Nachweis von Pathogen- und Antibiotikaresistenzgenen durch gezielte Next-Generation-Sequenzierung bei Intensivpatienten.
Nachweis von Krankheitserreger- und Antibiotikaresistenzgenen durch gezielte Next-Generation-Sequenzierung im Vergleich zur metagenomischen Next-Generation-Sequenzierung bei Intensivpatienten.
Studienübersicht
Status
Status
Bedingungen
Bedingungen
Intervention / Behandlung
Intervention / Behandlung
Detaillierte Beschreibung
Infektionskrankheiten gehören zu den Erkrankungen mit der höchsten Mortalität und Morbidität beim Menschen. Aufgrund der Schwierigkeit, den Erreger im Frühstadium der Infektion zu identifizieren, müssen Patienten mit schweren Infektionen oft über einen langen Zeitraum empirisch antimikrobielle Breitbandmedikamente anwenden. Der traditionelle Goldstandard der ätiologischen Erkennung – die ätiologische Kultur – selbst bei Sepsispatienten sind nur etwa 60 % der Ergebnisse positiv. Daher ist die genaue Identifizierung und schnelle Klassifizierung pathogener Mikroorganismen für die präzise Diagnose und rechtzeitige Behandlung des Patienten sehr wichtig.
Das in den letzten Jahren aufgekommene metagenomische Next-Generation-Sequencing (mNGS) ermöglicht nachweislich eine frühzeitige Diagnose und eine gezielte Medikationsberatung bei Blutkreislauf- und Atemwegsinfektionen, ist jedoch teuer und nicht in der Lage, entsprechende arzneimittelresistente Gene bereitzustellen. Daher wurde das gezielte Next-Generation-Sequencing (tNGS) abgeleitet, das sich durch schnelle Sequenzierung und Gentests auf Arzneimittelresistenz auszeichnet.
Der Zweck dieser Studie besteht darin, die Wirksamkeit der ätiologischen Diagnose zu bewerten und den Patienten eine genauere Behandlung zu ermöglichen.
Studientyp
Studientyp
Einschreibung (Geschätzt)
Einschreibung
Kontakte und Standorte
Studienkontakt
Studienkontakt
- Name: Ting Li
- Telefonnummer: 011-86-15608657562
- E-Mail: 3423580562@qq.com
Studieren Sie die Kontaktsicherung
- Name: Fangyi Li
- Telefonnummer: 011-86-15603056533
- E-Mail: Lify8@mailsysu.edu.cn
Teilnahmekriterien
Zulassungskriterien
Zulassungskriterien
Studienberechtigtes Alter
- Erwachsene
- Älterer Erwachsener
Akzeptiert gesunde Freiwillige
Probenahmeverfahren
Studienpopulation
Beschreibung
Einschlusskriterien:
- Das Vorliegen einer Infektion oder das Vorliegen einer Infektion ist eindeutig ausgeschlossen.
- Ätiologische Kultur und/oder metagenomischer Next-Generation-Sequencing-Nachweis von Proben, die zum Testen eingesandt werden.
Ausschlusskriterien:
- Verdacht auf Infektion.
- Teilnahme an anderen klinischen Studien in den letzten 2 Monaten.
Studienplan
Wie ist die Studie aufgebaut?
Designdetails
Anzahl der Gruppen / Kohorten
Kohorten und Interventionen
Gruppe / KohorteGruppe / Kohorte |
Intervention / BehandlungIntervention / Behandlung |
|---|---|
|
Nicht-Infektionsgruppe
Die Teilnehmer erhielten eine traditionelle ätiologische Untersuchung der vermuteten Infektionsstelle.
|
Bereitstellung einer schnellen ätiologischen Diagnose von Patienten mittels gezielter Next-Generation-Sequenzierung.
|
|
Infektionsgruppe
Die Teilnehmer erhielten eine traditionelle ätiologische Kultur und eine metagenomische Next-Generation-Sequenzierung infektiöser Stellen.
|
Bereitstellung einer schnellen ätiologischen Diagnose von Patienten mittels gezielter Next-Generation-Sequenzierung.
|
Was misst die Studie?
Primäre Ergebnismessungen
Primäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
|---|---|---|
|
Empfindlichkeit
Zeitfenster: 1 Jahr
|
Die Wahrscheinlichkeit, in der klinischen zusammengesetzten Diagnose positiv zu sein, die Wahrscheinlichkeit, dass ätiologische Kultur-, mNGS- und tNGS-Tests ebenfalls positiv sind, was auch als wahre Positivrate bezeichnet wird.
|
1 Jahr
|
|
Spezifität
Zeitfenster: 1 Jahr
|
Es bezieht sich auf die Wahrscheinlichkeit, dass Kulturen, mNGS- und tNGS-Tests auch bei Vorliegen einer durch den Goldstandard bestätigten Nichtinfektion negativ ausfallen.
|
1 Jahr
|
Sekundäre Ergebnismessungen
Sekundäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
|---|---|---|
|
Falsch-Positiv-Rate
Zeitfenster: 1 Jahr
|
Es bezieht sich auf die Wahrscheinlichkeit, dass die durch den Goldstandard bestätigte Abwesenheit einer Infektion auch für ätiologische Kultur-, mNGS- und tNGS-Tests positiv ist.
|
1 Jahr
|
|
Falsch-negativ-Rate
Zeitfenster: 1 Jahr
|
Es bezieht sich auf die Wahrscheinlichkeit, dass die klinische zusammengesetzte Diagnose positiv ausfällt, und auf die Wahrscheinlichkeit, dass ätiologische Kulturen, mNGS- und tNGS-Tests ebenfalls negativ ausfallen.
