Manifestations neurologiques de l'infection à arbovirus en Colombie

NEAS est dirigé par le Dr Carlos Pardo-Villamizar de l'Université Johns Hopkins (JHU) et les Drs. Beatriz Parra et Lyda Osorio à l'Universidad del Valle (UV) en Colombie. Ils ont établi un réseau de collaboration avec des médecins, des neurologues et des experts en microbiologie et en épidémiologie dans ce pays. NEAS recrute activement des patients dans sept hôpitaux universitaires de cinq villes colombiennes. Le protocole de l'étude a été approuvé dans chacun des centres participants.

L'étude prospective cas-témoins NEAS vise à définir l'association entre l'exposition aux arbovirus (Zika, Dengue et Chikungunya) et le développement d'un syndrome neurologique chez des patients de Colombie, pays à transmission endémique des arbovirus. Les cas sont définis comme des individus qui présentent une nouvelle apparition d'un syndrome neurologique d'étiologie inconnue, y compris, mais sans s'y limiter, l'encéphalite, la myélite, la méningite, la polyneuropathie/syndrome de Guillain-Barré et l'atteinte des nerfs crâniens. Il existe deux groupes témoins appariés selon l'âge : 1) les témoins du ménage et 2) les témoins avec un syndrome fébrile d'étiologie inconnue qui ne présente pas d'atteinte neurologique. La taille estimée de l'échantillon dans l'étude est de 50 participants dans chaque groupe (cas et témoins 1 et 2). Le délai de collecte de la taille complète de l'échantillon est compris entre 12 et 24 mois et dépend de l'incidence locale des cas.

Chaque centre dispose d'une équipe coordinatrice composée d'un neurologue, d'un médecin - interne en neurologie ou médecine interne - et d'un coordinateur de recherche. L'équipe contrôle en permanence les patients admis au centre. Les patients qui remplissent les critères de cas ou de témoins sont approchés par le coordinateur de recherche qui est chargé d'informer le participant sur l'étude et de compléter le consentement éclairé. Ensuite, l'équipe médicale effectue l'évaluation neurologique, y compris l'anamnèse et l'examen physique selon les formulaires NEAS. Des échantillons de sang et d'urine sont prélevés chez tous les participants. Si une ponction lombaire est effectuée dans le cadre de la norme de soins, le liquide céphalo-rachidien est également prélevé. En fonction de la disponibilité des ressources, les participants sont suivis chaque semaine pendant une période de 4 semaines et à chaque visite, une évaluation clinique et un prélèvement d'échantillons sont effectués.

Les informations démographiques et cliniques, les résultats de laboratoire et d'imagerie sont stockés dans une base de données sécurisée en ligne sur la plateforme REDcap, basée à JHU. Chaque centre possède une combinaison unique d'un nom d'utilisateur et d'un mot de passe pour entrer dans la base de données et inclure les informations de chaque participant en temps réel. Chaque centre a accès aux informations incluses par le même centre et non par d'autres centres. Des formulaires standardisés (formulaires NEAS) ont été créés par l'équipe d'étude qui incluent les informations pertinentes nécessaires pour atteindre les objectifs de cette étude et garantir la cohérence des données. Les tests de laboratoire et les résultats d'imagerie sont obtenus à partir des dossiers médicaux. Un suivi permanent de la base de données est assuré par les équipes de JHU et UV.

Une fois les échantillons prélevés, ils sont expédiés au laboratoire principal de l'étude situé à l'UV (Dr. Béatrice Parra). Chaque centre a été formé à la manipulation, au traitement et à l'expédition corrects des échantillons. Une fois que les échantillons sont dans le laboratoire principal, ils sont aliquotés et stockés. Le sang, l'urine et le liquide céphalo-rachidien sont testés par Real Time/Reverse Transcriptase (RT) - Polymerase Chain Reaction (PCR) pour la présence d'ARN viral (acide ribonucléique) du virus Zika et du virus de la dengue. Le sérum et le liquide céphalo-rachidien sont testés par ELISA pour la détection des IgM et IgG anti-flavivirus. Les résultats sont partagés avec l'équipe d'étude locale et avec l'équipe médicale prenant en charge le participant. De plus, des aliquotes d'échantillons sont envoyées au JHU pour des évaluations immunologiques et virologiques supplémentaires (Dr. Carlos Pardo-Vllamizar).

Des procédures opératoires standard (SOP) ont été créées pour le recrutement et le consentement des patients, la saisie des données REDcap et le processus et l'expédition des échantillons biologiques. L'analyse statistique sera faite par les épidémiologistes de l'UV (Dr. Lyda Osorio) et comprendra des mesures de fréquence et des mesures de tendance centrale des variables. La mesure de la force de l'association se fera à l'aide des rapports de cotes et des intervalles de confiance.

