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DNA Methylation Biomarkers and Metastasis of Gastric Carcinoma

17. Juni 2015 aktualisiert von: Zhaojun Liu, Peking University Cancer Hospital & Institute

A Cohort Study on Prediction of Metastasis of Gastric Carcinoma by DNA Methylation Biomarkers

Gastric carcinoma (GC) is the second leading cause of cancer death throughout the world. In previous multi-center study, we have found that the prevalence of GDNF family receptor alpha 1(GFRA1), serum response factor (SRF), and ZNF382 methylation alterations were inversely and coordinately associated with GC metastasis and the patients' overall survival throughout discovery and testing cohorts in China, Japan and Korea. The present cohort study is to investigate whether methylation of those genes can predict the metastasis and prognosis of GC.

Studienübersicht

Status

Abgeschlossen

Bedingungen

Detaillierte Beschreibung

Background: Metastasis is the leading cause of death for gastric carcinoma (GC). Currently, GC prognosis is primarily determined based on the clinical data and pathological stages of patients at the time of diagnosis and treatment. However, successful management of GC patients is still hampered by lack of highly sensitive and specific biomarkers capable of predicting prognosis and likelihood of metastasis. GFRA1 hypomethylation along with SRF and ZNF382 hypermethylation were found to be potential synergistic biomarkers for the prediction of GC metastasis in our previous multi-center study. In addition, p16 and E-cadherin were also correlated with GC metastasis in Chinese cohort. To investigate the predictive value of those genes' methylation on metastasis potential in GC, we carried out the prospective cohort study.

Methods: 198 early stage GC patients without lymph node or distal metastasis were included in the present study. Baseline information of E-cadherin, GFRA1, p16, SRF and ZNF382 methylation status of the GC from 191 cases was obtained by MethyLight. The follow-up examination was carried out in a double-blind study with a 6-month interval. The association between gene methylation and metastasis of GC was analyzed with SPSS16.0 software. All P-values were two-sided.

Studientyp

Beobachtungs

Einschreibung (Tatsächlich)

198

Kontakte und Standorte

Dieser Abschnitt enthält die Kontaktdaten derjenigen, die die Studie durchführen, und Informationen darüber, wo diese Studie durchgeführt wird.

Studienorte

  • China
    • Beijing
      • Beijing, Beijing, China, 100000
        • Beijing Cancer Hospital & Institute

Teilnahmekriterien

Forscher suchen nach Personen, die einer bestimmten Beschreibung entsprechen, die als Auswahlkriterien bezeichnet werden. Einige Beispiele für diese Kriterien sind der allgemeine Gesundheitszustand einer Person oder frühere Behandlungen.

Zulassungskriterien

Studienberechtigtes Alter

  • Kind
  • Erwachsene
  • Älterer Erwachsener

Akzeptiert gesunde Freiwillige

Nein

Studienberechtigte Geschlechter

Alle

Probenahmeverfahren

Wahrscheinlichkeitsstichprobe

Studienpopulation

198 early stage gastric carcinoma (GC) inpatients that underwent surgical treatment at Peking University Cancer Hospital & Institute between 2002 and 2012 were enrolled in the cohort. All of the enrolled patients had been diagnosed pathologically by senior pathologists. The 2010 UICC-TNM (tumor-node-metastasis) system was used for the classification of GCs. All cases involved primary lesions without neoadjuvant chemotherapy. Genes methylation status of GC samples was analyzed with MethyLight combined with denatured high performance liquid chromatography. 191 eligible cases with gene-methylated or gene-methylated GC were enrolled into the cohort study.

Beschreibung

Inclusion Criteria:

  • Histological diagnosis of gastric adenocarcinoma;
  • Early stage GC without lymph node and distal metastasis;
  • Availability of frozen, fresh GC and corresponding surgical margin samples;
  • Available of methylation status of gene CpG island in the extracted DNA sample.

Exclusion Criteria:

  • GC with lymph node or distal metastasis;
  • Quality of the prepared DNA is not good enough for detection of gene methylation;
  • GC cases were subjected to the neoadjuvant chemotherapy.

Studienplan

Dieser Abschnitt enthält Einzelheiten zum Studienplan, einschließlich des Studiendesigns und der Messung der Studieninhalte.

Wie ist die Studie aufgebaut?

