Pitkän koodaamattoman RNA:n CCAT1:n arviointi kolorektaalisyöpäpotilailla

Kolorektaalisyöpä (CRC) on kolmanneksi yleisimmin diagnosoitu syöpä ja neljänneksi suurin syöpäkuolleisuuden syy maailmanlaajuisesti. Kolorektaalisyöpä on Egyptin seitsemänneksi yleisin syöpä, ja se edustaa 3,47 prosenttia miesten syövistä ja 3 prosenttia naisten syövistä. Syövän etäpesäkkeet maksassa, joita kehittyy 50 %:lla CRC-potilaista, on näiden potilaiden suurin kuolinsyy.

CRC voidaan parantaa helposti leikkauksella, jos se havaitaan ja diagnosoidaan varhain. Vaikka syövän seulonnassa on viime vuosina edistytty paljon, paksusuolensyövän ennuste on edelleen huono. Kolonoskopia on tavallinen seulontamenetelmä varhaisen CRC:n havaitsemiseksi.

Lisäksi muilla CRC-seulontatesteillä (kuten sigmoidoskopia, ulosteveritesti (FOBT), kasvainmarkkerit, ulosteen immunokemiallinen testi (FIT) ja radiologiset testit) on alhainen herkkyys ja spesifisyys tai korkeat kustannukset. Siksi on olemassa suuri tarve ei-invasiivisille ja tarkille biomarkkereille CRC:n havaitsemiseksi.

Fysiologisiin riskitekijöihin keskittyen geneettiset muutokset voivat johtua ulkoisista vaikutuksista, kuten kemikaaleista, säteilystä sekä taudinaiheuttajista (viruksista), jotka häiritsevät genomin vakautta. Laajojen tutkimusten lisäksi DNA-vaurioista solusyklin säätelyssä viime vuosikymmenet ovat osoittaneet ei-koodaavien RNA:iden (ncRNA:iden) roolin kasvainbiologian yhteydessä. Proteiinia koodaamattomien RNA:iden olemassaolo tiedettiin vuosien ajan, jolloin näiden RNA:iden biologiset toiminnot on paljastettu progressiivisilla tutkimuksilla. Ei-koodaavilla RNA:illa on lisäluokituksia, joiden joukossa mikro-RNA:iden (miRNA:iden) toimintoja on tutkittu perusteellisesti. Siten toisen tyyppisen ncRNA:n, pitkien ei-koodaavien RNA:iden (lncRNA:iden) keskittyminen on vielä nouseva ala syöpäbiologian tutkimuksessa. Osa genomista sisältää nämä lncRNA:t, jotka ovat itse asiassa huonosti transloituneita muihin proteiineja koodaaviin vastineisiin verrattuna.

LncRNA:t ovat yli 200 emäsparin pituisia transkriptioita. Niillä on tärkeitä rooleja soluprosesseissa, kuten transkription säätelyssä, kromosomien uudelleenmuodostumisessa, translaation jälkeisissä modifikaatioissa ja niiden häiriöt voivat johtaa sairaustiloihin.

Paksusuolisyöpään liittyvä transkripti-1 (CCAT1) on johdonmukaisesti säädelty useissa pahanlaatuisissa kasvaimissa, mukaan lukien mahalaukun syöpä, paksusuolensyöpä, sappirakkosyöpä ja hepatosellulaarinen karsinooma, ja se liittyy patogeneesiin.

CCAT1 tunnistettiin alun perin paksusuolen syövässä Zhao (2016), joka osoitti, että CCAT1:n korkeaa ilmentymistä CRC-plasmassa voidaan käyttää ennustavana biomarkkerina CRC:n seulonnassa.

CCAT1:n säätelemätön ilmentyminen ei vaikuta vain tuumorigeneesiin, vaan myös kliinisiin ilmenemismuotoihin, kuten kasvaimen kokoon, imusolmukkeiden etäpesäkkeisiin, TNM-vaiheeseen, erilaistumiseen, invaasioon, potilaan eloonjäämiseen ja hoitotulokseen. Tämä havainto tekee CCAT1:stä houkuttelevan kohteena terapeuttiselle interventiolle syövän hoidossa. Nykyiset saatavilla olevat tutkimukset CCAT1:n ilmentymisestä, kliinisestä merkityksestä, biologisesta käyttäytymisestä ja säätelymekanismista eri syövissä on kuvattu. Lisäksi on keskusteltu CCAT1:n mahdollisista rooleista syöpien diagnosoinnissa, prognostisessa arvioinnissa ja hoidossa.