- ICH GCP
- Yhdysvaltain kliinisten tutkimusten rekisteri
- Kliininen tutkimus NCT04910360
Embolism in COVID-19 Positive Patients
Examining the Genetic Predisposition of Individuals Who Aggravated by Embolism in COVID-19 Positive Patients
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Yksityiskohtainen kuvaus
This study has conducted to find the possible links between genetic make up of ICU patients with severe Covid-19 and embolism. 13 polymorphisms and mutations that the investigators targeted are located on Factor II, Factor V, Factor XIII, MTHFR, angiotensin converting enzyme (ACE), endothelial cell protein C receptor (EPCR), and FGB. The investigators have found significant changes in the mutant allele frequencies in most of the factors.
The main workflow to study a point change on DNA sequence begins with DNA isolation from a biological material. In this case, we received blood samples in ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA) tubes from ICU patients with severe Covid-19. The investigators hypothesis claims that genetic factors triggering thrombotic events might increase the severity of the diseases by inducing the risk of emboli.
After DNA isolation, desired loci on DNA were amplified via Polymerase Chain Reaction (PCR). Amplicons including the mutations and polymorphisms need to be purified before next generation sequencing (NGS).
The investigators analyze the data using Integrative Genomics Viewer (IGV) program and check the genetic profile (wt, het, mut). Some of the changes are meaningful by themselves while some other need to be considered as combinations. Compound heterozygosity and diagnosis for thrombophilia require cooccurrence of the changes.
To compare allelic frequencies, the investigators include the average of the data coming from more than 2000 individuals with no know thrombophilia cases. In the investigators focus cohort, the investigators have the data of 47 Covid-19 patients in ICU.
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Odotettu)
Yhteystiedot ja paikat
Opiskelupaikat
-
-
Cankaya
-
Ankara, Cankaya, Turkki, 06510
- INTERGEN Genetics and Rare Diseases Diagnosis Research & Application Center
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Sukupuolet, jotka voivat opiskella
Näytteenottomenetelmä
Tutkimusväestö
Groups were assigned to determine the genetic factors that explain severity of COVID-19 infections. These genetic factors play role in thrombotic events in the body.
Case group involves ICU patients with emboli that suffer from severe COVID-19. The investigators expect to see some deviations from normal population regarding the mutations and polymorphisms related to thrombophilia. Control group is normal population representing the normal allelic frequencies of the determinant genetic factors.
Kuvaus
Inclusion Criteria:
- being tested positive for Covid-19
- ICU patients developing severe pneumonia upon Covid-19 infection
Exclusion Criteria:
- previously tested positive for genetic factors increasing thrombosis risk
- ICU patients developing severe emboli regardless of Covid-19 infection
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
---|
ICU patients with severe COVID-19 pneumonia
Without using any intervention, this group has been included in the study to research certain genetic dispositions determining the severity of the COVID-19 pneumonia
|
Random population
This group has been included as a control group to compare the genetic predisposition of ICU patients with severe COVID-19 pneumonia with the normal population.
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
---|---|---|
Changes in allelic frequencies in predetermined loci which are known to be related with thrombosis
Aikaikkuna: 15.03.2021- 30.04.2021
|
In the first 28 samples the investigators received, we expected a predictive result revealing the genetic background and embolism in Covid-19.
Deviations from allelic frequencies of healthy population regarding some of the factors will support the hypothesis of the study.
|
15.03.2021- 30.04.2021
|
An increase in thrombophilia cases in the study group
Aikaikkuna: 01.05.2021- 20.05.2021
|
Thrombophilia is a complex state with the contribution of several factors.
Clinical picture and the mutations enable the diagnosis.
With an expanded study group consisting of 47 patients, we determined the patients with thrombophilia.
|
01.05.2021- 20.05.2021
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Tutkijat
- Opintojohtaja: Serdar Ceylaner, Assoc. Prof., INTERGEN Genetics and Rare Diseases Diagnosis Research & Application Center
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Ensisijainen valmistuminen (Todellinen)
Opintojen valmistuminen (Odotettu)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Avainsanat
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
- Patologiset prosessit
- Sydän-ja verisuonitaudit
- Verisuonisairaudet
- Koronavirusinfektiot
- Coronaviridae-infektiot
- Nidovirales-infektiot
- RNA-virusinfektiot
- Virussairaudet
- Infektiot
- Hengitysteiden infektiot
- Hengityselinten sairaudet
- Keuhkokuume, virus
- Keuhkokuume
- Keuhkosairaudet
- Sairauden ominaisuudet
- Embolia ja tromboosi
- COVID-19
- Embolia
- Tautialttius
- Geneettinen alttius sairauksille
Muut tutkimustunnusnumerot
- 2021-1
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .