Arbovirusinfektion neurologiset ilmenemismuodot Kolumbiassa

NEAS:a johtaa tohtori Carlos Pardo-Villamizar Johns Hopkins Universitystä (JHU) ja Dr. Beatriz Parra ja Lyda Osorio Universidad del Vallessa (UV) Kolumbiassa. He ovat perustaneet yhteistyöverkoston lääkäreiden, neurologien ja mikrobiologian ja epidemiologian asiantuntijoiden kanssa kyseisessä maassa. NEAS rekrytoi aktiivisesti potilaita seitsemään yliopistolliseen sairaalaan viidessä Kolumbian kaupungissa. Tutkimuksen protokolla on hyväksytty jokaisessa osallistuvassa keskuksessa.

NEAS:n prospektiivisen tapauskontrollitutkimuksen tavoitteena on määrittää yhteys arbovirukselle (Zika, Dengue ja Chikungunya) altistumisen ja neurologisen oireyhtymän kehittymisen välillä potilailla Kolumbiasta, maasta, jossa arbovirus leviää endeemisenä. Tapaukset määritellään henkilöiksi, joilla ilmaantuu uusi neurologinen oireyhtymä, jonka etiologia on tuntematon, mukaan lukien, mutta ei rajoittuen, enkefaliitti, myeliitti, aivokalvontulehdus, polyneuropatia/Guillain-Barren oireyhtymä ja aivohermovaurio. On olemassa kaksi ikäsovitettua kontrolliryhmää: 1) kotitalouden kontrollit ja 2) kontrollit, joilla on tuntemattoman etiologian kuumeoireyhtymä ja joilla ei ole neurologista vaikutusta. Tutkimuksen arvioitu otoskoko on 50 osallistujaa kussakin ryhmässä (tapaukset ja kontrollit 1 ja 2). Täydellisen otoskoon keräämisaika on 12–24 kuukautta, ja se riippuu tapausten paikallisesta esiintyvyydestä.

Jokaisella keskuksella on koordinaattoritiimi, johon kuuluu neurologi, lääkäri - neurologien tai sisätautien residentti - ja tutkimuskoordinaattori. Ryhmä seuloa jatkuvasti keskukseen otetut potilaat. Potilaita, jotka täyttävät tapausten tai kontrollien kriteerit, lähestyy tutkimuskoordinaattori, jonka tehtävänä on tiedottaa osallistujalle tutkimuksesta ja täyttää tietoisen suostumuksen. Sitten lääketieteellinen tiimi suorittaa neurologisen arvioinnin, mukaan lukien historian ja fyysisen kokeen NEAS-lomakkeiden mukaisesti. Kaikilta osallistujilta kerätään veri- ja virtsanäytteet. Jos lannepunktio tehdään osana normaalia hoitoa, myös selkäydinnestettä kerätään. Resurssien saatavuuden perusteella osallistujia seurataan joka viikko 4 viikon ajan ja jokaisella käynnillä tehdään kliininen arviointi ja näytteenotto.

Demografiset ja kliiniset tiedot, laboratorio- ja kuvantamistulokset tallennetaan suojattuun verkkopohjaiseen tietokantaan REDcap-alustalla, joka sijaitsee JHU:ssa. Jokaisella keskuksella on yksilöllinen yhdistelmä käyttäjätunnusta ja salasanaa, joilla pääset tietokantaan ja sisältävät jokaisen osallistujan tiedot reaaliajassa. Jokaisella keskuksella on pääsy saman keskuksen mukana oleviin tietoihin, eikä muilta keskuksilta. Tutkimusryhmä loi standardoidut lomakkeet (NEAS-lomakkeet), jotka sisältävät olennaiset tiedot, jotka ovat tarpeen tämän tutkimuksen tavoitteiden saavuttamiseksi ja tietojen johdonmukaisuuden takaamiseksi. Laboratoriokokeiden ja kuvantamisen tulokset saadaan lääketieteellisistä asiakirjoista. Tietokannan jatkuvaa seurantaa tekevät JHU:n ja UV:n tiimit.

Kun näytteet on kerätty, ne lähetetään tutkimuksen ydinlaboratorioon, joka sijaitsee UV:ssä (Dr. Beatriz Parra). Jokainen keskus on koulutettu näytteiden oikeaan käsittelyyn, käsittelyyn ja lähettämiseen. Kun näytteet ovat ydinlaboratoriossa, ne jaetaan eriin ja varastoidaan. Veri, virtsa ja selkäydinneste testataan Real Time/Reverse Transcriptase (RT) - Polymerase Chain Reaction (PCR) -menetelmällä Zika- ja Dengue-viruksen viruksen RNA:n (ribonukleiinihapon) esiintymisen suhteen. Seerumi ja selkäydinneste testataan ELISA:lla antiflaviviruksen IgM:n ja IgG:n havaitsemiseksi. Tulokset jaetaan paikallisen tutkimusryhmän ja osallistujasta huolehtivan lääkintäryhmän kanssa. Lisäksi näyteeriä lähetetään JHU:lle immunologisia ja virologisia lisäarviointeja varten (Dr. Carlos Pardo-Vllamizar).

Standard Operative Procedures (SOP) on luotu potilaiden rekrytointia ja suostumusta, REDcap-tietojen syöttämistä sekä bionäytteiden käsittelyä ja lähetystä varten. Tilastollisen analyysin tekevät UV:n epidemiologit (Dr. Lyda Osorio) ja se sisältää muuttujien taajuusmitat ja keskeiset trendimitat. Assosiaatioiden voimakkuuden mittaus tehdään kertoimien suhdetta ja luottamusväliä käyttäen.