DICTIONNAIRE DE DONNÉES

Les variables sont divisées en trois catégories : démographiques, cliniques et de laboratoire. Les variables les plus pertinentes recueillies dans l'étude sont décrites ci-dessous.

Variables démographiques:

• Cas : Définition de cas
• Type de contrôle : Définition du contrôle
• Satisfaction des critères d'inclusion : Satisfaction des critères d'inclusion établis par le protocole
• Sexe : phénotype sexuel du participant appuyé par le dossier médical ou la pièce d'identité
• Âge : âge du participant selon le dossier médical ou la pièce d'identité
• Race : Phénotype rapporté par le participant
• Ville de résidence : Lieu où a été principalement au cours des 3 derniers mois
• Ville du rapport : Lieu où le participant est recruté pour l'étude

Variables cliniques :

• Symptômes généraux : manifestations cliniques compatibles avec une diminution de l'état de santé normal du participant
• Début des symptômes généraux : Date du début des symptômes généraux
• Symptômes neurologiques : Manifestations cliniques traduisant un fonctionnement anormal du système nerveux
• Profil temporel : Temps (en jours) entre le début des symptômes généraux et les symptômes neurologiques
• Visite dans des régions endémiques : Antécédents de visites au cours des 4 dernières semaines dans des régions avec transmission locale actuelle du virus Zika, Dengue et/ou Chikungunya
• Antécédents médicaux : Antécédents d'une maladie diagnostiquée par le médecin ou signalée dans le dossier médical au cours de l'année écoulée
• Antécédents familiaux : Maladies subies par des parents au premier ou au deuxième degré de consanguinité diagnostiquées par le médecin ou signalées dans les dossiers médicaux
• Vaccination récente : Antécédents de vaccination au cours des 4 semaines précédant l'apparition des symptômes neurologiques
• Maladie infectieuse récente : Antécédents de maladie infectieuse au cours des 4 dernières semaines précédant l'apparition des symptômes neurologiques
• Intervention chirurgicale récente : Antécédents d'intervention chirurgicale majeure au cours des 4 dernières semaines précédant l'apparition des symptômes neurologiques
• Date de l'examen physique : date à laquelle l'examen physique a été effectué par l'équipe d'étude
• État mental : Étendue de la conscience propre/extérieure
• Orientation : Conscience du temps, du lieu et de la personne
• Dysarthrie : Dysfonctionnement de l'articulation des mots secondaire à une atteinte des voies motrices
• Déficit d'attention : incapacité à se concentrer de manière sélective sur une partie spécifique de l'information
• Anomalies des nerfs crâniens : atteinte d'un ou de plusieurs nerfs crâniens détectée à l'examen physique
• Force musculaire : Quantité de force exercée par un muscle contre une résistance
• Réflexes tendineux profonds : Extension secondaire à une stimulation tendineuse profonde
• Déficit sensoriel : Absence ou anomalie de la fonction sensorielle
• Signe de Romberg : Signe clinique évocateur d'ataxie sensorielle, secondaire à des anomalies des colonnes dorsales
• Ataxie : Coordination musculaire anormale lors de mouvements volontaires
• Tonus musculaire : Résistance musculaire contre les mouvements passifs
• Rétention urinaire : Incapacité à vider complètement la vessie
• Faible tonicité musculaire rectale : Diminution de la force du sphincter rectal
• Mouvements anormaux : Aucun mouvement volontaire, sans but, secondaire à un dysfonctionnement neurologique
• Insuffisance respiratoire : incapacité à effectuer un échange gazeux efficace ou à maintenir des niveaux normaux d'oxygène et/ou de dioxyde de carbone
• Dysfonctionnement autonome : anomalies du système nerveux autonome
• Électromyographie : étude électrophysiologique de l'activité musculaire
• Électroencéphalogramme : étude électrophysiologique de la conduction cérébrale
• IRM cérébrale : Etude d'imagerie du cerveau
• IRM de la moelle épinière : Etude d'imagerie de la moelle épinière
• Score de Rankin : Échelle fonctionnelle pour les patients atteints de troubles neurologiques
• Échelle ASIA : Sévérité de la lésion médullaire

Variables de laboratoire :

• Analyse de sang : inclure le nombre de globules blancs, les plaquettes, l'hémoglobine, l'hématocrite et les enzymes de la fonction hépatique.
• Analyse du liquide céphalo-rachidien : Comprend les leucocytes, le glucose, les protéines, les globules rouges, les bandes oligoclonales, les cultures, la PCR du virus de l'herpès.
• Analyse virologique : Comprend la détection ou l'absence de détection des IgM et IgG par ELISA, et de l'ARN par RT-PCR pour le virus Zika, le virus de la Dengue et le virus Chikungunya.