Oral, Fecal and Intratumoral Microbiome Atlas in Colombian Patients With Advanced Solid Tumors Receiving First-Line Immunotherapy (ATLAS)
Atlas of the Oral, Fecal and Intratumoral Microbiome of Colombian Patients With Advanced Solid Tumors Candidates for First-Line Immunotherapy - Initial Phase of a Project With Latin American Projection
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Tila
Ehdot
Ehdot
Interventio / Hoito
Interventio / Hoito
Yksityiskohtainen kuvaus
Opintotyyppi
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Arvioitu)
Ilmoittautuminen
Yhteystiedot ja paikat
Opiskeluyhteys
Opiskeluyhteys
- Nimi: Liliana Gutiérrez, RN, MSc
- Puhelinnumero: +573003768158
- Sähköposti: lgutierrez@fctic.org
Tutki yhteystietojen varmuuskopiointi
- Nimi: Andrés F Cardona, MD, MSc, PhD, MBA
- Puhelinnumero: +573016348173
- Sähköposti: acardona@fctic.org
Opiskelupaikat
-
-
Bogota D.C.
-
Bogotá, Bogota D.C., Kolumbia, 110131
- Rekrytointi
- Fundación CTIC - Centro de Tratamiento e Investigación sobre Cáncer Luis Carlos Sarmiento Angulo
-
Ottaa yhteyttä:
- Liliana Gutiérrez, RN, MSc
- Puhelinnumero: +573003768158
- Sähköposti: lgutierrez@fctic.org
-
Päätutkija:
- Andrés F Cardona, MD, MSc, PhD, MBA
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
- Aikuinen
- Vanhempi Aikuinen
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Kuvaus
Inclusion Criteria:
- Age 18 years or older.
- Histologically confirmed advanced (stage III unresectable or IV) gastric, colorectal, breast, cervical or head-and-neck cancer.
- Candidate for first-line immunotherapy per current clinical guidelines.
- Available FFPE tumor block in institutional or reference pathology archive.
- Able to provide saliva and stool samples at V0 and follow-up.
- ECOG performance status within protocol limits; life expectancy over 3 months.
- Cognitive capacity to give informed consent; signed EVA-BIOBANCO and Atlas consents.
Inclusion Criteria (healthy controls)
- No prior cancer diagnosis.
- No active autoimmune disease; no inflammatory bowel disease.
- No antibiotics, invasive dental treatment, immunosuppressants or corticosteroids in the prior 3 months; no severe active periodontal disease.
Exclusion Criteria:
- Systemic antibiotics within 3 months (except short course under 5 days for uncomplicated infection).
- Probiotics or prebiotics within 30 days.
- Chronic proton-pump inhibitors for more than 3 continuous months.
- Inflammatory bowel disease (Crohn, ulcerative colitis) or extensive bowel resection.
- Pregnancy or lactation.
- BMI under 18.5 or over 40 kg/m².
- Uncontrolled diabetes (HbA1c at or above 9% in prior 3 months).
- Invasive dental treatment within 3 months.
- Patients: simultaneous randomized trial of a non-INVIMA-approved experimental immunotherapy; or no evaluable FFPE block meeting quality thresholds.
- Inability to ensure 12-month clinical follow-up.
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Ryhmien/kohorttien lukumäärä
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/KohorttiRyhmä/Kohortti |
Interventio / HoitoInterventio / Hoito |
|---|---|
|
Patients with advanced solid tumors
120 Colombian adults with advanced (stage III unresectable or IV) gastric, colorectal, breast, cervical or head-and-neck cancer, candidates for first-line immunotherapy (standard of care).
Saliva, stool and tongue scraping collected at V0, V1 (6 mo) and V2 (12 mo); archival FFPE tumor block retrieved at V0.
|
Exposure observed: first-line immunotherapy with immune checkpoint inhibitors administered as standard of care (INVIMA-approved); no experimental intervention is assigned by the study.
Healthy controls receive no immunotherapy.
|
|
Healthy controls
30 healthy adult volunteers without prior cancer, active autoimmune disease or inflammatory bowel disease, and without antibiotics or invasive dental treatment in the prior 3 months.
Saliva and stool collected at V0 only; no longitudinal follow-up.
