Vurdering av lang ikke-kodende RNA CCAT1 hos kolorektal kreftpasienter

Kolorektal kreft (CRC) er den tredje hyppigst diagnostiserte kreften og den fjerde ledende årsaken til kreftdødelighet på verdensbasis. Kolorektal kreft er den syvende vanligste kreftformen i Egypt, og representerer 3,47 % av mannlige krefttilfeller og 3 % av kvinnelige krefttilfeller. Kreftmetastaser i leveren, som utvikler seg hos 50 % av CRC-pasientene, representerer den viktigste dødsårsaken hos disse pasientene.

CRC kan lett kureres med kirurgi, hvis det oppdages og diagnostiseres tidlig. Selv om det de siste årene har blitt oppnådd mye fremgang i screening for kreft, er prognosen for tykktarmskreft fortsatt dårlig. Koloskopi er standard screeningsmetode for å oppdage tidlig CRC.

Dessuten har de andre CRC-screeningtestene (som sigmoidoskopi, fekalokult blodprøve (FOBT), tumormarkører, fekal immunokjemisk test (FIT) og radiologiske tester) lav sensitivitet og spesifisitet eller høye kostnader. Derfor er det et stort behov for ikke-invasive og nøyaktige biomarkører for påvisning av CRC.

Med fokus på de fysiologiske risikofaktorene, kan genetiske endringer skyldes ytre påvirkninger som kjemikalier, stråling samt patogener (virus) som forstyrrer genomets stabilitet. Foruten omfattende studier på DNA-skader i cellesyklusregulering, har de siste tiårene tydeliggjort rollen til ikke-kodende RNA-er (ncRNA-er) i sammenheng med tumorbiologi. Eksistensen av ikke-proteinkodende RNA-er var kjent over år, der biologiske funksjoner til disse RNA-ene har blitt avdekket ved progressive undersøkelser. Ikke-kodende RNA-er har ytterligere klassifiseringer, blant annet er funksjonene til mikro-RNA-er (miRNA-er) blitt grundig utforsket. Dermed er konsentrasjonen på den andre typen ncRNA, de lange ikke-kodende RNA-ene (lncRNA-er), et ennå fremvoksende felt innen forskning på kreftbiologi. En brøkdel av genomet omfatter disse lncRNA-ene som faktisk er dårlig oversatt sammenlignet med andre proteinkodende motstykker.

LncRNA er transkripsjoner på lengre enn 200 bp. De har viktige roller i cellulære prosesser som transkripsjonsregulering, kromosomremodellering, post-translasjonelle modifikasjoner og forstyrrelser i dem kan føre til sykdomstilstander.

Tykktarmskreftassosiert transkript-1 (CCAT1) er konsekvent oppregulert i og er assosiert med patogenesen av en rekke maligniteter, inkludert gastrisk karsinom, tykktarmskreft, galleblærekreft og hepatocellulært karsinom.

CCAT1 ble først identifisert i tykktarmskreft Zhao (2016), som demonstrerte at høy ekspresjon av CCAT1 i CRC-plasma kan brukes som prediktiv biomarkør for screening av CRC.

Det dysregulerte uttrykket av CCAT1 påvirker ikke bare tumorigenese, men også klinisk manifestasjon, som tumorstørrelse, lymfeknutemetastase, TNM-stadium, differensiering, invasjon, pasientoverlevelse og behandlingsresultat. Dette funnet gjør CCAT1 attraktivt som mål for terapeutisk intervensjon ved kreft. De nåværende tilgjengelige studiene av uttrykket, klinisk relevans, biologisk oppførsel og reguleringsmekanisme til CCAT1 i forskjellige kreftformer er beskrevet. Dessuten har de potensielle rollene til CCAT1 i diagnostisering, prognostisk evaluering og behandling av kreft blitt diskutert.