TIETOSANAKIRJA

Muuttujat on jaettu kolmeen luokkaan: demografinen, kliininen ja laboratorio. Alla on kuvattu tärkeimmät tutkimuksessa kerätyt muuttujat.

Demografiset muuttujat:

• Tapaus: Asian määritelmä
• Ohjauksen tyyppi: Ohjauksen määritelmä
• Sisällyttämiskriteerien täyttyminen: Protokollassa asetettujen sisällyttämistä koskevien kriteerien täyttyminen
• Sukupuoli: Osallistujan seksuaalinen fenotyyppi, jota tukevat potilastiedot tai henkilöllisyystodistus
• Ikä: Osallistujan ikä sairauskertomusten tai henkilöllisyystodistusten mukaan
• Rotu: Osallistujan ilmoittama fenotyyppi
• Asuinkaupunki: Paikka, jossa on pääosin ollut viimeisen 3 kuukauden aikana
• Raportin kaupunki: Paikka, jossa osallistuja rekrytoidaan tutkimukseen

Kliiniset muuttujat:

• Yleisoireet: Kliiniset oireet, jotka vastaavat osallistujan normaalin terveydentilan heikkenemistä
• Yleisoireet: Yleisoireiden alkamispäivä
• Neurologiset oireet: Kliiniset oireet, jotka heijastavat hermoston epänormaalia toimintaa
• Aikaprofiili: Aika (päivinä) yleisoireiden ilmaantumisen ja neurologisten oireiden välillä
• Vierailu endeemisillä alueilla: Viimeisten 4 viikon aikana vierailtujen alueiden historia, joilla on tällä hetkellä zika-, dengue- ja/tai Chikungunya-viruksen leviäminen paikallisesti
• Aiempi sairaushistoria: Lääkärin diagnosoima tai potilastietoihin kirjattu sairaus viimeisen vuoden aikana
• Sukuhistoria: Ensimmäisen tai toisen sukulaisasteen sukulaisten sairaudet, jotka lääkäri on diagnosoinut tai jotka on raportoitu lääketieteellisissä asiakirjoissa
• Viimeaikainen rokotus: Rokotushistoria viimeisten 4 viikon aikana ennen neurologisten oireiden alkamista
• Äskettäinen tartuntatauti: tartuntatauti viimeisten 4 viikon aikana ennen neurologisten oireiden ilmaantumista
• Viimeaikainen kirurginen toimenpide: historiallinen suuri kirurginen toimenpide viimeisten 4 viikon aikana ennen neurologisten oireiden alkamista
• Fyysisen kokeen päivämäärä: Päivä, jolloin tutkimusryhmä suoritti fyysisen kokeen
• Psyykkinen tila: Oma/ulkoinen tietoisuus
• Orientaatio: Tietoisuus ajasta, paikasta ja henkilöstä
• Dysartria: sanan artikulaatiohäiriö, joka johtuu motoristen teiden vauriosta
• Huomiovaje: Kyvyttömyys keskittyä valikoivasti tiettyyn tiedon osaan
• Aivohermojen poikkeavuudet: Fyysisessä tarkastuksessa havaitun yhden tai useamman aivohermon vaarantuminen
• Lihasvoima: Lihaksen vastustusta vastaan ​​tekemä voima
• Syvät jännerefleksit: Toissijainen laajeneminen syvän jänteen ärsykkeelle
• Sensorinen puute: Aistitoiminnan puuttuminen tai poikkeavuus
• Rombergin merkki: Kliininen merkki, joka viittaa sensoriseen ataksiaan, sekundäärinen selkäpylväiden poikkeavuuksiin
• Ataksia: Epänormaali lihaskoordinaatio vapaaehtoisten liikkeiden aikana
• Lihasjänne: Lihasvastus passiivista liikettä vastaan
• Virtsaretentio: Kyvyttömyys tyhjentää rakko kokonaan
• Matala peräsuolen lihasten sävy: Peräsuolen sulkijalihaksen voiman heikkeneminen
• Epänormaalit liikkeet: Ei tahallisia, tarkoituksettomia liikkeitä, jotka johtuvat neurologisesta toimintahäiriöstä
• Hengitysvajaus: Kyvyttömyys suorittaa tehokasta kaasunvaihtoa tai ylläpitää normaaleja happi- ja/tai hiilidioksiditasoja
• Autonominen toimintahäiriö: autonomisen hermoston poikkeavuudet
• Elektromyografia: Lihasten toiminnan sähköfysiologinen tutkimus
• Elektroenkefalogrammi: Aivojen johtumisen sähköfysiologinen tutkimus
• Aivojen MRI: Aivojen kuvantamistutkimus
• Selkäytimen MRI: Selkäytimen kuvantamistutkimus
• Rankin-pisteet: Toiminnallinen asteikko potilaille, joilla on neurologisia häiriöitä
• ASIA-asteikko: Selkäydinvaurion vakavuus

Laboratoriomuuttujat:

• Verianalyysi: Sisällytä valkosolujen määrä, verihiutaleet, hemoglobiini, hematokriitti ja maksan toimintaentsyymit.
• Selkäydinnesteanalyysi: Sisältää leukosyytit, glukoosin, proteiinit, punasolut, oligoklonaaliset nauhat, viljelmät, herpesviruksen PCR:n.
• Virologinen analyysi: Sisältää IgM:n ja IgG:n havaitsemisen tai puuttumisen ELISA:lla ja RNA:n havaitsemisen RT-PCR:llä Zika-viruksen, Dengue-viruksen ja Chikungunya-viruksen osalta.