|
1 Jahr
|
|
Positiv vorhergesagter Wert
Zeitfenster: 1 Jahr
|
Der positive Vorhersagewert ist die Wahrscheinlichkeit, dass Probanden mit einem positiven Test tatsächlich an der Krankheit leiden.
|
1 Jahr
|
|
Negativer Vorhersagewert
Zeitfenster: 1 Jahr
|
Der negative Vorhersagewert ist die Wahrscheinlichkeit, dass Probanden mit einem negativen Screening-Test tatsächlich nicht an der Krankheit leiden.
|
1 Jahr
|
|
Kappa-Werte
Zeitfenster: 1 Jahr
|
Kappa-Werte werden verwendet, um die Übereinstimmung zwischen zwei Bewertern zu messen.
Der Bereich möglicher Kappa-Werte liegt zwischen -1 und 1, normalerweise liegt er jedoch zwischen 0 und 1. Eins steht für vollkommene Übereinstimmung, was darauf hinweist, dass die Bewerter bei der Klassifizierung jedes Falles einer Meinung sind.
Kappa-Werte von 0,41 bis 0,60 sind mäßig konsistent, 0,61 bis 0,80 sind grundsätzlich konsistent und 0,81 bis 1,00 sind nahezu identisch.
|
1 Jahr
|
|
Arzneimittelresistentes Gen durch gezielte Next-Generation-Sequenzierung
Zeitfenster: 1 Jahr
|
Es bezieht sich auf die Verteilung von Arzneimittelresistenzen durch gezielte Sequenzierung der nächsten Generation unter Verwendung der Comprehensive Antibiotic Resistance Database.
|
1 Jahr
|
Mitarbeiter und Ermittler
Sponsor
Sponsor
Ermittler
Ermittler
- Studienleiter: Zhijie He, Sun Yat-sen Memorial Hospital,Sun Yat-sen University
Publikationen und hilfreiche Links
Allgemeine Veröffentlichungen
- Chiu CY, Miller SA. Clinical metagenomics. Nat Rev Genet. 2019 Jun;20(6):341-355. doi: 10.1038/s41576-019-0113-7.
- Diao Z, Han D, Zhang R, Li J. Metagenomics next-generation sequencing tests take the stage in the diagnosis of lower respiratory tract infections. J Adv Res. 2021 Sep 29;38:201-212. doi: 10.1016/j.jare.2021.09.012. eCollection 2022 May.
- Miao Q, Ma Y, Wang Q, Pan J, Zhang Y, Jin W, Yao Y, Su Y, Huang Y, Wang M, Li B, Li H, Zhou C, Li C, Ye M, Xu X, Li Y, Hu B. Microbiological Diagnostic Performance of Metagenomic Next-generation Sequencing When Applied to Clinical Practice. Clin Infect Dis. 2018 Nov 13;67(suppl_2):S231-S240. doi: 10.1093/cid/ciy693.
- Pei XM, Yeung MHY, Wong ANN, Tsang HF, Yu ACS, Yim AKY, Wong SCC. Targeted Sequencing Approach and Its Clinical Applications for the Molecular Diagnosis of Human Diseases. Cells. 2023 Feb 2;12(3):493. doi: 10.3390/cells12030493.
- Li S, Tong J, Liu Y, Shen W, Hu P. Targeted next generation sequencing is comparable with metagenomic next generation sequencing in adults with pneumonia for pathogenic microorganism detection. J Infect. 2022 Nov;85(5):e127-e129. doi: 10.1016/j.jinf.2022.08.022. Epub 2022 Aug 26. No abstract available.
- Gaston DC, Miller HB, Fissel JA, Jacobs E, Gough E, Wu J, Klein EY, Carroll KC, Simner PJ. Evaluation of Metagenomic and Targeted Next-Generation Sequencing Workflows for Detection of Respiratory Pathogens from Bronchoalveolar Lavage Fluid Specimens. J Clin Microbiol. 2022 Jul 20;60(7):e0052622. doi: 10.1128/jcm.00526-22. Epub 2022 Jun 13.
Studienaufzeichnungsdaten
Haupttermine studieren
Studienbeginn (Geschätzt)
Studienbeginn
Primärer Abschluss (Geschätzt)
Primärer Abschluss
Studienabschluss (Geschätzt)
Studienabschluss
Studienanmeldedaten
Zuerst eingereicht
Zuerst eingereicht
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
Zuerst gepostet (Geschätzt)
Zuerst gepostet
Studienaufzeichnungsaktualisierungen
Letztes Update gepostet (Geschätzt)
Letztes Update gepostet
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
Zuletzt verifiziert
Zuletzt verifiziert
Mehr Informationen
Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie
Schlüsselwörter
Zusätzliche relevante MeSH-Bedingungen
Andere Studien-ID-Nummern
Andere Studien-ID-Nummern
- SYSKY-2023-667-03
Plan für individuelle Teilnehmerdaten (IPD)
Planen Sie, individuelle Teilnehmerdaten (IPD) zu teilen?
Arzneimittel- und Geräteinformationen, Studienunterlagen
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Arzneimittelprodukt
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt
Diese Informationen wurden ohne Änderungen direkt von der Website clinicaltrials.gov abgerufen. Wenn Sie Ihre Studiendaten ändern, entfernen oder aktualisieren möchten, wenden Sie sich bitte an register@clinicaltrials.gov. Sobald eine Änderung auf clinicaltrials.gov implementiert wird, wird diese automatisch auch auf unserer Website aktualisiert .