Einzelzellsequenztechnologie zur Aufdeckung der Heterogenität des sekundären Hyperparathyreoidismus

Ziel dieses Projekts ist es, Fälle auszuwählen, die den Forschungsanforderungen entsprechen, sekundären Hyperparathyreoidismus, primären Hyperparathyreoidismus und normales menschliches Nebenschilddrüsengewebe zu entnehmen, insgesamt drei Gruppen, 4 Fälle in jeder Gruppe, durch die Methode der Einzelzelltranskription und -sequenzierung eine Karte zu erstellen von menschlichen Nebenschilddrüsenfunktionstypen, offenbaren die Genstruktur und den Genexpressionsstatus von Zellen und visualisieren die Expressionseigenschaften, die interzelluläre Heterogenität und die Heterogenität von Zelluntergruppen sekundärer Hyperparathyroidzellen auf hierarchische Weise, zeichnen eine Einzelzellkarte und vergleichen die Unterschiede zwischen Gruppen. Untersuchung der Pathogenese des sekundären Hyperparathyreoidismus.

Sekundärer Hyperparathyreoidismus, Nebenschilddrüsengewebe des primären Hyperparathyreoidismus und zufällig gewonnenes normales Nebenschilddrüsengewebe wurden gesammelt, eingefroren und konserviert, das gefrorene Gewebe aufgetaut, eine Einzelzellsuspension hergestellt und jede Zelle nach dem Aufbrechen des Öls und der Polymerasekette durch das Mozhuo Genomics-System spezifisch markiert Reaktionsamplifikation, Reverse Transkription, um komplementäre DNA zu erhalten, und eine Bibliothek komplementärer DNA, die die Qualitätsprüfung bestanden hat, wurden erstellt, um qualitativ hochwertige Daten von Nebenschilddrüsenzellen zu erhalten. Cell Ranger, das R-Seurat-Paket und das t-SNE-Dimensionalitätsreduktionsdiagramm wurden verwendet, um die Dimensionalität zu reduzieren, die Daten zu gruppieren und zu visualisieren.

Um einen Einzelzellatlas der Nebenschilddrüsen zu erstellen, führten die Forscher eine Clusteranalyse ähnlicher Zellen entsprechend dem Genexpressionsprofil durch und visualisierten die Daten anschließend mit t-SNE. Anhand der Ergebnisse der Zellclusterung wurden die spezifischen und stark exprimierten Gene in jedem Zellcluster identifiziert. Zellpopulationen wurden anhand der Expression von Landmark-Genen identifiziert und die Unterschiede in den Zelltypen und Proportionen zwischen den Gruppen verglichen.