Tämä sivu käännettiin automaattisesti, eikä käännösten tarkkuutta voida taata. Katso englanninkielinen versio lähdetekstiä varten.

DNMT- ja HDAC-geenin SNP:n kliininen merkitys desitabiinihoitovasteessa myelodysplastisen oireyhtymän hoidossa

tiistai 11. elokuuta 2020 päivittänyt: Samsung Medical Center

DNA-metyylitransferaasin ja histonideasetylaasigeenin yhden nukleotidin polymorfismin kliininen merkitys myelodysplastisessa oireyhtymässä

Viimeaikaiset tutkimukset ovat osoittaneet, että DNMT-geenipolymorfismit voivat myötävaikuttaa yksilöiden välisiin variantteihin DNMT-ilmentymisessä. Näin ollen oletimme, että DNMT- ja HDAC-geenien SNP:t voisivat ennustaa myelodysplastisen oireyhtymän desitabiinihoidon tuloksia. MDS-potilaille suoritetaan mahdollinen DNA:n kerääminen ääreisverestä ennen desitabiinihoidon aloittamista. Arvioimme desitabiinihoidon tehokkuutta DNMT- tai HDAC-geenin SNP:iden mukaisesti seuraavien parametrien perusteella: 1) hematoloottinen vaste (HR) tai paraneminen (HI) tai desitabiiniannoksen tarve HR:n tai HI:n saavuttamiseksi, 2) täydellinen (CR) ) tai osittainen vaste (PR) tai desitabiiniannoksen vaatimus CR:n tai PR:n saavuttamiseksi, ja 3) aika MDS:n uusiutumiseen tai etenemiseen.

Tämän tutkimuksen tavoitteena on 1) määrittää genotyypit DNA-näytteistä desitabiinihoitoa saavilta MDS-potilailta, 2) määrittää kliinisten tulosten yhteys (HR, HI, CR, PR tai aika leukemiaan etenemiseen) desitabiinihoidon ja DNMT:n jälkeen. tai HDAC-genotyypit ja 3) analysoimaan sytogeneettisen riskin vaikutusta vasteeseen tai leukemiaevoluutioon MDS:n desitabiinihoidon jälkeen.

Tutkimuksen yleiskatsaus

Tila

Tila

Ilmaisee nykyisen rekrytointitilan tai laajennetun pääsyn tilan.
Valmis

Ehdot

Ehdot

Sairaus, häiriö, oireyhtymä, sairaus tai vamma, jota tutkitaan. Sivustolla ClinicalTrials.gov olosuhteet voivat sisältää myös muita terveyteen liittyviä kysymyksiä, kuten elinikää, elämänlaatua ja terveysriskejä.

Yksityiskohtainen kuvaus

Tämä tutkimus sisältää potilaat, jotka allekirjoittivat tietoisen suostumuslomakkeen, niiden MDS-potilaiden joukossa, jotka valittiin desitabiinilla hoidettaviksi (osa I), sekä lisäksi 140 MDS-potilasta historiallisena kontrollina (osa II). Osa I -tutkimukseen otetaan mukaan noin 68 potilasta, jotka täyttävät seuraavat sisällyttämis- ja poissulkemiskriteerit.

MDS-potilaille suoritetaan mahdollinen DNA:n kerääminen ääreisverestä ennen desitabiinihoidon aloittamista. Arvioimme desitabiinihoidon tehokkuutta DNMT- tai HDAC-geenin SNP:iden mukaisesti seuraavien parametrien perusteella: 1) hematoloottinen vaste (HR) tai paraneminen (HI) tai desitabiiniannoksen tarve HR:n tai HI:n saavuttamiseksi, 2) täydellinen (CR) ) tai osittainen vaste (PR) tai desitabiiniannoksen vaatimus CR:n tai PR:n saavuttamiseksi, ja 3) aika MDS:n uusiutumiseen tai etenemiseen.

