Nevrologiske manifestasjoner av arbovirusinfeksjon i Colombia

NEAS ledes av Dr. Carlos Pardo-Villamizar ved Johns Hopkins University (JHU) og Drs. Beatriz Parra og Lyda Osorio ved Universidad del Valle (UV) i Colombia. De har etablert et samarbeidsnettverk med leger, nevrologer og eksperter innen mikrobiologi og epidemiologi i landet. NEAS rekrutterer aktivt pasienter ved syv universitetsbaserte sykehus i fem colombianske byer. Protokollen for studien er godkjent i hvert av de deltakende sentrene.

NEAS prospektive case-control studie tar sikte på å definere sammenhengen mellom eksponering for arbovirus (Zika, Dengue og Chikungunya) og utviklingen av et nevrologisk syndrom hos pasienter fra Colombia, et land med endemisk overføring av arbovirus. Tilfellene er definert som individer som har et nyoppstått nevrologisk syndrom med ukjent etiologi, inkludert men ikke begrenset til encefalitt, myelitt, meningitt, polynevropati/Guillain-Barre syndrom og kranial nervepåvirkning. Det er to alderstilpassede kontrollgrupper: 1) husholdningskontroller og 2) kontroller med febrilt syndrom av ukjent etiologi som ikke viser nevrologisk involvering. Estimert utvalgsstørrelse i studien er 50 deltakere i hver gruppe (tilfelle og kontroll 1 og 2). Tiden for å samle inn hele prøvestørrelsen er mellom 12-24 måneder, og avhenger av den lokale forekomsten av tilfeller.

Hvert senter har et koordinatorteam som inkluderer en nevrolog, en lege - beboer i nevrologi eller indremedisin - og en forskningskoordinator. Teamet screener kontinuerlig pasientene som er innlagt på senteret. Pasientene som oppfyller kriteriene for tilfeller eller kontroller blir kontaktet av forskningskoordinatoren som er ansvarlig for å informere deltakeren om studien og fullføre det informerte samtykket. Deretter utfører det medisinske teamet den nevrologiske evalueringen, inkludert historien og den fysiske undersøkelsen i henhold til NEAS-skjemaene. Det tas blod- og urinprøver hos alle deltakere. Hvis en lumbalpunksjon gjøres som en del av standarden for omsorg, samles også spinalvæske. Basert på ressurstilgjengelighet følges deltakerne hver uke i en 4-ukers periode og ved hvert besøk gjennomføres en klinisk vurdering og prøvetaking.

Demografisk og klinisk informasjon, laboratorie- og bilderesultater lagres i en sikret nettbasert database i plattformen REDcap, basert på JHU. Hvert senter har en unik kombinasjon av et brukernavn og et passord for å gå inn i databasen og inkludere informasjonen til hver deltaker i sanntid. Hvert senter har tilgang til den inkluderte informasjonen fra samme senter og ikke av andre sentre. Standardiserte skjemaer (NEAS-skjemaer) ble laget av studieteamet som inkluderer relevant informasjon som er nødvendig for å oppnå målene med denne studien og garanterer datakonsistensen. Laboratorieprøver og bilderesultater hentes fra journalen. En permanent overvåking av datagrunnlaget gjøres av teamene ved JHU og UV.

Etter at prøvene er samlet blir de sendt til studiens kjernelaboratorium som ligger ved UV (Dr. Beatriz Parra). Hvert senter har fått opplæring i riktig håndtering, prosessering og forsendelse av prøvene. Når prøvene er i kjernelaboratoriet, blir de alikvotert og lagret. Blod, urin og spinalvæske testes med sanntid/revers transkriptase (RT) - Polymerase Chain Reaction (PCR) for tilstedeværelse av viralt RNA (ribonukleinsyre) av Zika-virus og Dengue-virus. Serum og spinalvæske testes med ELISA for påvisning av anti-flavivirus IgM og IgG. Resultatene deles med det lokale studieteamet og med det medisinske teamet som tar seg av deltakeren. I tillegg sendes alikvoter av prøver til JHU for ytterligere immunologiske og virologiske vurderinger (Dr. Carlos Pardo-Vllamizar).

Standard Operative Procedures (SOP) er laget for pasientrekruttering og samtykke, REDcap-datainntasting og bioprøveprosesser og -forsendelse. Den statistiske analysen vil bli gjort av epidemiologer ved UV (Dr. Lyda Osorio) og den vil inkludere frekvensmål og sentrale tendensmål for variablene. Målingen av assosiasjonsstyrken vil bli gjort ved å bruke Odds ratio og konfidensintervaller.

