Perheen IBD:n mikrobiomi ja geneettinen analyysi
Tulehduksellista suolistosairautta sairastavien perheenjäsenten mikrobiomi ja geneettinen analyysi
Tulehduksellinen suolistosairaus (IBD) on krooninen tulehdustila maha-suolikanavassa.
Sen patogeneesistä on tehty lukuisia tutkimuksia, jotka osoittavat monimutkaisen yhteyden geneettisten ja ympäristötekijöiden välillä.
Koreassa IBD:n ilmaantuvuus kasvaa nopeasti, mutta geneettiset tutkimukset pelkästään korealaista syntyperää olevilla potilailla eivät olleet riittäviä.
Siksi tutkijat suunnittelivat suorittavansa geneettisen ja ulosteen mikrobianalyysin 60 yksilölle 30 korealaisesta IBD-perheestä selvittääkseen IBD:n patogeneesin.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Yksityiskohtainen kuvaus
Olettaen, että IBD-perhepotilaiden keskuudessa havaitaan enemmän riskivariantteja kuin IBD-potilailla, joilla ei ole muita sairastuneita perheenjäseniä, tutkijat suunnittelivat geneettisen ja ulosteen mikrobiomianalyysin 60 potilaalle 30 perheestä.
Verinäytteistä DNA:n erottamisen jälkeen suoritetaan koko genomin sekvensointi ja tietoja verrataan aiemmin raportoituihin variansseihin. Uudet varianssit tai spesifisten varianssien esiintyvyys mitataan.
Genominlaajuinen yhden nukleotidin polymorfismiryhmä Immunochipiä käyttäen suoritetaan yleisten geneettisten varianttien etsimiseksi ja IBD:n geneettisen riskin laskemiseksi.
Tässä tutkimuksessa ulosteen mikrobiomi on korvaava merkki IBD:n patogeneesin ympäristönäkökulmasta. Tutkijat olettivat, että perheenjäsenet jakavat samanlaisen elämäntavan, joten oletamme, että heidän ulosteen mikrobikoostumus on samanlainen.
Vertaamalla geneettisiä ja mikrobitietoja kokonaan terveen perheenjäsenen tietoihin (terve sisäinen valvonta), tutkijat odottavat selittävän IBD:n patogeneesin geneettisen ja ympäristöllisen puolen.
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Todellinen)
Yhteystiedot ja paikat
Opiskelupaikat
-
-
-
Seoul, Korean tasavalta, 180-702
- Kyung Hee University Medical Center
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
- Lapsi
- Aikuinen
- Vanhempi Aikuinen
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Sukupuolet, jotka voivat opiskella
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Tutkijoiden on tarkoitus tutkia perheenjäseniä, joilla on IBD (Crohnin tauti tai haavainen paksusuolitulehdus).
He ovat kaikki korealaista syntyperää, ja tutkimusehdokkaita on kaksi potilasta kustakin 30 perheestä. Terveenä sisäisenä kontrollina rekisteröidään myös toinen perheenjäsen, jolla ei ole IBD-historiaa.
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- 60 henkilöä 30 Crohnin taudin tai haavaisen paksusuolitulehduksen perheestä.
- Ei vaikuta 30 yksilöä jokaisesta perheestä terveenä sisäisenä kontrollina.
Poissulkemiskriteerit:
- Henkilö, joka on käyttänyt antibiootteja tai probiootteja edellisten 4 viikon aikana.
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Tulehduksellisen suolistosairauden harvinaiset geneettiset variantit
Aikaikkuna: Kolme kuukautta näytteenoton jälkeen
|
Tulokset tutkimukseen osallistuneiden verinäytteiden koko genomin sekvensoinnista.
Suunniteltu verrata aiemmin raportoituihin vaihteluihin.
|
Kolme kuukautta näytteenoton jälkeen
|
|
Tulehduksellisen suolistosairauden yleiset geneettiset variantit
Aikaikkuna: Kolme kuukautta näytteenoton jälkeen
|
Tulokset tutkimukseen osallistuneiden verinäytteiden genominlaajuisesta yhden nukleotidin polymorfismista. Suunniteltu verrata aiemmin raportoituihin vaihteluihin. |
Kolme kuukautta näytteenoton jälkeen
|
|
Tulehduksellisen suolistosairauden geneettinen riskipisteet
Aikaikkuna: Kolme kuukautta näytteenoton jälkeen
|
Tulokset tutkimukseen osallistuneiden verinäytteiden genominlaajuisesta yhden nukleotidin polymorfismista. Suunniteltu verrata aiemmin raportoituihin vaihteluihin. |
Kolme kuukautta näytteenoton jälkeen
|
|
Jokaisen tutkittavan ulosteen mikrobiomikoostumus
Aikaikkuna: Kolme kuukautta näytteenoton jälkeen
|
Mikrobien monimuotoisuus mitattuna ulosteen mikrobiomien 16S RNA:n sekvensointitiedoista.