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Oral, fecal and intratumoral microbiome signatures associated with objective tumor response (RECIST 1.1) to first-line immunotherapy
Aikaikkuna: Baseline (V0) and through 12 months
|
Characterization of oral, fecal and intratumoral microbiomes and identification of taxa and diversity metrics differentiating responders (CR+PR) from non-responders (SD+PD) by RECIST 1.1.
|
Baseline (V0) and through 12 months
|
|
Differences in microbiome composition and diversity between cancer patients and healthy controls
Aikaikkuna: Baseline (V0)
|
Comparison of alpha and beta diversity and differential taxonomic and functional abundance between cancer patients and healthy controls.
|
Baseline (V0)
|
Toissijaiset tulostoimenpiteet
Toissijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Microbial, transcriptomic and metabolomic biomarkers associated with progression-free survival (PFS)
Aikaikkuna: Association of microbial diversity, key taxa, MAGs and functional pathways with progression-free survival, estimated by Kaplan-Meier and adjusted Cox models.
|
Up to 36 months
|
Association of microbial diversity, key taxa, MAGs and functional pathways with progression-free survival, estimated by Kaplan-Meier and adjusted Cox models.
|
|
Microbial biomarkers associated with overall survival (OS)
Aikaikkuna: Up to 36 months
|
Association of microbiome features with overall survival, estimated by Kaplan-Meier and adjusted Cox models.
|
Up to 36 months
|
Muut tulostoimenpiteet
Muut tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Tumor transcriptomic profile and gene-expression pathways modulated by the intratumoral microbiome
Aikaikkuna: Baseline (V0)
|
RNA-Seq characterization of tumor gene-expression and identification of pathways correlated with intratumoral microbiome composition.
|
Baseline (V0)
|
|
Untargeted salivary and fecal metabolomic profile (subcohort, n=60)
Aikaikkuna: Baseline through 12 months
|
GC-MS untargeted metabolomics of saliva and stool in a stratified subcohort (50 patients, 10 controls) to identify metabolites associated with microbiome composition and immunotherapy response.
|
Baseline through 12 months
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Sponsori
Sponsori
Yhteistyökumppanit
Yhteistyökumppanit
Tutkijat
Tutkijat
- Päätutkija: Andrés F Cardona, MD, MSc, PhD, MBA, Fundación CTIC - Centro de Tratamiento e Investigación sobre Cáncer Luis Carlos Sarmiento Angulo
Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä
Yleiset julkaisut
- Cullin N, Azevedo Antunes C, Straussman R, Stein-Thoeringer CK, Elinav E. Microbiome and cancer. Cancer Cell. 2021 Oct 11;39(10):1317-1341. doi: 10.1016/j.ccell.2021.08.006. Epub 2021 Sep 9.
- Mancini N, Peri F, Rescigno M, Zanoni I. Microbiome studies in the medical sciences and the need for closer multidisciplinary interplay. Sci Signal. 2020 Feb 4;13(617):eaba9911. doi: 10.1126/scisignal.aba9911.
- Zhernakova A, Kurilshikov A, Bonder MJ, Tigchelaar EF, Schirmer M, Vatanen T, Mujagic Z, Vila AV, Falony G, Vieira-Silva S, Wang J, Imhann F, Brandsma E, Jankipersadsing SA, Joossens M, Cenit MC, Deelen P, Swertz MA; LifeLines cohort study; Weersma RK, Feskens EJ, Netea MG, Gevers D, Jonkers D, Franke L, Aulchenko YS, Huttenhower C, Raes J, Hofker MH, Xavier RJ, Wijmenga C, Fu J. Population-based metagenomics analysis reveals markers for gut microbiome composition and diversity. Science. 2016 Apr 29;352(6285):565-9. doi: 10.1126/science.aad3369. Epub 2016 Apr 28.
- Dohlman AB, Arguijo Mendoza D, Ding S, Gao M, Dressman H, Iliev ID, Lipkin SM, Shen X. The cancer microbiome atlas: a pan-cancer comparative analysis to distinguish tissue-resident microbiota from contaminants. Cell Host Microbe. 2021 Feb 10;29(2):281-298.e5. doi: 10.1016/j.chom.2020.12.001. Epub 2021 Jan 6.
