Neurologiska manifestationer av Arbovirusinfektionen i Colombia

NEAS leds av Dr Carlos Pardo-Villamizar vid Johns Hopkins University (JHU) och Drs. Beatriz Parra och Lyda Osorio vid Universidad del Valle (UV) i Colombia. De har etablerat ett samarbetsnätverk med läkare, neurologer och experter inom mikrobiologi och epidemiologi i det landet. NEAS rekryterar aktivt patienter på sju universitetsbaserade sjukhus i fem colombianska städer. Protokollet för studien har godkänts i vart och ett av de deltagande centren.

NEAS prospektiva fall-kontrollstudie syftar till att definiera sambandet mellan exponering för arbovirus (Zika, Dengue och Chikungunya) och utvecklingen av ett neurologiskt syndrom hos patienter från Colombia, ett land med endemisk överföring av arbovirus. Fallen definieras som individer som uppträder med ett nytt neurologiskt syndrom av okänd etiologi, inklusive men inte begränsat till encefalit, myelit, meningit, polyneuropati/Guillain-Barre-syndrom och kranialnerven. Det finns två åldersmatchade kontrollgrupper: 1) hushållskontroller och 2) kontroller med febrilt syndrom av okänd etiologi som inte uppvisar neurologisk inblandning. Den uppskattade urvalsstorleken i studien är 50 deltagare i varje grupp (fall och kontroller 1 och 2). Tiden för att samla in hela provstorleken är mellan 12-24 månader och beror på den lokala förekomsten av fall.

Varje center har ett koordinatorteam som inkluderar en neurolog, en läkare - invånare i neurologi eller internmedicin - och en forskningskoordinator. Teamet screenar ständigt de patienter som tas in på centret. De patienter som uppfyller kriterierna för fall eller kontroller kontaktas av forskningskoordinatorn som är ansvarig för att informera deltagaren om studien och slutföra det informerade samtycket. Sedan utför det medicinska teamet den neurologiska utvärderingen, inklusive historien och den fysiska undersökningen enligt NEAS-formulären. Prover av blod och urin samlas in hos alla deltagare. Om en lumbalpunktion görs som en del av standarden för vården samlas även spinalvätska upp. Utifrån tillgång på resurser följs deltagarna varje vecka under en 4-veckorsperiod och vid varje besök genomförs en klinisk bedömning och provtagning.

Demografisk och klinisk information, laboratorie- och bildresultat lagras i en säker webbaserad databas i plattformen REDcap, baserad på JHU. Varje center har en unik kombination av ett användarnamn och ett lösenord för att komma in i databasen och inkludera information om varje deltagare i realtid. Varje center har tillgång till den inkluderade informationen av samma center och inte av andra centra. Standardiserade formulär (NEAS-formulär) skapades av studiegruppen som innehåller relevant information som är nödvändig för att uppnå målen med denna studie och garanterar datakonsistensen. Laboratorieundersökningar och avbildningsresultat erhålls från journalerna. En permanent övervakning av databasen görs av teamen på JHU och UV.

Efter att proverna har samlats in skickas de till studiens kärnlaboratorium vid UV (Dr. Beatriz Parra). Varje center har utbildats i korrekt hantering, bearbetning och frakt av proverna. När proverna är i kärnlaboratoriet, delas de upp i alikvoter och lagras. Blod, urin och ryggmärgsvätska testas med Real Time/Reverse Transcriptase (RT) - Polymerase Chain Reaction (PCR) för närvaron av viralt RNA (ribonukleinsyra) från Zika-virus och Dengue-virus. Serum och spinalvätska testas med ELISA för detektion av anti-flavivirus IgM och IgG. Resultaten delas med det lokala studieteamet och med det medicinska teamet som tar hand om deltagaren. Dessutom skickas alikvoter av prover till JHU för ytterligare immunologiska och virologiska bedömningar (Dr. Carlos Pardo-Vllamizar).

Standard Operative Procedures (SOP) har skapats för patientrekrytering och samtycke, REDcap-datainmatning och bioprovsprocess och leverans. Den statistiska analysen kommer att göras av epidemiologer vid UV (Dr. Lyda Osorio) och det kommer att innehålla frekvensmått och centrala tendensmått för variablerna. Mätningen av associationsstyrkan kommer att göras med hjälp av Odds ratio och konfidensintervall.

DATA ORDBOK

Variablerna är indelade i tre kategorier: demografiska, kliniska och laboratoriemässiga. De mest relevanta variablerna som samlats in i studien beskrivs nedan.