|
Kolme kuukautta näytteenoton jälkeen
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Sponsori
Tutkijat
- Päätutkija: Hyo Jong Kim, M.D. PhD, Kyung Hee University Hospital
- Päätutkija: Chang Kyun Lee, M.D. PhD, Kyung Hee University Hospital
Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä
Yleiset julkaisut
- Wellcome Trust Case Control Consortium. Genome-wide association study of 14,000 cases of seven common diseases and 3,000 shared controls. Nature. 2007 Jun 7;447(7145):661-78. doi: 10.1038/nature05911.
- Jostins L, Ripke S, Weersma RK, Duerr RH, McGovern DP, Hui KY, Lee JC, Schumm LP, Sharma Y, Anderson CA, Essers J, Mitrovic M, Ning K, Cleynen I, Theatre E, Spain SL, Raychaudhuri S, Goyette P, Wei Z, Abraham C, Achkar JP, Ahmad T, Amininejad L, Ananthakrishnan AN, Andersen V, Andrews JM, Baidoo L, Balschun T, Bampton PA, Bitton A, Boucher G, Brand S, Buning C, Cohain A, Cichon S, D'Amato M, De Jong D, Devaney KL, Dubinsky M, Edwards C, Ellinghaus D, Ferguson LR, Franchimont D, Fransen K, Gearry R, Georges M, Gieger C, Glas J, Haritunians T, Hart A, Hawkey C, Hedl M, Hu X, Karlsen TH, Kupcinskas L, Kugathasan S, Latiano A, Laukens D, Lawrance IC, Lees CW, Louis E, Mahy G, Mansfield J, Morgan AR, Mowat C, Newman W, Palmieri O, Ponsioen CY, Potocnik U, Prescott NJ, Regueiro M, Rotter JI, Russell RK, Sanderson JD, Sans M, Satsangi J, Schreiber S, Simms LA, Sventoraityte J, Targan SR, Taylor KD, Tremelling M, Verspaget HW, De Vos M, Wijmenga C, Wilson DC, Winkelmann J, Xavier RJ, Zeissig S, Zhang B, Zhang CK, Zhao H; International IBD Genetics Consortium (IIBDGC); Silverberg MS, Annese V, Hakonarson H, Brant SR, Radford-Smith G, Mathew CG, Rioux JD, Schadt EE, Daly MJ, Franke A, Parkes M, Vermeire S, Barrett JC, Cho JH. Host-microbe interactions have shaped the genetic architecture of inflammatory bowel disease. Nature. 2012 Nov 1;491(7422):119-24. doi: 10.1038/nature11582.
- Thia KT, Loftus EV Jr, Sandborn WJ, Yang SK. An update on the epidemiology of inflammatory bowel disease in Asia. Am J Gastroenterol. 2008 Dec;103(12):3167-82. doi: 10.1111/j.1572-0241.2008.02158.x.
- Lashner BA, Evans AA, Kirsner JB, Hanauer SB. Prevalence and incidence of inflammatory bowel disease in family members. Gastroenterology. 1986 Dec;91(6):1396-400. doi: 10.1016/0016-5085(86)90193-9.
- Stittrich AB, Ashworth J, Shi M, Robinson M, Mauldin D, Brunkow ME, Biswas S, Kim JM, Kwon KS, Jung JU, Galas D, Serikawa K, Duerr RH, Guthery SL, Peschon J, Hood L, Roach JC, Glusman G. Genomic architecture of inflammatory bowel disease in five families with multiple affected individuals. Hum Genome Var. 2016 Jan 7;3:15060. doi: 10.1038/hgv.2015.60. eCollection 2016.
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Ensisijainen valmistuminen (Todellinen)
Opintojen valmistuminen (Todellinen)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Avainsanat
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- Familial_IBD_Microbiome
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
IPD-suunnitelman kuvaus
Tulosten julkaisemisen jälkeen muiden tutkijoiden kaikki tiedonjakopyynnöt otetaan huomioon.
Mutta jakamisen laajuutta ei ole vielä päätetty.
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .
Kliiniset tutkimukset Tulehdukselliset suolistosairaudet
-
Ankara Etlik City HospitalAktiivinen, ei rekrytointiPan Immune Inflammatory Indexin ja endometrioosin ja endometrioosin vaiheiden välinen suhdeTurkki