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Identification of Diagnostic And Prognostic Biomarkers From Amyotrophic Lateral Sclerosis (ALS) Skin and Adipose Samples (ALS-TDI PEG)

20. April 2022 aktualisiert von: Wake Forest University Health Sciences

Identification of Diagnostic and Prognostic Biomarkers From Amyotrophic Lateral Sclerosis (ALS) Skin and Adipose Samples

The purpose of the project is to obtain skin and adipose tissue samples from patients with ALS to develop new diagnostic and prognostic markers of the disease. These samples will be obtained when percutaneous endoscopic gastrostomy (PEG) is performed as part of their standard of care. Skin and adipose tissue samples will also be obtained from disease control subjects who require a PEG as part of their standard of care.

Studienübersicht

Status

Abgeschlossen

Detaillierte Beschreibung

Subjects who are undergoing a percutaneous endoscopic gastrostomy (PEG) tube insertion as part of their standard of care will be asked if a skin and adipose sample may be collected for research during the procedure. After a participant has signed the informed consent, the sub-investigator from the Department of Gastroenterology will collect a skin and adipose sample during the procedure. Individuals with a diagnosis of definite ALS and disease controls (i.e. stroke, head and neck cancer, spinal cord injury, etc.) will be included in this study.

The coded skin and adipose sample will be taken to the Carolinas Neuromuscular/ALS Research Laboratory in the Cannon Research Center for processing. The skin and adipose will be separated from each other and divided into halves. Each half of skin and adipose will be submerged in preservative and either shipped to ALS-TDI or retained at -80°C in the Carolinas Neuromuscular/ALS Research Laboratory. The research staff at the Carolinas Neuromuscular/ALS-MDA Center will be responsible for shipping the sample to the ALS-TDI for either RNA isolation using the Qiagen RNAEasy kit (Qiagen) or for purification of protein. Subsequently, gene expression profiling on Affymetrix Genechips or Mass Spec based proteomics on a Thermo Orbitrap LC-MS/MS instrument will be performed, respectively. The discovery effort (if all participants are working at capacity) should not take more than 12 months.

In addition to the above procedures, a member of the study team will review the medical chart to obtain additional information on the participant's medical and family history. For ALS patients, past ALSFRS-R scores or FVC scores will be provided to the "ALS-TDI Skin and Adipose Biomarker Study" to enhance the usefulness of the information for research.

Samples will not be stored with any patient identifiers. Samples will be retained and continued to be studied as new techniques become available. Data from the study may be published in scientific journals. Publications will not include any patient identifiers.

Studientyp

Beobachtungs

Einschreibung (Tatsächlich)

132

Kontakte und Standorte

Dieser Abschnitt enthält die Kontaktdaten derjenigen, die die Studie durchführen, und Informationen darüber, wo diese Studie durchgeführt wird.

Studienorte

    • North Carolina
      • Charlotte, North Carolina, Vereinigte Staaten, 28207
        • Carolinas Neuromuscular/ALS-MDA care Center

Teilnahmekriterien

Forscher suchen nach Personen, die einer bestimmten Beschreibung entsprechen, die als Auswahlkriterien bezeichnet werden. Einige Beispiele für diese Kriterien sind der allgemeine Gesundheitszustand einer Person oder frühere Behandlungen.

Zulassungskriterien

Studienberechtigtes Alter

19 Jahre und älter (Erwachsene, Älterer Erwachsener)

Akzeptiert gesunde Freiwillige

Nein

Studienberechtigte Geschlechter

Alle

Probenahmeverfahren

Nicht-Wahrscheinlichkeitsprobe

Studienpopulation

Patients at the Carolinas Neuromuscular/ALS-MDA Center and patients at Carolinas Medical Center.

