Manifestacje neurologiczne zakażenia arbowirusem w Kolumbii

NEAS jest kierowany przez dr Carlosa Pardo-Villamizara z Johns Hopkins University (JHU) i dr. Beatriz Parra i Lyda Osorio z Universidad del Valle (UV) w Kolumbii. Utworzyli sieć współpracy z lekarzami, neurologami i ekspertami w dziedzinie mikrobiologii i epidemiologii w tym kraju. NEAS aktywnie rekrutuje pacjentów w siedmiu szpitalach uniwersyteckich w pięciu kolumbijskich miastach. Protokół badania został zatwierdzony w każdym z uczestniczących ośrodków.

Prospektywne badanie kliniczno-kontrolne NEAS ma na celu określenie związku między ekspozycją na arbowirusa (Zika, denga i Chikungunya) a rozwojem zespołu neurologicznego u pacjentów z Kolumbii, kraju o endemicznym przenoszeniu arbowirusa. Przypadki definiuje się jako osoby, u których wystąpił nowy zespół neurologiczny o nieznanej etiologii, w tym między innymi zapalenie mózgu, zapalenie rdzenia kręgowego, zapalenie opon mózgowych, polineuropatia/zespół Guillain-Barre i zajęcie nerwów czaszkowych. Istnieją dwie grupy kontrolne dobrane pod względem wieku: 1) kontrole domowe i 2) kontrole z zespołem gorączkowym o nieznanej etiologii, które nie wykazują zajęcia neurologicznego. Szacunkowa wielkość próby w badaniu to 50 uczestników w każdej grupie (przypadki i kontrole 1 i 2). Czas na zebranie pełnej wielkości próby wynosi od 12 do 24 miesięcy i zależy od lokalnej częstości występowania przypadków.

Każdy ośrodek posiada zespół koordynatorów, w skład którego wchodzi neurolog, lekarz rezydent neurologii lub chorób wewnętrznych oraz koordynator badań. Zespół cały czas prowadzi badania przesiewowe pacjentów przyjmowanych do ośrodka. Z pacjentami spełniającymi kryteria przypadków lub kontroli kontaktuje się koordynator badania, którego zadaniem jest poinformowanie uczestnika o badaniu i wypełnienie świadomej zgody. Następnie zespół medyczny przeprowadza ocenę neurologiczną, w tym wywiad i badanie fizykalne według formularzy NEAS. U wszystkich uczestników pobierane są próbki krwi i moczu. Jeśli nakłucie lędźwiowe jest wykonywane w ramach standardowej opieki, pobierany jest również płyn rdzeniowy. W zależności od dostępności zasobów, uczestnicy są obserwowani co tydzień przez okres 4 tygodni, a podczas każdej wizyty przeprowadzana jest ocena kliniczna i pobieranie próbek.

Informacje demograficzne i kliniczne, wyniki laboratoryjne i obrazowe są przechowywane w zabezpieczonej internetowej bazie danych na platformie REDcap z siedzibą w JHU. Każde centrum ma unikalną kombinację nazwy użytkownika i hasła, aby wejść do bazy danych i zawierać informacje o każdym uczestniku w czasie rzeczywistym. Każdy ośrodek ma dostęp do zawartych w nim informacji przez ten sam ośrodek, a nie przez inne ośrodki. Zespół badawczy stworzył wystandaryzowane formularze (formularze NEAS), które zawierają istotne informacje niezbędne do osiągnięcia celów niniejszego badania i gwarantują spójność danych. Wyniki badań laboratoryjnych i obrazowych uzyskuje się z dokumentacji medycznej. Stałym monitoringiem bazy danych zajmują się zespoły JHU i UV.

Po pobraniu próbek są one wysyłane do głównego laboratorium badawczego zlokalizowanego w UV (Dr. Beatriz Parra). Każdy ośrodek został przeszkolony w zakresie prawidłowej obsługi, przetwarzania i wysyłki próbek. Gdy próbki znajdą się w głównym laboratorium, są dzielone na porcje i przechowywane. Krew, mocz i płyn mózgowo-rdzeniowy są badane metodą reakcji łańcuchowej polimerazy (RT) w czasie rzeczywistym/odwrotnej transkryptazy (PCR) na obecność wirusowego RNA (kwasu rybonukleinowego) wirusa Zika i wirusa dengi. Surowicę i płyn mózgowo-rdzeniowy bada się metodą ELISA w celu wykrycia antyflawiwirusowych IgM i IgG. Wyniki są udostępniane lokalnemu zespołowi badawczemu oraz zespołowi medycznemu opiekującemu się uczestnikiem. Ponadto porcje próbek są przesyłane do UJH w celu wykonania dodatkowych badań immunologicznych i wirusologicznych (Dr. Carlosa Pardo-Vllamizara).

Standardowe procedury operacyjne (SOP) zostały stworzone w celu rekrutacji i zgody pacjentów, wprowadzania danych REDcap oraz przetwarzania i wysyłki biopróbek. Analiza statystyczna zostanie przeprowadzona przez epidemiologów z UV (dr. Lyda Osorio) i będzie zawierał miary częstości i miary tendencji centralnej zmiennych. Miara siły związku zostanie przeprowadzona przy użyciu ilorazu szans i przedziałów ufności.

