criterios de participación
Los investigadores buscan personas que se ajusten a una determinada descripción, denominada criterio de elegibilidad. Algunos ejemplos de estos criterios son el estado de salud general de una persona o tratamientos previos.
Criterio de elegibilidad
Criterio de elegibilidad
Edades elegibles para estudiar
18 años a 80 años (Adulto, Adulto Mayor)
Acepta Voluntarios Saludables
No
Géneros elegibles para el estudio
Todos
Método de muestreo
Muestra de probabilidad
Población de estudio
Patients undergoing glioma surgery at Huashan Hospital
Descripción
Inclusion Criteria:
The patients with glioma in the Department of Neurosurgery of Huashan Hospital Affiliated to Fudan University who meet the following three conditions can be enrolled
- They were 18-80 years old, male and female;
- The pathological diagnosis was glioma;
- On the basis of not affecting the clinical routine diagnosis, tissue (6 mm * 6 mm) or paraffin section (5 pieces) can be used for research;
Sign informed consent or ethics committee approval
Exclusion Criteria:
Plan de estudios
Esta sección proporciona detalles del plan de estudio, incluido cómo está diseñado el estudio y qué mide el estudio.
¿Cómo está diseñado el estudio?
Detalles de diseño
Número de grupos/cohortes
1
Cohortes e Intervenciones
Grupo / CohorteGrupo / Cohorte |
Intervención / TratamientoIntervención / Tratamiento |
|---|---|
|
glioma patients
glioma patients with routine surgery
|
cirugía
|
¿Qué mide el estudio?
Medidas de resultado primarias
Medidas de resultado primarias
Medida de resultado |
Medida Descripción |
Periodo de tiempo |
|---|---|---|
|
Overall Survival（OS），month
Periodo de tiempo: 24 month
|
Survival time from surgery to death in 120 patients with glioma.
|
24 month
|
|
Progress Free Survival （PFS），month
Periodo de tiempo: 24 month
|
Survival time from surgery to first progression or death from any cause in patients with glioma.
|
24 month
|
|
Tumor Mutation Burden（TMB），mutations/mb, drived from Genomic sequencing
Periodo de tiempo: 24 month
|
the level of gene mutation，including TERT、GMEM、IDH.etc.
|
24 month
|
|
Reads Per Kilobase Million（RPKM），KB^(-1), drived from Transcriptome sequencing
Periodo de tiempo: 24 month
|
the expression level of RNA,including mRNA、 miRNA、circRNA.etc
|
24 month
|
|
expression level of protein , drived from Protein sequencing
Periodo de tiempo: 24 month
|
the expression level of protein, post-translational modification and protein-protein interaction，including PD1、PDL1、CD4、CD8.etc.
|
24 month
|
|
expression level of low molecular weight protein，drived from Metabonomics
Periodo de tiempo: 24 month
|
the expression level and interaction of different Metabolites，including D-2-Hydroxyglutarate. etc.
|
24 month
|
|
expression level of DNA，drived from Metagenomics
Periodo de tiempo: 24 month
|
Differences about DNA expression of all microorganisms in the environment
|
24 month
|
|
frequency of TCR/BCR clone，drived from Immunomics
Periodo de tiempo: 24month
|
different expression level and interaction of Immune molecules，including TCR、BCR、antibody.etc.
|
24month
|
|
expression level of protein，drived from paraffin-embedded specimens， retrospectively collected.
Periodo de tiempo: 24month
|
different expression level of proteins in Gliomas with different grades and molecular subgroups (1000 cases)
|
24month
|
Colaboradores e Investigadores
Aquí es donde encontrará personas y organizaciones involucradas en este estudio.
Patrocinador
Patrocinador
Publicaciones y enlaces útiles
La persona responsable de ingresar información sobre el estudio proporciona voluntariamente estas publicaciones. Estos pueden ser sobre cualquier cosa relacionada con el estudio.