Beschreibung

Inclusion Criteria:

  • for ALS patients, subjects must be diagnosed with definite ALS according to the El Escorial Criteria (EEC)
  • all subjects must be diagnosed with a condition requiring PEG (percutaneous endoscopic gastrostomy) tube insertion
  • subjects must be older than 18 years of age

Exclusion Criteria:

  • children 18 years old and younger

Studienplan

Dieser Abschnitt enthält Einzelheiten zum Studienplan, einschließlich des Studiendesigns und der Messung der Studieninhalte.

Wie ist die Studie aufgebaut?

Designdetails

Kohorten und Interventionen

Gruppe / Kohorte
subjects with ALS
subjects with ALS who are undergoing a percutaneous endoscopic gastrostomy
subjects without ALS
subjects without ALS who are undergoing a percutaneous endoscopic gastrostomy

Was misst die Studie?

Primäre Ergebnismessungen

Ergebnis Maßnahme
Maßnahmenbeschreibung
Zeitfenster
Abundance levels of the known messenger RNA transcriptome of skin and adipose tissue samples (measured by gene expression profiling)
Zeitfenster: After tissue has been collected from study subjects. Data will be analyzed at 1 year.
Skin and adipose samples will be collected and processed into total RNA. Probes will be synthesized from these total RNAs and hybridized to HgU133ver2.0 Affymetrix genechips. These genechips contain probe sets that measure the abundance levels of the known human transcriptome.
After tissue has been collected from study subjects. Data will be analyzed at 1 year.
Changes in abundance of or post-translational modification of proteins (measured by proteomics)
Zeitfenster: After tissue has been collected from study subjects. Data will be analyzed at year 1 after primary outcome data has been reviewed and analyzed.
Skin and adipose samples will be collected for down stream proteomics analysis. The 14 most abundant proteins will be removed using commercially available depletion columns (Agilent). Removal of these proteins yields higher resolution and sensitivity in subsequent chromatography steps. Proteins will be separated by 2 and 3 dimensional liquid chromatography followed by MS/MS based peptide quantitation and sequencing on a Thermo Orbitrap.
After tissue has been collected from study subjects. Data will be analyzed at year 1 after primary outcome data has been reviewed and analyzed.

Mitarbeiter und Ermittler

Hier finden Sie Personen und Organisationen, die an dieser Studie beteiligt sind.

Ermittler

  • Hauptermittler: Benjamin R Brooks, MD, Carolinas Neuromuscular/ALS-MDA care Center
  • Hauptermittler: Thomas Pacicco, MD, Gastroenterology

Studienaufzeichnungsdaten

Diese Daten verfolgen den Fortschritt der Übermittlung von Studienaufzeichnungen und zusammenfassenden Ergebnissen an ClinicalTrials.gov. Studienaufzeichnungen und gemeldete Ergebnisse werden von der National Library of Medicine (NLM) überprüft, um sicherzustellen, dass sie bestimmten Qualitätskontrollstandards entsprechen, bevor sie auf der öffentlichen Website veröffentlicht werden.

Haupttermine studieren

Studienbeginn (Tatsächlich)

20. August 2008

Primärer Abschluss (Tatsächlich)

6. August 2014

Studienabschluss (Tatsächlich)

4. April 2017

Studienanmeldedaten

Zuerst eingereicht

30. März 2013

Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat

18. September 2013

Zuerst gepostet (Schätzen)

23. September 2013

Studienaufzeichnungsaktualisierungen

Letztes Update gepostet (Tatsächlich)

26. April 2022

Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt

20. April 2022

Zuletzt verifiziert

1. Dezember 2019

Mehr Informationen

Diese Informationen wurden ohne Änderungen direkt von der Website clinicaltrials.gov abgerufen. Wenn Sie Ihre Studiendaten ändern, entfernen oder aktualisieren möchten, wenden Sie sich bitte an register@clinicaltrials.gov. Sobald eine Änderung auf clinicaltrials.gov implementiert wird, wird diese automatisch auch auf unserer Website aktualisiert .

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