Genotyypitys suoritetaan käyttämällä Sequenom® iPLEX platform™ -alustaa valmistajan ohjeiden mukaisesti (www.sequenom.com; Sequenom Inc, San Diego, CA, USA). Kokoverinäytteet otetaan Helsingin julistuksen mukaisesti. DNA uutetaan käyttämällä Puregene DNA -puhdistussarjaa (Gentra Systems Inc, Minneapolis, MN, USA). SNP:iden havaitseminen suoritetaan analysoimalla aiemmin monistetusta genomisesta DNA:sta tuotettuja alukepidennystuotteita käyttämällä Sequenom-siruun perustuvaa matriisiavusteista laserdesorptio-/ionisaatioaikalento- (MALDI-TOF) -massaspektrometria-alustaa. Multiplex SNP -määritykset suunnitellaan käyttämällä SpectroDesigner-ohjelmistoa (Sequenom). 96-kuoppaiset levyt, jotka sisältävät 2,5 ng DNA:ta kussakin kuopassa, monistetaan PCR:llä noudattaen Sequenomin spesifikaatioita. PCR-tuotteen sisältämättömät nukleotidit deaktivoidaan käyttämällä katkarapujen alkalista fosfataasia. Alleelierottelureaktiot suoritetaan lisäämällä pidennysalukkeita, DNA-polymeraasia ja deoksinukleotiditrifosfaattien ja di-deoksinukleotiditrifosfaattien sekoitusseosta kuhunkin kuoppaan. MassExtend puhdasta hartsia (Sequenom) lisätään seokseen poistamaan ylimääräiset suolat, jotka voivat häiritä MALDI-TOF-analyysiä. Tämän jälkeen pohjamaalin pidennystuotteet puhdistetaan ja laitetaan SpectroChipille. Genotyypit määritetään ottamalla jokaisesta näytteestä alikvootti 384 SpectroChipiin (Sequenom), joka luetaan myöhemmin MALDI-TOF-massaspektrometrillä.

Kaikki tilastolliset testit ovat kaksipuolisia ja merkitsevyystasoksi asetetaan 0,05, ellei toisin mainita. Tilastotiedot saadaan käyttämällä SAS-versiota 9.1 (SAS Institute, Cary NC, USA). Seuraavat ovat tutkimuksen päätepisteet.

  1. Ensisijaiset päätepisteen arviointitiedot

    • Vasteprosentti: Vastausprosentti saadaan ja sen luottamusväli arvioidaan khin neliötestin avulla. Jos pääasiallisia päätepisteitä, jotka voivat vaikuttaa lopulliseen arviointiin, on valvottava, tehdään kerrostettu analyysi (Cochran-Mantel-Haenzel jne.). Jos kaikkia koehenkilöille ominaisia ​​päätepisteitä on kontrolloitava, analyysissä käytetään logistista regressiomallia.

  2. Toissijaisen päätepisteen arviointitiedot

    • Kokonaiseloonjääminen: eloonjäämistä arvioidaan rekisteröintipäivästä kuolemaan Kaplan-Meier-menetelmällä.
    • Etenemisvapaa eloonjääminen: : Aika, jolloin eteneminen MDS:stä AML:ään ja mistä tahansa syystä johtuva kuolema. Etenemisvapaata eloonjäämistä analysoidaan Kaplan-Meier-menetelmällä.

Opintotyyppi

Opintotyyppi

Kuvaa kliinisen tutkimuksen luonnetta. Tutkimustyyppejä ovat interventiotutkimukset (kutsutaan myös kliinisiksi kokeiksi), havaintotutkimukset (mukaan lukien potilasrekisterit) ja laajennettu pääsy.
Havainnollistava

Ilmoittautuminen (Odotettu)

Ilmoittautuminen

Kliinisen tutkimuksen osallistujien määrä. "Odotettu" ilmoittautuminen on tavoitemäärä osallistujia, jonka tutkijat tarvitsevat tutkimukseen.
68

Yhteystiedot ja paikat

Tässä osiossa on tutkimuksen suorittajien yhteystiedot ja tiedot siitä, missä tämä tutkimus suoritetaan.

Opiskelupaikat

Osallistumiskriteerit

Tutkijat etsivät ihmisiä, jotka sopivat tiettyyn kuvaukseen, jota kutsutaan kelpoisuuskriteereiksi. Joitakin esimerkkejä näistä kriteereistä ovat henkilön yleinen terveydentila tai aiemmat hoidot.