SŁOWNIK DANYCH

Zmienne podzielono na trzy kategorie: demograficzne, kliniczne i laboratoryjne. Poniżej opisano najważniejsze zmienne zebrane w badaniu.

Zmienne demograficzne:

• Przypadek: Definicja przypadku
• Rodzaj kontroli: Definicja kontroli
• Spełnienie kryteriów włączenia: Spełnienie kryteriów włączenia określonych w protokole
• Płeć: Fenotyp płciowy uczestnika potwierdzony dokumentacją medyczną lub dowodem osobistym
• Wiek: Wiek uczestnika zgodnie z dokumentacją medyczną lub dowodem osobistym
• Rasa: Fenotyp zgłoszony przez uczestnika
• Miasto zamieszkania: Miejsce, w którym głównie przebywał w ciągu ostatnich 3 miesięcy
• Miasto raportu: Miejsce rekrutacji uczestnika do badania

Zmienne kliniczne:

• Objawy ogólne: Objawy kliniczne odpowiadające pogorszeniu prawidłowego stanu zdrowia uczestnika
• Początek objawów ogólnych: Data wystąpienia objawów ogólnych
• Objawy neurologiczne: Objawy kliniczne odzwierciedlające nieprawidłowe funkcjonowanie układu nerwowego
• Profil czasowy: Czas (w dniach) między wystąpieniem objawów ogólnych a objawami neurologicznymi
• Wizyta w regionach endemicznych: Historia odwiedzonych w ciągu ostatnich 4 tygodni regionów z aktualną lokalną transmisją wirusa Zika, Denga i/lub Chikungunya
• Przeszła historia medyczna: Historia choroby zdiagnozowanej przez lekarza lub zgłoszonej w dokumentacji medycznej w ciągu ostatniego roku
• Wywiad rodzinny: Choroby pokrewieństwa pierwszego lub drugiego stopnia rozpoznane przez lekarza lub stwierdzone w dokumentacji medycznej
• Ostatnie szczepienie: historia szczepień w ciągu ostatnich 4 tygodni przed wystąpieniem objawów neurologicznych
• Niedawna choroba zakaźna: Historia choroby zakaźnej w ciągu ostatnich 4 tygodni przed wystąpieniem objawów neurologicznych
• Niedawny zabieg chirurgiczny: Historia poważnego zabiegu chirurgicznego w ciągu ostatnich 4 tygodni przed wystąpieniem objawów neurologicznych
• Data badania fizykalnego: Data zakończenia badania przedmiotowego przez zespół badawczy
• Stan psychiczny: Zakres świadomości własnej/zewnętrznej
• Orientacja: Świadomość czasu, miejsca i osoby
• Dyzartria: dysfunkcja artykulacji słów wtórna do uszkodzenia dróg ruchowych
• Deficyt uwagi: niezdolność do wybiórczego skupienia się na określonej części informacji
• Nieprawidłowości nerwów czaszkowych: Uszkodzenie jednego lub kilku nerwów czaszkowych wykryte podczas badania fizykalnego
• Siła mięśniowa: ilość siły mięśnia w stosunku do oporu
• Odruchy ścięgien głębokich: Wydłużenie wtórne do bodźca ścięgien głębokich
• Deficyt sensoryczny: brak lub nieprawidłowość w funkcji czuciowej
• Objaw Romberga: objaw kliniczny sugerujący ataksję czuciową, wtórną do nieprawidłowości kręgosłupa
• Ataksja: Nieprawidłowa koordynacja mięśni podczas ruchów dobrowolnych
• Napięcie mięśniowe: Odporność mięśni na ruch bierny
• Zatrzymanie moczu: niemożność całkowitego opróżnienia pęcherza
• Niskie napięcie mięśni odbytnicy: Zmniejszenie siły zwieracza odbytnicy
• Nieprawidłowe ruchy: Brak ruchów dobrowolnych, bez celu, wtórny do dysfunkcji neurologicznej
• Niewydolność oddechowa: Niezdolność do skutecznej wymiany gazowej lub utrzymania normalnego poziomu tlenu i/lub dwutlenku węgla
• Dysfunkcja autonomiczna: Nieprawidłowości w autonomicznym układzie nerwowym
• Elektromiografia: Elektrofizjologiczne badanie aktywności mięśni
• Elektroencefalogram: elektrofizjologiczne badanie przewodnictwa mózgowego
• MRI mózgu: badanie obrazowe mózgu
• MRI rdzenia kręgowego: Badanie obrazowe rdzenia kręgowego
• Skala Rankina: Funkcjonalna skala dla pacjentów z zaburzeniami neurologicznymi
• Skala ASIA: ciężkość uszkodzenia rdzenia kręgowego

Zmienne laboratoryjne:

• Analiza krwi: Uwzględnij liczbę białych krwinek, płytki krwi, hemoglobinę, hematokryt i enzymy wątrobowe.
• Analiza płynu rdzeniowego: Obejmuje leukocyty, glukozę, białka, krwinki czerwone, prążki oligoklonalne, hodowle, PCR wirusa opryszczki.
• Analiza wirusologiczna: Obejmuje wykrywanie lub brak wykrywania IgM i IgG za pomocą testu ELISA oraz RNA za pomocą RT-PCR dla wirusa Zika, wirusa dengi i wirusa Chikungunya.