Demografiska variabler:

• Fall: Falldefinition
• Typ av kontroll: Kontrolldefinition
• Uppfyllelse av inklusionskriterierna: Uppfyllelse av inklusionskriterierna som fastställts i protokollet
• Kön: Sexuell fenotyp av deltagaren med stöd av journaler eller ID
• Ålder: Deltagarens ålder enligt journal eller legitimation
• Ras: Fenotyp rapporterad av deltagaren
• Bostadsort: Plats där har huvudsakligen varit under de senaste 3 månaderna
• Rapportort: ​​Plats där deltagaren rekryteras till studien

Kliniska variabler:

• Allmänna symtom: Kliniska manifestationer överensstämmer med minskning av den normala hälsoformen hos deltagaren
• Debut av allmänna symtom: Datum för debut av allmänna symtom
• Neurologiska symtom: Kliniska manifestationer som återspeglar en onormal funktion av nervsystemet
• Temporal profil: Tid (i dagar) mellan uppkomsten av allmänna symtom och neurologiska symtom
• Besök i endemiska regioner: Historia om har besökt regioner under de senaste 4 veckorna med aktuell lokal överföring av Zika-, Dengue- och/eller Chikungunya-virus
• Tidigare medicinsk historia: Historik om en sjukdom som diagnostiserats av läkaren eller rapporterats i journalerna under det senaste året
• Familjehistoria: Sjukdomar som drabbats av släktingar i första eller andra släktskapsgraden diagnostiserade av läkaren eller rapporterade i journalerna
• Nylig vaccination: Historik av vaccination under de senaste 4 veckorna innan de neurologiska symtomen debuterade
• Senaste infektionssjukdom: Historik av en infektionssjukdom under de senaste 4 veckorna innan de neurologiska symtomen debuterade
• Nyligen kirurgiskt ingrepp: Historik om ett större kirurgiskt ingrepp under de senaste 4 veckorna innan de neurologiska symtomen började
• Datum för fysisk undersökning: Datum då den fysiska undersökningen genomfördes av studiegruppen
• Mental status: Omfattning av eget/yttre medvetande
• Orientering: Medvetenhet om tid, plats och person
• Dysartri: Ordartikulationsdysfunktion sekundärt till skada på motorvägar
• Uppmärksamhetsbrist: Oförmåga att selektivt koncentrera sig på en specifik del av informationen
• Kranialnerveravvikelser: Kompromiss av en/fler av kranialnerverna som upptäcktes vid den fysiska undersökningen
• Muskelstyrka: Mängden styrka som en muskel gör mot motstånd
• Djupa senreflexer: Förlängning sekundärt till en djup senstimulus
• Sensoriskt underskott: Frånvaro eller abnormitet i sensorisk funktion
• Rombergstecken: Kliniskt tecken som tyder på sensorisk ataxi, sekundärt till avvikelser i ryggpelaren
• Ataxi: Onormal muskelkoordination vid frivilliga rörelser
• Muskeltonus: Muskelmotstånd mot passiv rörelse
• Urinretention: Oförmåga att fullborda urinblåsan
• Låg rektal muskeltonus: Minskad styrka hos den rektala slutmuskeln
• Onormala rörelser: Inga frivilliga rörelser, utan syfte, sekundärt till en neurologisk dysfunktion
• Andningssvikt: Oförmåga att utföra ett effektivt gasutbyte eller att upprätthålla normala nivåer av syre och/eller koldioxid
• Autonom dysfunktion: Avvikelser i det autonoma nervsystemet
• Elektromyografi: Elektrofysiologisk studie av muskelaktiviteten
• Elektroencefalogram: Elektrofysiologisk studie av hjärnans ledning
• Hjärn-MR: Avbildningsstudie av hjärnan
• Ryggmärgs-MR: Avbildningsstudie av ryggmärgen
• Rankinpoäng: Funktionell skala för patienter med neurologiska störningar
• ASIA-skala: Svårighetsgraden av ryggmärgsskadan

Laboratorievariabler:

• Blodanalys: Inkludera antal vita blodkroppar, blodplättar, hemoglobin, hematokrit och leverfunktionsenzymer.
• Spinalvätskeanalys: Inkluderar leukocyter, glukos, proteiner, röda blodkroppar, oligoklonala band, kulturer, herpesvirus PCR.
• Virologisk analys: Inkluderar detektion eller frånvaro av detektion av IgM och IgG med ELISA och RNA med RT-PCR för Zika-virus, Dengue-virus och Chikungunya-virus.