Designdetails

  • Beobachtungsmodelle: Kohorte
  • Zeitperspektiven: Interessent

Kohorten und Interventionen

Gruppe / Kohorte
gene-methylation

gene-low-level of methylation: patients with early stage gastric carcinoma containing low-level of methylation change of E-cadherin,GFRA1,p16,SRF and ZNF382 CpG island.

gene-middle-level of methylation: patients with early stage gastric carcinoma containing middle-level of methylation change of E-cadherin,GFRA1,p16,SRF and ZNF382 CpG island.

gene-high-level of methylation: patients with early stage gastric carcinoma containing high-level of methylation change of E-cadherin,GFRA1,p16,SRF and ZNF382 CpG island.

gene-without of methylation: patients with early stage gastric carcinoma NOT containing methylated E-cadherin,GFRA1,p16,SRF or ZNF382 CpG island.

Was misst die Studie?

Primäre Ergebnismessungen

Ergebnis Maßnahme
Maßnahmenbeschreibung
Zeitfenster
Metastasis and/ or recurrence of gastric carcinoma
Zeitfenster: 3 years
The hazard ratio, positive prediction value, and negative prediction value of metastasis/recurrence of gastric carcinomas are calculated according to the metastasis/recurrence frequences among patients with the different methylation status of each target gene CpG islands. These patients are classified into four groups for each gene: A) cases without methylation change; B) cases with the low-level of methylation change (33.3% of cases with methylation change); C) cases with the middle-level of methylation change (33.3% of cases with methylation change); D) cases with the high-level of methylation change (33.3% of cases with methylation change). Combination analysis will be carried out using Support Vector Classification model.
3 years

Sekundäre Ergebnismessungen

Ergebnis Maßnahme
Maßnahmenbeschreibung
Zeitfenster
Disease-free (Recurrence/metastasis-free) survival (DFS) and overall survival (OS) of patients with gastric carcinoma after surgical resection
Zeitfenster: from 4 months to 144 months
The classification of patients is the same as the primary outcome measure. The log-rank test will be used to compare survival time between groups. Cox-proportional hazards models will be used to identify independent predictors of survival (month) with adjustment for relevant clinical covariates
from 4 months to 144 months

Mitarbeiter und Ermittler

Hier finden Sie Personen und Organisationen, die an dieser Studie beteiligt sind.

Sponsor

Peking University Cancer Hospital & Institute

Mitarbeiter

Peking University

Ermittler

  • Studienleiter: Dajun Deng, Master, Peking University Cancer Hospital & Institute

Publikationen und hilfreiche Links

Die Bereitstellung dieser Publikationen erfolgt freiwillig durch die für die Eingabe von Informationen über die Studie verantwortliche Person. Diese können sich auf alles beziehen, was mit dem Studium zu tun hat.

Allgemeine Veröffentlichungen

Studienaufzeichnungsdaten

Diese Daten verfolgen den Fortschritt der Übermittlung von Studienaufzeichnungen und zusammenfassenden Ergebnissen an ClinicalTrials.gov. Studienaufzeichnungen und gemeldete Ergebnisse werden von der National Library of Medicine (NLM) überprüft, um sicherzustellen, dass sie bestimmten Qualitätskontrollstandards entsprechen, bevor sie auf der öffentlichen Website veröffentlicht werden.

Haupttermine studieren

Studienbeginn

1. Dezember 2012

Primärer Abschluss (Tatsächlich)

1. Juni 2015

Studienabschluss (Tatsächlich)

1. Juni 2015

Studienanmeldedaten

Zuerst eingereicht

6. Juni 2014

Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat

6. Juni 2014

Zuerst gepostet (Schätzen)

9. Juni 2014

Studienaufzeichnungsaktualisierungen

Letztes Update gepostet (Schätzen)

19. Juni 2015

Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt

17. Juni 2015

Zuletzt verifiziert

1. Juni 2015

Mehr Informationen

Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie

Schlüsselwörter

Zusätzliche relevante MeSH-Bedingungen

Andere Studien-ID-Nummern

  • Methylation-14414

Arzneimittel- und Geräteinformationen, Studienunterlagen

Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Arzneimittelprodukt

Nein

Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt

Nein

Produkt, das in den USA hergestellt und aus den USA exportiert wird

Nein

Diese Informationen wurden ohne Änderungen direkt von der Website clinicaltrials.gov abgerufen. Wenn Sie Ihre Studiendaten ändern, entfernen oder aktualisieren möchten, wenden Sie sich bitte an register@clinicaltrials.gov. Sobald eine Änderung auf clinicaltrials.gov implementiert wird, wird diese automatisch auch auf unserer Website aktualisiert .

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