Publicaciones Generales
- Stupp R, Hegi ME, Mason WP, van den Bent MJ, Taphoorn MJ, Janzer RC, Ludwin SK, Allgeier A, Fisher B, Belanger K, Hau P, Brandes AA, Gijtenbeek J, Marosi C, Vecht CJ, Mokhtari K, Wesseling P, Villa S, Eisenhauer E, Gorlia T, Weller M, Lacombe D, Cairncross JG, Mirimanoff RO; European Organisation for Research and Treatment of Cancer Brain Tumour and Radiation Oncology Groups; National Cancer Institute of Canada Clinical Trials Group. Effects of radiotherapy with concomitant and adjuvant temozolomide versus radiotherapy alone on survival in glioblastoma in a randomised phase III study: 5-year analysis of the EORTC-NCIC trial. Lancet Oncol. 2009 May;10(5):459-66. doi: 10.1016/S1470-2045(09)70025-7. Epub 2009 Mar 9.
- Ostrom QT, Gittleman H, Truitt G, Boscia A, Kruchko C, Barnholtz-Sloan JS. CBTRUS Statistical Report: Primary Brain and Other Central Nervous System Tumors Diagnosed in the United States in 2011-2015. Neuro Oncol. 2018 Oct 1;20(suppl_4):iv1-iv86. doi: 10.1093/neuonc/noy131. No abstract available. Erratum In: Neuro Oncol. 2018 Nov 17;:null.
- Tan AC, Ashley DM, Lopez GY, Malinzak M, Friedman HS, Khasraw M. Management of glioblastoma: State of the art and future directions. CA Cancer J Clin. 2020 Jul;70(4):299-312. doi: 10.3322/caac.21613. Epub 2020 Jun 1.
- Chheda ZS, Kohanbash G, Okada K, Jahan N, Sidney J, Pecoraro M, Yang X, Carrera DA, Downey KM, Shrivastav S, Liu S, Lin Y, Lagisetti C, Chuntova P, Watchmaker PB, Mueller S, Pollack IF, Rajalingam R, Carcaboso AM, Mann M, Sette A, Garcia KC, Hou Y, Okada H. Novel and shared neoantigen derived from histone 3 variant H3.3K27M mutation for glioma T cell therapy. J Exp Med. 2018 Jan 2;215(1):141-157. doi: 10.1084/jem.20171046. Epub 2017 Dec 4.
- Nejo T, Matsushita H, Karasaki T, Nomura M, Saito K, Tanaka S, Takayanagi S, Hana T, Takahashi S, Kitagawa Y, Koike T, Kobayashi Y, Nagae G, Yamamoto S, Ueda H, Tatsuno K, Narita Y, Nagane M, Ueki K, Nishikawa R, Aburatani H, Mukasa A, Saito N, Kakimi K. Reduced Neoantigen Expression Revealed by Longitudinal Multiomics as a Possible Immune Evasion Mechanism in Glioma. Cancer Immunol Res. 2019 Jul;7(7):1148-1161. doi: 10.1158/2326-6066.CIR-18-0599. Epub 2019 May 14.
- Keskin DB, Anandappa AJ, Sun J, Tirosh I, Mathewson ND, Li S, Oliveira G, Giobbie-Hurder A, Felt K, Gjini E, Shukla SA, Hu Z, Li L, Le PM, Allesoe RL, Richman AR, Kowalczyk MS, Abdelrahman S, Geduldig JE, Charbonneau S, Pelton K, Iorgulescu JB, Elagina L, Zhang W, Olive O, McCluskey C, Olsen LR, Stevens J, Lane WJ, Salazar AM, Daley H, Wen PY, Chiocca EA, Harden M, Lennon NJ, Gabriel S, Getz G, Lander ES, Regev A, Ritz J, Neuberg D, Rodig SJ, Ligon KL, Suva ML, Wucherpfennig KW, Hacohen N, Fritsch EF, Livak KJ, Ott PA, Wu CJ, Reardon DA. Neoantigen vaccine generates intratumoral T cell responses in phase Ib glioblastoma trial. Nature. 2019 Jan;565(7738):234-239. doi: 10.1038/s41586-018-0792-9. Epub 2018 Dec 19.