- Parida S, Sharma D. The Microbiome and Cancer: Creating Friendly Neighborhoods and Removing the Foes Within. Cancer Res. 2021 Feb 15;81(4):790-800. doi: 10.1158/0008-5472.CAN-20-2629. Epub 2020 Nov 4.
- Park EM, Chelvanambi M, Bhutiani N, Kroemer G, Zitvogel L, Wargo JA. Targeting the gut and tumor microbiota in cancer. Nat Med. 2022 Apr;28(4):690-703. doi: 10.1038/s41591-022-01779-2. Epub 2022 Apr 19.
- El Tekle G, Garrett WS. Bacteria in cancer initiation, promotion and progression. Nat Rev Cancer. 2023 Sep;23(9):600-618. doi: 10.1038/s41568-023-00594-2. Epub 2023 Jul 3.
- Parizadeh M, Arrieta MC. The global human gut microbiome: genes, lifestyles, and diet. Trends Mol Med. 2023 Oct;29(10):789-801. doi: 10.1016/j.molmed.2023.07.002. Epub 2023 Jul 27.
- Govender P, Ghai M. Population-specific differences in the human microbiome: Factors defining the diversity. Gene. 2025 Jan 15;933:148923. doi: 10.1016/j.gene.2024.148923. Epub 2024 Sep 6.
- Trakman GL, Fehily S, Basnayake C, Hamilton AL, Russell E, Wilson-O'Brien A, Kamm MA. Diet and gut microbiome in gastrointestinal disease. J Gastroenterol Hepatol. 2022 Feb;37(2):237-245. doi: 10.1111/jgh.15728. Epub 2021 Nov 16.
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Opiskelun aloitus
Ensisijainen valmistuminen (Arvioitu)
Ensisijainen valmistuminen
Opintojen valmistuminen (Arvioitu)
Opintojen valmistuminen
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Ensimmäinen Lähetetty
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin päivitys julkaistu
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Avainsanat
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
- Urogenitaaliset sairaudet
- Sukuelinten sairaudet
- Urogenitaaliset kasvaimet
- Neoplasmat sivustoittain
- Naisten virtsa- ja sukupuolielinten sairaudet
- Naisten virtsa- ja sukupuolielinten sairaudet ja raskauden komplikaatiot
- Suoliston sairaudet
- Ruoansulatuskanavan kasvaimet
- Ruoansulatuskanavan kasvaimet
- Ruoansulatuskanavan sairaudet
- Ruoansulatuskanavan sairaudet
- Vatsataudit
- Suoliston kasvaimet
- Peräsuolen sairaudet
- Kohdun sairaudet
- Sukuelinten sairaudet, naiset
- Paksusuolen sairaudet
- Sukuelinten kasvaimet, naiset
- Ihosairaudet
- Rintojen sairaudet
- Kohdun kohdunkaulan sairaudet
- Kohdun kasvaimet
- Iho- ja sidekudostaudit
- Neoplasmat
- Vatsan kasvaimet
- Kolorektaaliset kasvaimet
- Rintojen kasvaimet
- Kohdunkaulan kasvaimet
- Pään ja kaulan kasvaimet
- Antineoplastiset aineet, immunologiset
- Antineoplastiset aineet
- Farmakologisen vaikutuksen molekyylimekanismit
- Terveyspalveluiden hallinto
- Terveydenhuollon laatu, saatavuus ja arviointi
- Farmakologiset vaikutukset
- Kemialliset vaikutukset ja käyttötarkoitukset
- Terapeuttinen käyttö
- Terveydenhuollon laatu
- Laatuindikaattorit, terveydenhuolto
- Immuunijärjestelmän tarkistuspisteen estäjät
- Hoidon taso
Muut tutkimustunnusnumerot
Muut tutkimustunnusnumerot
- ATLAS
- CEI-232 (Muu tunniste: Comité de Ética de la Investigación Riesgo de Fractura S.A)
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
IPD-suunnitelman kuvaus
IPD-jaon aikakehys
IPD-jaon käyttöoikeuskriteerit
IPD-jakamista tukeva tietotyyppi
- STUDY_PROTOCOL
- MAHLA
- ANALYTIC_CODE
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .