Mikrobiom og genetisk analyse av familiær IBD
Mikrobiom og genetisk analyse av familiemedlemmer med inflammatorisk tarmsykdom
Inflammatorisk tarmsykdom (IBD) er en kronisk betennelsestilstand i mage-tarmkanalen.
Når det gjelder patogenesen, har det vært en rekke studier for å avdekke den komplekse sammenhengen mellom genetiske og miljømessige faktorer.
I Korea vokser forekomsten av IBD raskt, men genetiske studier som utelukkende inkluderte pasienter med koreansk avstamning var ikke tilstrekkelig nok.
Derfor planla etterforskerne å utføre genetisk og fekal mikrobiell analyse for de 60 individene fra 30 koreanske IBD-familier for å finne ut patogenesen til IBD.
Studieoversikt
Status
Forhold
Detaljert beskrivelse
Under hypotesen om at flere risikovarianter vil bli observert blant den familiære IBD-pasienten enn hos IBD-pasienter uten noen andre berørte familiemedlemmer, designet etterforskerne genetisk og fekal mikrobiomanalyse for 60 pasienter fra 30 familier.
Etter å ha ekstrahert DNA fra blodprøver, vil helgenomsekvensering bli utført og data vil bli sammenlignet med tidligere rapporterte varianser. Nye varianser eller forekomst av spesifikke varianser vil bli målt.
Genomomfattende enkeltnukleotidpolymorfismearray ved bruk av Immunochip vil bli utført for å søke etter vanlige genetiske varianter og for å beregne genetisk risikoscore for IBD.
I denne studien er fekalt mikrobiom en surrogatmarkør for det miljømessige aspektet ved patogenesen av IBD. Etterforskerne antok at familiemedlemmer deler lignende livsstil, derfor antas vi at deres fekale mikrobielle sammensetning er lik.
Ved å sammenligne genetiske og mikrobielle data totalt med data fra upåvirket familiemedlem (sunn internkontroll), forventer etterforskere å forklare det genetiske og miljømessige aspektet ved IBD-patogenesen.
Studietype
Registrering (Faktiske)
Kontakter og plasseringer
Studiesteder
-
-
-
Seoul, Korea, Republikken, 180-702
- Kyung Hee University Medical Center
-
-
Deltakelseskriterier
Kvalifikasjonskriterier
Alder som er kvalifisert for studier
- Barn
- Voksen
- Eldre voksen
Tar imot friske frivillige
Kjønn som er kvalifisert for studier
Prøvetakingsmetode
Studiepopulasjon
Etterforskerne er planlagt å studere familiemedlemmer med IBD (Crohns sykdom eller ulcerøs kolitt).
De er alle av koreansk avstamning og studiekandidater er to pasienter fra hver 30 familier. Som en sunn internkontroll vil et annet familiemedlem uten IBD-historie også bli registrert.
Beskrivelse
Inklusjonskriterier:
- 60 individer fra 30 familier med Crohns sykdom eller ulcerøs kolitt.
- Upåvirket 30 individer fra hver familie som sunn internkontroll.
Ekskluderingskriterier:
- Person med tidligere bruk av antibiotika eller probiotika i løpet av de siste 4 ukene.
Studieplan
Hvordan er studiet utformet?
Designdetaljer
Hva måler studien?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Sjeldne genetiske varianter av inflammatorisk tarmsykdom
Tidsramme: Tre måneder etter prøvesamlingen
|
Resultater fra helgenomsekvensering av blodprøver fra studiedeltakere.
Planlagt å sammenligne med tidligere rapporterte avvik.
|
Tre måneder etter prøvesamlingen
|
|
Vanlige genetiske varianter av inflammatorisk tarmsykdom
Tidsramme: Tre måneder etter prøvesamlingen
|
Resultater fra genom-omfattende enkelt nukleotid polymorfisme rekke blodprøver fra studiedeltakere. Planlagt å sammenligne med tidligere rapporterte avvik. |
Tre måneder etter prøvesamlingen
|
|
Genetisk risikoscore for inflammatorisk tarmsykdom
Tidsramme: Tre måneder etter prøvesamlingen
|
Resultater fra genom-omfattende enkelt nukleotid polymorfisme rekke blodprøver fra studiedeltakere. Planlagt å sammenligne med tidligere rapporterte avvik. |
Tre måneder etter prøvesamlingen
|
|
Fekal mikrobiom sammensetning av hvert studieemner
Tidsramme: Tre måneder etter prøvesamlingen
|
Mikrobiell mangfold målt fra 16S RNA-sekvenseringsdata fra fekale mikrobiomer.
|
Tre måneder etter prøvesamlingen
|
Samarbeidspartnere og etterforskere
Etterforskere
- Hovedetterforsker: Hyo Jong Kim, M.D. PhD, Kyung Hee University Hospital
- Hovedetterforsker: Chang Kyun Lee, M.D. PhD, Kyung Hee University Hospital
Publikasjoner og nyttige lenker
Generelle publikasjoner
- Wellcome Trust Case Control Consortium. Genome-wide association study of 14,000 cases of seven common diseases and 3,000 shared controls. Nature. 2007 Jun 7;447(7145):661-78. doi: 10.1038/nature05911.
- Jostins L, Ripke S, Weersma RK, Duerr RH, McGovern DP, Hui KY, Lee JC, Schumm LP, Sharma Y, Anderson CA, Essers J, Mitrovic M, Ning K, Cleynen I, Theatre E, Spain SL, Raychaudhuri S, Goyette P, Wei Z, Abraham C, Achkar JP, Ahmad T, Amininejad L, Ananthakrishnan AN, Andersen V, Andrews JM, Baidoo L, Balschun T, Bampton PA, Bitton A, Boucher G, Brand S, Buning C, Cohain A, Cichon S, D'Amato M, De Jong D, Devaney KL, Dubinsky M, Edwards C, Ellinghaus D, Ferguson LR, Franchimont D, Fransen K, Gearry R, Georges M, Gieger C, Glas J, Haritunians T, Hart A, Hawkey C, Hedl M, Hu X, Karlsen TH, Kupcinskas L, Kugathasan S, Latiano A, Laukens D, Lawrance IC, Lees CW, Louis E, Mahy G, Mansfield J, Morgan AR, Mowat C, Newman W, Palmieri O, Ponsioen CY, Potocnik U, Prescott NJ, Regueiro M, Rotter JI, Russell RK, Sanderson JD, Sans M, Satsangi J, Schreiber S, Simms LA, Sventoraityte J, Targan SR, Taylor KD, Tremelling M, Verspaget HW, De Vos M, Wijmenga C, Wilson DC, Winkelmann J, Xavier RJ, Zeissig S, Zhang B, Zhang CK, Zhao H; International IBD Genetics Consortium (IIBDGC); Silverberg MS, Annese V, Hakonarson H, Brant SR, Radford-Smith G, Mathew CG, Rioux JD, Schadt EE, Daly MJ, Franke A, Parkes M, Vermeire S, Barrett JC, Cho JH. Host-microbe interactions have shaped the genetic architecture of inflammatory bowel disease. Nature. 2012 Nov 1;491(7422):119-24. doi: 10.1038/nature11582.
- Thia KT, Loftus EV Jr, Sandborn WJ, Yang SK. An update on the epidemiology of inflammatory bowel disease in Asia. Am J Gastroenterol. 2008 Dec;103(12):3167-82. doi: 10.1111/j.1572-0241.2008.02158.x.
- Lashner BA, Evans AA, Kirsner JB, Hanauer SB. Prevalence and incidence of inflammatory bowel disease in family members. Gastroenterology. 1986 Dec;91(6):1396-400. doi: 10.1016/0016-5085(86)90193-9.
- Stittrich AB, Ashworth J, Shi M, Robinson M, Mauldin D, Brunkow ME, Biswas S, Kim JM, Kwon KS, Jung JU, Galas D, Serikawa K, Duerr RH, Guthery SL, Peschon J, Hood L, Roach JC, Glusman G. Genomic architecture of inflammatory bowel disease in five families with multiple affected individuals. Hum Genome Var. 2016 Jan 7;3:15060. doi: 10.1038/hgv.2015.60. eCollection 2016.
Studierekorddatoer
Studer hoveddatoer
Studiestart (Faktiske)
Primær fullføring (Faktiske)
Studiet fullført (Faktiske)
Datoer for studieregistrering
Først innsendt
Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene
Først lagt ut (Faktiske)
Oppdateringer av studieposter
Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)
Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene
Sist bekreftet
Mer informasjon
Begreper knyttet til denne studien
Nøkkelord
Ytterligere relevante MeSH-vilkår
Andre studie-ID-numre
- Familial_IBD_Microbiome
Plan for individuelle deltakerdata (IPD)
Planlegger du å dele individuelle deltakerdata (IPD)?
IPD-planbeskrivelse
Etter å ha publisert resultatene, vil enhver forespørsel om datadeling fra andre forskere bli positivt vurdert.
Men omfanget av deling er ikke bestemt ennå.
Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter
Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt
Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt
Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .
Kliniske studier på Inflammatoriske tarmsykdommer
-
University of ArkansasAvsluttetPediatriske pasienter med SIRS (Systemic Inflammatory Response Syndrome)Forente stater
-
Arkansas Children's Hospital Research InstituteEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human Development...AvsluttetSIRS (Systemic Inflammatory Response Syndrome)Forente stater
-
Chinese PLA General HospitalFullførtSepsis | SIRS (Systemic Inflammatory Response Syndrome)Kina
-
Chinese PLA General HospitalUkjentSepsis | SIRS (Systemic Inflammatory Response Syndrome)Kina
-
Seoul National University HospitalUkjentSunn | Kronisk forstoppelse | Constipated Irritable Bowel Syndrome
-
Istanbul UniversityFullførtBetennelse | Type 2 diabetes | Medisinsk ernæringsterapi | Dietary inflammatory Index (DII)Tyrkia