Kelpoisuusvaatimukset

Kelpoisuusvaatimukset

Keskeiset vaatimukset, jotka ihmisten, jotka haluavat osallistua kliiniseen tutkimukseen, on täytettävä tai ominaisuudet, jotka heillä on oltava. Kelpoisuuskriteerit koostuvat sekä osallistumiskriteereistä (jotka vaaditaan, jotta henkilö voi osallistua tutkimukseen) että poissulkemisperusteista (jotka estävät henkilöä osallistumasta). Kelpoisuuskriteerityyppejä ovat muun muassa se, otetaanko tutkimukseen terveitä vapaaehtoisia, onko ikä- tai ikäryhmävaatimuksia vai sukupuolen mukaan rajoitettu.

Opintokelpoiset iät

18 vuotta ja vanhemmat (AIKUINEN, OLDER_ADULT)

Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia

Ei

Sukupuolet, jotka voivat opiskella

Kaikki

Näytteenottomenetelmä

Ei-todennäköisyysnäyte

Tutkimusväestö

Tämä tutkimus sisältää potilaat, jotka allekirjoittivat koehenkilön tietoisen suostumuslomakkeen, niiden MDS-potilaiden joukossa, jotka valittiin desitabiinihoitoon, sekä muita MDS-potilaita historiallisena vertailuna.

Kuvaus

  1. Sisällyttämiskriteerit:

    1. Desitabiinihoitoryhmä

      • Mies ja nainen vähintään 18-vuotiaat.
      • Potilaat, joilla on diagnosoitu (primaarinen tai toissijainen) MDS
      • Potilaat, joiden IPSS-pistemäärä on ≥ Int-1
      • Potilaat, joita on hoidettu desitabiinilla vähintään 1 syklin ajan.
      • Allekirjoitettu ja päivätty tietoinen suostumus ennen geneettisen tutkimuksen aloittamista käyttämällä verinäytteestä peräisin olevaa genomista DNA:ta.

    2. Historiallinen kontrolliryhmä

      • Mies ja nainen vähintään 18-vuotiaat.
      • Potilaat, joilla on diagnosoitu (primaarinen tai toissijainen) MDS

  2. Poissulkemiskriteerit:

    • Potilaat, joilla on diagnosoitu akuutti myelooinen leukemia (AML, luuytimen kantasolujen määrä yli 20 %) tai muu etenevä pahanlaatuinen sairaus.
    • Kroonisen myelomonosyyttisen leukemian (CMML) tai MDS/MPD:n diagnoosi ei ole mahdollista.

Opintosuunnitelma

Tässä osiossa on tietoja tutkimussuunnitelmasta, mukaan lukien kuinka tutkimus on suunniteltu ja mitä tutkimuksella mitataan.

Miten tutkimus on suunniteltu?

Suunnittelun yksityiskohdat

Kohortit ja interventiot

Ryhmä/Kohortti

Ryhmä/Kohortti

Ryhmä tai alaryhmä havainnointitutkimuksen osallistujia, jonka biolääketieteelliset tai terveydelliset tulokset arvioidaan.
Desitabiinihoito
Potilaita hoidetaan desitabiinilla vähintään 1 sykli
ei-desitabiinihoitoa
Potilailla diagnosoidaan MDS, eikä heitä hoideta desitabiinihoidolla

Mitä tutkimuksessa mitataan?

Ensisijaiset tulostoimenpiteet

Ensisijaiset tulostoimenpiteet

Kliinisen tutkimuksen protokollassa suunniteltu tulosmittaus, joka on tärkein toimenpiteen/hoidon vaikutuksen arvioinnissa. Useimmilla kliinisillä tutkimuksilla on yksi ensisijainen tulosmittaus, mutta joissakin on useampia kuin yksi.
Tulosmittaus
Aikaikkuna
Yleinen vastausprosentti
Aikaikkuna: 18 kuukautta
18 kuukautta

Toissijaiset tulostoimenpiteet

Toissijaiset tulostoimenpiteet

Kliinisen tutkimuksen protokollassa suunniteltu tulosmittaus, joka ei ole yhtä tärkeä kuin ensisijainen tulosmitta toimenpiteen vaikutuksen arvioinnissa, mutta joka on silti kiinnostava. Useimmissa kliinisissä tutkimuksissa on enemmän kuin yksi toissijainen tulosmitta.
Tulosmittaus
Aikaikkuna
Aika etenemiseen tai hematologiseen paranemiseen
Aikaikkuna: 18 kuukautta
18 kuukautta

Yhteistyökumppanit ja tutkijat

Täältä löydät tähän tutkimukseen osallistuvat ihmiset ja organisaatiot.

Sponsori

Sponsori

Organisaatio tai henkilö, joka käynnistää tutkimuksen ja jolla on valtuudet ja määräysvalta tutkimuksessa.
Samsung Medical Center

Opintojen ennätyspäivät

Nämä päivämäärät seuraavat ClinicalTrials.gov-sivustolle lähetettyjen tutkimustietueiden ja yhteenvetojen edistymistä. National Library of Medicine (NLM) tarkistaa tutkimustiedot ja raportoidut tulokset varmistaakseen, että ne täyttävät tietyt laadunvalvontastandardit, ennen kuin ne julkaistaan ​​julkisella verkkosivustolla.

Opi tärkeimmät päivämäärät

Opiskelun aloitus

Opiskelun aloitus

Todellinen päivämäärä, jolloin ensimmäinen osallistuja otettiin mukaan kliiniseen tutkimukseen. "Odotettu" tutkimuksen aloituspäivä on päivämäärä, jonka tutkijat uskovat olevan tutkimuksen aloituspäivä.
Tiistai 1. syyskuuta 2009

Ensisijainen valmistuminen (TODELLINEN)

Ensisijainen valmistuminen

Päivämäärä, jolloin viimeinen kliinisen tutkimuksen osallistuja tutkittiin tai jona hän sai intervention lopullisen datan keräämiseksi ensisijaista tulosmittausta varten. Tähän päivämäärään ei vaikuta se, päättyikö kliininen tutkimus protokollan mukaisesti vai lopetettiinko se. Kliinisissä tutkimuksissa, joissa on useampi kuin yksi ensisijainen tulosmitta ja eri päättymispäivämäärät, tämä termi viittaa päivämäärään, jolloin kaikkien ensisijaisten tulosmittausten tiedonkeruu on saatu päätökseen. "Odotettu" ensisijainen valmistumispäivä on päivämäärä, jonka tutkijat uskovat olevan tutkimuksen ensisijainen valmistumispäivä.
Perjantai 1. lokakuuta 2010

Opintojen valmistuminen (TODELLINEN)

Opintojen valmistuminen

Päivämäärä, jolloin viimeinen kliinisen tutkimuksen osallistuja tutkittiin tai jona hän sai interventiota/hoitoa lopullisen datan keräämiseksi ensisijaisia ​​tulosmittauksia, toissijaisia ​​tulosmittauksia ja haittatapahtumia varten (eli viimeisen osallistujan viimeinen käynti). "Odotettu" tutkimuksen päättymispäivä on päivämäärä, jonka tutkijat uskovat olevan tutkimuksen päättymispäivä.
Maanantai 1. marraskuuta 2010

Opintoihin ilmoittautumispäivät

Ensimmäinen lähetetty

Ensimmäinen lähetetty

Päivämäärä, jolloin tutkimuksen sponsori tai tutkija ensimmäisen kerran toimitti tutkimustietueen ClinicalTrials.gov Ensimmäisen lähetyspäivän ja tietueen saatavuuden ClinicalTrials.gov-sivustolla (ensimmäinen julkaisupäivämäärä) välillä on yleensä muutaman päivän viive.
Keskiviikko 2. kesäkuuta 2010

Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit

Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit

Päivämäärä, jolloin tutkimuksen rahoittaja tai tutkija lähettää ensimmäisen kerran tutkimustietueen, joka on yhdenmukainen National Library of Medicine (NLM) -laadunvalvonnan (QC) tarkistuskriteereillä. Toimeksiantajan tai tutkijan on ehkä tarkistettava ja toimitettava tutkimustietue yhden tai useamman kerran, ennen kuin NLM laadunvalvontatarkastuksen kriteerit täyttyvät. Toimeksiantajan tai tutkijan vastuulla on varmistaa, että tutkimustietue on yhdenmukainen NLM laadunvalvontatarkastuskriteerien kanssa.
Tiistai 11. elokuuta 2020

Ensimmäinen Lähetetty (TODELLINEN)

Ensimmäinen Lähetetty

Päivämäärä, jolloin tutkimustietue oli ensimmäisen kerran saatavilla ClinicalTrials.gov -sivustolla National Library of Medicine (NLM) -laadunvalvontatarkastuksen (QC) tarkastuksen jälkeen. Tutkimuksen toimeksiantajan tai tutkijan tutkimustietueen toimittamisen ja ensimmäisen julkaisupäivän välillä on tyypillisesti muutaman päivän viive.
Maanantai 17. elokuuta 2020

Tutkimustietojen päivitykset

Viimeisin päivitys julkaistu (TODELLINEN)

Viimeisin päivitys julkaistu

Viimeisin päivämäärä, jolloin tutkimustietueen muutokset otettiin käyttöön osoitteessa ClinicalTrials.gov. Voi olla viive sen välillä, kun tutkimuksen sponsori tai tutkija on toimittanut muutokset ClinicalTrials.gov-sivustolle (viimeinen päivityksen lähetyspäivä) ja viimeisen päivityksen julkaisupäivämäärän välillä.
Maanantai 17. elokuuta 2020

Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit

Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit

Viimeisin päivämäärä, jolloin tutkimuksen rahoittaja tai tutkija on toimittanut tutkimustietueeseen muutoksia, jotka ovat yhdenmukaisia ​​National Library of Medicine (NLM) -laadunvalvonnan (QC) tarkistuskriteereillä. Toimeksiantajan tai tutkijan vastuulla on varmistaa, että tutkimustietue on yhdenmukainen NLM laadunvalvontatarkastuskriteerien kanssa.
Tiistai 11. elokuuta 2020

Viimeksi vahvistettu

Viimeksi vahvistettu

Viimeisin päivämäärä, jolloin tutkimuksen rahoittaja tai tutkija vahvisti kliinisen tutkimuksen tiedot ClinicalTrials.gov-sivustolla oikeiksi ja ajantasaisiksi. Jos tutkimus, jonka rekrytointitila on rekrytointi; ei vielä rekrytoi; tai aktiivinen, ei rekrytointia ole varmistettu viimeisen 2 vuoden aikana, tutkimuksen rekrytointistatus näytetään tuntemattomana.
Lauantai 1. tammikuuta 2011

Lisää tietoa

Tähän tutkimukseen liittyvät termit

Avainsanat

Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja

Muut tutkimustunnusnumerot

Muut tutkimustunnusnumerot

Muut tunnisteet tai tunnusnumerot kuin NCT-numero, jotka tutkimuksen sponsori, rahoittaja tai joku muu on määrittänyt kliiniselle tutkimukselle. Nämä numerot voivat sisältää yksilöllisiä tunnisteita muista tutkimusrekistereistä ja National Institutes of Health -apurahojen numeroista.
  • 2009-04-012

Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .

Evästeasetukset

Käytämme evästeitä varmistaaksemme, että annamme sinulle parhaan kokemuksen verkkosivustollamme. Lisätietoja on tietosuoja- ja evästekäytännössämme. ...>>>Voit muuttaa asetuksiasi tai peruuttaa suostumuksesi milloin tahansa poistamalla evästeet verkkosivustoltasi tai tietokoneeltasi käytännössä kuvatulla tavalla. Hyväksy se ja valitse mieltymyksesi merkitsemällä vastaavat ruudut alla olevaan "Asetusten hallinta" -osioon. Lue huolellisesti käyttöehdot ennen kuin jatkat minkä tahansa tämän verkkosivuston osan käyttöä.
«Hallitse asetuksia