- Hilf N, Kuttruff-Coqui S, Frenzel K, Bukur V, Stevanovic S, Gouttefangeas C, Platten M, Tabatabai G, Dutoit V, van der Burg SH, Thor Straten P, Martinez-Ricarte F, Ponsati B, Okada H, Lassen U, Admon A, Ottensmeier CH, Ulges A, Kreiter S, von Deimling A, Skardelly M, Migliorini D, Kroep JR, Idorn M, Rodon J, Piro J, Poulsen HS, Shraibman B, McCann K, Mendrzyk R, Lower M, Stieglbauer M, Britten CM, Capper D, Welters MJP, Sahuquillo J, Kiesel K, Derhovanessian E, Rusch E, Bunse L, Song C, Heesch S, Wagner C, Kemmer-Bruck A, Ludwig J, Castle JC, Schoor O, Tadmor AD, Green E, Fritsche J, Meyer M, Pawlowski N, Dorner S, Hoffgaard F, Rossler B, Maurer D, Weinschenk T, Reinhardt C, Huber C, Rammensee HG, Singh-Jasuja H, Sahin U, Dietrich PY, Wick W. Actively personalized vaccination trial for newly diagnosed glioblastoma. Nature. 2019 Jan;565(7738):240-245. doi: 10.1038/s41586-018-0810-y. Epub 2018 Dec 19. Erratum In: Nature. 2019 Feb;566(7745):E13.
- Li Y, Liu X, Xu K, Qian Z, Wang K, Fan X, Li S, Wang Y, Jiang T. MRI features can predict EGFR expression in lower grade gliomas: A voxel-based radiomic analysis. Eur Radiol. 2018 Jan;28(1):356-362. doi: 10.1007/s00330-017-4964-z. Epub 2017 Jul 28.
- Grossmann P, Gutman DA, Dunn WD Jr, Holder CA, Aerts HJ. Imaging-genomics reveals driving pathways of MRI derived volumetric tumor phenotype features in Glioblastoma. BMC Cancer. 2016 Aug 8;16:611. doi: 10.1186/s12885-016-2659-5.
Fechas de registro del estudio
Estas fechas rastrean el progreso del registro del estudio y los envíos de resultados resumidos a ClinicalTrials.gov. Los registros del estudio y los resultados informados son revisados por la Biblioteca Nacional de Medicina (NLM) para asegurarse de que cumplan con los estándares de control de calidad específicos antes de publicarlos en el sitio web público.
Fechas importantes del estudio
Inicio del estudio (Actual)
Inicio del estudio
10 de marzo de 2021
Finalización primaria (Anticipado)
Finalización primaria
30 de septiembre de 2022
Finalización del estudio (Anticipado)
Finalización del estudio
30 de septiembre de 2022
Fechas de registro del estudio
Enviado por primera vez
Enviado por primera vez
1 de marzo de 2021
Primero enviado que cumplió con los criterios de control de calidad
Primero enviado que cumplió con los criterios de control de calidad
7 de marzo de 2021
Publicado por primera vez (Actual)
Publicado por primera vez
11 de marzo de 2021
Actualizaciones de registros de estudio
Última actualización publicada (Actual)
Última actualización publicada
24 de marzo de 2021
Última actualización enviada que cumplió con los criterios de control de calidad
Última actualización enviada que cumplió con los criterios de control de calidad
22 de marzo de 2021
Última verificación
Última verificación
1 de marzo de 2021
Más información
Términos relacionados con este estudio
Términos MeSH relevantes adicionales
Otros números de identificación del estudio
Otros números de identificación del estudio
- KY2021-059
Plan de datos de participantes individuales (IPD)
¿Planea compartir datos de participantes individuales (IPD)?
NO
Información sobre medicamentos y dispositivos, documentos del estudio
Estudia un producto farmacéutico regulado por la FDA de EE. UU.
No
Estudia un producto de dispositivo regulado por la FDA de EE. UU.
No
Esta información se obtuvo directamente del sitio web clinicaltrials.gov sin cambios. Si tiene alguna solicitud para cambiar, eliminar o actualizar los detalles de su estudio, comuníquese con register@clinicaltrials.gov. Tan pronto como se implemente un cambio en clinicaltrials.gov, también se actualizará automáticamente en nuestro sitio web. .