DATAORDBOK

Variablene er delt inn i tre kategorier: demografisk, klinisk og laboratoriemessig. De mest relevante variablene samlet inn i studien er beskrevet nedenfor.

Demografiske variabler:

• Sak: Saksdefinisjon
• Type kontroll: Kontrolldefinisjon
• Oppfyllelse av inklusjonskriteriene: Oppfyllelse av inklusjonskriteriene fastsatt av protokollen
• Kjønn: Seksuell fenotype av deltakeren støttet av medisinske journaler eller ID
• Alder: Deltakerens alder i henhold til journal eller ID
• Rase: Fenotype rapportert av deltakeren
• Bosted: Sted hvor det hovedsakelig har vært de siste 3 månedene
• Rapportsted: Sted hvor deltakeren rekrutteres til studien

Kliniske variabler:

• Generelle symptomer: Kliniske manifestasjoner forenlig med reduksjon i normal helseform hos deltakeren
• Debut av generelle symptomer: Dato for debut av generelle symptomer
• Nevrologiske symptomer: Kliniske manifestasjoner som reflekterer unormal funksjon av nervesystemet
• Temporal profil: Tid (i dager) mellom debut av generelle symptomer og nevrologiske symptomer
• Besøk til endemiske regioner: Historie om regioner som har besøkt de siste 4 ukene med nåværende lokal overføring av Zika, Dengue og/eller Chikungunya-virus
• Tidligere sykehistorie: Historie om en sykdom diagnostisert av legen eller rapportert i journalen i løpet av det siste året
• Familiehistorie: Sykdommer påført av slektninger i første eller andre grad av slektninger diagnostisert av legen eller rapportert i medisinske journaler
• Nylig vaksinasjon: Anamnese med vaksinasjon de siste 4 ukene før de nevrologiske symptomene begynte
• Nylig infeksjonssykdom: Historie om en infeksjonssykdom i løpet av de siste 4 ukene før de nevrologiske symptomene begynte
• Nylig kirurgisk prosedyre: Historie om et større kirurgisk inngrep i løpet av de siste 4 ukene før de nevrologiske symptomene begynte
• Dato for fysisk eksamen: Dato da fysisk eksamen ble gjennomført av studieteamet
• Mental status: Omfang av egen/ytre bevissthet
• Orientering: Bevissthet om tid, sted og person
• Dysartri: Ordartikulasjonsdysfunksjon sekundært til skade på motorveier
• Oppmerksomhetssvikt: Manglende evne til å selektivt konsentrere seg om en bestemt del av informasjonen
• Kraniale nerveavvik: Kompromittering av en/flere av kranienervene oppdaget på den fysiske undersøkelsen
• Muskelstyrke: Mengde styrke utført av en muskel mot motstand
• Dype senereflekser: Forlengelse sekundært til en dyp senestimulus
• Sensorisk underskudd: Fravær eller abnormitet i sansefunksjonen
• Romberg-tegn: Klinisk tegn som tyder på sensorisk ataksi, sekundært til dorsalkolonneravvik
• Ataksi: Unormal muskelkoordinasjon under frivillige bevegelser
• Muskeltonus: Muskelmotstand mot passiv bevegelse
• Urinretensjon: Manglende evne til å fullføre blæretømhet
• Lav rektal muskeltonus: Nedgang i styrken til endetarmssfinkteren
• Unormale bevegelser: Ingen frivillige bevegelser, uten formål, sekundært til en nevrologisk dysfunksjon
• Respirasjonssvikt: Manglende evne til å utføre en effektiv gassutveksling eller opprettholde normale nivåer av oksygen og/eller karbondioksid
• Autonom dysfunksjon: Abnormiteter i det autonome nervesystemet
• Elektromyografi: Elektrofysiologisk studie av muskelaktiviteten
• Elektroencefalogram: Elektrofysiologisk studie av hjernens ledning
• Hjerne MR: Bildestudie av hjernen
• Ryggmarg MR: Bildestudie av ryggmargen
• Rankin score: Funksjonell skala for pasienter med nevrologiske lidelser
• ASIA-skala: Alvorlighetsgrad av ryggmargslesjon

Laboratorievariabler:

• Blodanalyse: Inkluder antall hvite blodlegemer, blodplater, hemoglobin, hematokrit og leverfunksjonsenzymer.
• Spinalvæskeanalyse: Inkluderer leukocytter, glukose, proteiner, røde blodlegemer, oligoklonale bånd, kulturer, herpesvirus PCR.
• Virologisk analyse: Inkluderer påvisning eller fravær av påvisning av IgM og IgG ved ELISA, og RNA ved RT-PCR for Zika-virus, Dengue-virus og Chikungunya-virus.